Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G130200.1,Sobic.007G130200.5,Sobic.007G130200.3,Sobic.007G130200.4,Sobic.007G130200.7,Sobic.007G130200.6,Sobic.007G130200.8,Sobic.007G130200.11,Sobic.007G130200.10,Sobic.007G130200.2,Sobic.007G130200.12,Sobic.007G130200.9
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R9N0 , A0A1Z5RAI2 , A0A1Z5RAJ0 , A0A1Z5R9L0 , A0A1Z5R9K5 , A0A1B6PHL8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g44200.1 : retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G173201 - -
2 Sobic.001G271100 basic helix-loop-helix, putative, expressed -
3 Sobic.010G164350 - -
4 Sobic.010G120700 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
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6 Sobic.008G055366 - -
7 Sobic.008G055432 - -
8 Sobic.007G226600 homeobox associated leucine zipper, putative, expressed K09338: homeobox-leucine zipper protein
9 Sobic.010G068200 flavonol synthase/flavanone 3-hydroxylase, putative, expressed -
10 Sobic.004G233300 - -
11 Sobic.005G043800 transporter family protein, putative, expressed -
12 Sobic.009G147400 ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed -
13 Sobic.010G128500 - -
14 Sobic.002G097900 expressed protein -
15 Sobic.010G139301 - -
16 Sobic.006G253400 expressed protein -
17 Sobic.007G089600 OsGrx_S15.1 - glutaredoxin subgroup II, expressed -
18 Sobic.006G048700 "fatty acid desaturase, up-regulated under severe drought stress"(PubMedID : 24655390)@Acyl-acyl-carrier-protein desaturase (Os)(PubMedID : 27208977)@acyl-desaturase, chloroplast precursor, putative, expressed K03921: FAB2, SSI2, acyl-[acyl-carrier-protein] desaturase
19 Sobic.005G001900 - -
20 Sobic.002G124200 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic007G130200 Sobic007G130200 Sobic010G173201 Sobic010G173201 Sobic007G130200--Sobic010G173201 Sobic001G271100 Sobic001G271100 Sobic007G130200--Sobic001G271100 Sobic010G164350 Sobic010G164350 Sobic007G130200--Sobic010G164350 Sobic010G120700 Sobic010G120700 Sobic007G130200--Sobic010G120700 Sobic010G119500 Sobic010G119500 Sobic007G130200--Sobic010G119500 Sobic008G055366 Sobic008G055366 Sobic007G130200--Sobic008G055366 Sobic008G055432 Sobic008G055432 Sobic007G130200--Sobic008G055432 Sobic007G226600 Sobic007G226600 Sobic007G130200--Sobic007G226600 Sobic010G068200 Sobic010G068200 Sobic007G130200--Sobic010G068200 Sobic010G173201--Sobic010G068200 Sobic010G173201--Sobic010G120700 Sobic010G173201--Sobic010G164350 Sobic010G173201--Sobic001G271100 Sobic004G196500 Sobic004G196500 Sobic010G173201--Sobic004G196500 Sobic010G173201--Sobic008G055432 Sobic010G173201--Sobic007G130200 Sobic010G057700 Sobic010G057700 Sobic010G173201--Sobic010G057700 Sobic007G129401 Sobic007G129401 Sobic010G173201--Sobic007G129401 Sobic001G271100--Sobic010G164350 Sobic005G043800 Sobic005G043800 Sobic001G271100--Sobic005G043800 Sobic001G271100--Sobic010G173201 Sobic001G271100--Sobic010G120700 Sobic010G128500 Sobic010G128500 Sobic001G271100--Sobic010G128500 Sobic001G271100--Sobic008G055432 Sobic001G271100--Sobic007G130200 Sobic006G045700 Sobic006G045700 Sobic001G271100--Sobic006G045700 Sobic001G271100--Sobic010G068200 Sobic010G164350--Sobic001G271100 