Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G097900.1
Synonym Sb02g008070
Functional annotation expressed protein
UniProt C5X2S7
Pfam PF08224
Panther DB PTHR33377 PTHR33377:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g02970.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G097900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G226600 homeobox associated leucine zipper, putative, expressed K09338: homeobox-leucine zipper protein
2 Sobic.002G073250 - -
3 Sobic.005G039500 signal recognition particle 54 kDa protein, putative, expressed K03106: SRP54, signal recognition particle subunit SRP54
4 Sobic.003G113200 5-nucleotidase domain-containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.001G067850 - -
6 Sobic.002G402600 pleckstrin homology domain-containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.005G159000 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, putative, expressed -
8 Sobic.005G110200 - -
9 Sobic.010G057700 - -
10 Sobic.003G161000 powdery mildew resistance protein PM3F, putative, expressed -
11 Sobic.008G015500 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K13093: HIV Tat-specific factor 1
12 Sobic.001G016201 - -
13 Sobic.010G068200 flavonol synthase/flavanone 3-hydroxylase, putative, expressed -
14 Sobic.010G173201 - -
15 Sobic.002G031400 OsFBL39 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
16 Sobic.003G429650 - -
17 Sobic.002G006600 -(PubMedID : 26976818)@aminotransferase, classes I and II, domain containing protein, expressed K14272: glutamate--glyoxylate aminotransferase
18 Sobic.005G090401 - -
19 Sobic.008G082100 - -
20 Sobic.009G127400 PAC, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G097900 Sobic002G097900 Sobic007G226600 Sobic007G226600 Sobic002G097900--Sobic007G226600 Sobic002G073250 Sobic002G073250 Sobic002G097900--Sobic002G073250 Sobic005G039500 Sobic005G039500 Sobic002G097900--Sobic005G039500 Sobic003G113200 Sobic003G113200 Sobic002G097900--Sobic003G113200 Sobic001G067850 Sobic001G067850 Sobic002G097900--Sobic001G067850 Sobic002G402600 Sobic002G402600 Sobic002G097900--Sobic002G402600 Sobic005G159000 Sobic005G159000 Sobic002G097900--Sobic005G159000 Sobic005G110200 Sobic005G110200 Sobic002G097900--Sobic005G110200 Sobic010G057700 Sobic010G057700 Sobic002G097900--Sobic010G057700 Sobic007G226600--Sobic002G097900 Sobic007G226600--Sobic002G073250 Sobic007G226600--Sobic005G159000 Sobic010G120700 Sobic010G120700 Sobic007G226600--Sobic010G120700 Sobic007G226600--Sobic005G039500 Sobic002G006600 Sobic002G006600 Sobic007G226600--Sobic002G006600 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic007G226600--Sobic001G111900 Sobic004G326200 Sobic004G326200 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Octagon: transcription factors


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