Sobic010G164350--Sobic005G043800 Sobic010G164350--Sobic010G173201 Sobic004G132150 Sobic004G132150 Sobic010G164350--Sobic004G132150 Sobic001G261480 Sobic001G261480 Sobic010G164350--Sobic001G261480 Sobic010G164350--Sobic006G045700 Sobic010G164350--Sobic008G055432 Sobic010G164350--Sobic010G120700 Sobic004G233300 Sobic004G233300 Sobic010G164350--Sobic004G233300 Sobic010G120700--Sobic010G173201 Sobic010G120700--Sobic010G068200 Sobic005G173366 Sobic005G173366 Sobic010G120700--Sobic005G173366 Sobic010G120700--Sobic008G055366 Sobic010G120700--Sobic008G055432 Sobic003G416100 Sobic003G416100 Sobic010G120700--Sobic003G416100 Sobic010G120700--Sobic007G129401 Sobic010G120700--Sobic004G196500 Sobic010G120700--Sobic010G164350 Sobic002G417800 Sobic002G417800 Sobic010G119500--Sobic002G417800 Sobic010G119500--Sobic010G173201 Sobic010G119500--Sobic007G130200 Sobic004G149600 Sobic004G149600 Sobic010G119500--Sobic004G149600 Sobic010G119500--Sobic001G271100 Sobic010G119500--Sobic007G226600 Sobic010G119500--Sobic008G055366 Sobic001G167200 Sobic001G167200 Sobic010G119500--Sobic001G167200 Sobic004G010151 Sobic004G010151 Sobic010G119500--Sobic004G010151 Sobic008G055366--Sobic008G055432 Sobic008G055366--Sobic010G120700 Sobic007G071950 Sobic007G071950 Sobic008G055366--Sobic007G071950 Sobic001G388250 Sobic001G388250 Sobic008G055366--Sobic001G388250 Sobic008G055366--Sobic010G173201 Sobic007G072000 Sobic007G072000 Sobic008G055366--Sobic007G072000 Sobic008G027000 Sobic008G027000 Sobic008G055366--Sobic008G027000 Sobic005G141801 Sobic005G141801 Sobic008G055366--Sobic005G141801 Sobic003G113200 Sobic003G113200 Sobic008G055366--Sobic003G113200 Sobic008G055432--Sobic008G055366 Sobic008G055432--Sobic007G071950 Sobic008G055432--Sobic005G141801 Sobic001G272532 Sobic001G272532 Sobic008G055432--Sobic001G272532 Sobic005G055150 Sobic005G055150 Sobic008G055432--Sobic005G055150 Sobic010G225226 Sobic010G225226 Sobic008G055432--Sobic010G225226 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic008G055432--Sobic006G009400 Sobic008G055432--Sobic010G057700 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic008G055432--Sobic005G221425 Sobic002G097900 Sobic002G097900 Sobic007G226600--Sobic002G097900 Sobic002G073250 Sobic002G073250 Sobic007G226600--Sobic002G073250 Sobic005G159000 Sobic005G159000 Sobic007G226600--Sobic005G159000 Sobic007G226600--Sobic010G120700 Sobic005G039500 Sobic005G039500 Sobic007G226600--Sobic005G039500 Sobic002G006600 Sobic002G006600 Sobic007G226600--Sobic002G006600 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic007G226600--Sobic001G111900 Sobic004G326200 Sobic004G326200 Sobic007G226600--Sobic004G326200 Sobic008G015500 Sobic008G015500 Sobic007G226600--Sobic008G015500 Sobic010G068200--Sobic010G173201 Sobic010G068200--Sobic007G129401 Sobic010G068200--Sobic004G196500 Sobic010G068200--Sobic010G120700 Sobic010G068200--Sobic005G173366 Sobic009G026400 Sobic009G026400 Sobic010G068200--Sobic009G026400 Sobic005G043400 Sobic005G043400 Sobic010G068200--Sobic005G043400 Sobic010G068200--Sobic003G416100 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic010G068200--Sobic002G060500
Octagon: transcription factors


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