Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G082100.3
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PCC6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G100516 - -
2 Sobic.005G090401 - -
3 Sobic.004G209600 SWIM zinc finger family protein, putative, expressed -
4 Sobic.004G263600 - K03655: ATP-dependent DNA helicase RecG
5 Sobic.004G096600 - -
6 Sobic.006G182900 expressed protein -
7 Sobic.009G170000 - -
8 Sobic.004G359800 inositol-1-monophosphatase, putative, expressed -
9 Sobic.005G110200 - -
10 Sobic.010G176550 - -
11 Sobic.001G072500 expressed protein K12879: THO complex subunit 2
12 Sobic.010G153201 - -
13 Sobic.002G029900 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
14 Sobic.010G139000 surp module family protein, putative, expressed K13123: G patch domain-containing protein 1
15 Sobic.007G116200 expressed protein K13217: PRPF39, pre-mRNA-processing factor 39
16 Sobic.007G099000 - -
17 Sobic.007G074600 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed K15201: GTP3C3, general transcription factor 3C polypeptide 3 (transcription factor C subunit 4)
18 Sobic.006G131500 serine/threonine-protein kinase GCN2, putative, expressed K16196: eukaryotic translation initiation factor 2-alpha kinase 4
19 Sobic.007G020500 expressed protein K15198: BDP1, transcription factor TFIIIB component B''
20 Sobic.005G072100 preprotein translocase secA family protein, putative, expressed K03070: preprotein translocase subunit SecA


Gene co-expression network
sample Sobic008G082100 Sobic008G082100 Sobic010G100516 Sobic010G100516 Sobic008G082100--Sobic010G100516 Sobic005G090401 Sobic005G090401 Sobic008G082100--Sobic005G090401 Sobic004G209600 Sobic004G209600 Sobic008G082100--Sobic004G209600 Sobic004G263600 Sobic004G263600 Sobic008G082100--Sobic004G263600 Sobic004G096600 Sobic004G096600 Sobic008G082100--Sobic004G096600 Sobic006G182900 Sobic006G182900 Sobic008G082100--Sobic006G182900 Sobic009G170000 Sobic009G170000 Sobic008G082100--Sobic009G170000 Sobic004G359800 Sobic004G359800 Sobic008G082100--Sobic004G359800 Sobic005G110200 Sobic005G110200 Sobic008G082100--Sobic005G110200 Sobic010G100516--Sobic008G082100 Sobic010G100516--Sobic004G263600 Sobic001G072500 Sobic001G072500 Sobic010G100516--Sobic001G072500 Sobic006G036566 Sobic006G036566 Sobic010G100516--Sobic006G036566 Sobic007G111400 Sobic007G111400 Sobic010G100516--Sobic007G111400 Sobic010G153201 Sobic010G153201 Sobic010G100516--Sobic010G153201 Sobic004G025800 Sobic004G025800 Sobic010G100516--Sobic004G025800 Sobic006G055200 Sobic006G055200 Sobic010G100516--Sobic006G055200 Sobic002G097700 Sobic002G097700 Sobic010G100516--Sobic002G097700 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic005G090401--Sobic004G007100 Sobic005G090401--Sobic006G182900 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic005G090401--Sobic006G048500 Sobic006G048600 Sobic006G048600 Sobic005G090401--Sobic006G048600 Sobic002G173000 Sobic002G173000 Sobic005G090401--Sobic002G173000 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic005G090401--Sobic002G243900 Sobic005G090401--Sobic005G110200 Sobic007G161300 Sobic007G161300 Sobic005G090401--Sobic007G161300 Sobic005G032800 Sobic005G032800 Sobic005G090401--Sobic005G032800 Sobic010G139000 Sobic010G139000 Sobic004G209600--Sobic010G139000 Sobic004G314000 Sobic004G314000 Sobic004G209600--Sobic004G314000 Sobic010G010700 Sobic010G010700 Sobic004G209600--Sobic010G010700 Sobic007G117400 Sobic007G117400 Sobic004G209600--Sobic007G117400 Sobic005G008800 Sobic005G008800 Sobic004G209600--Sobic005G008800 Sobic002G134200 Sobic002G134200 Sobic004G209600--Sobic002G134200 Sobic005G112300 Sobic005G112300 Sobic004G209600--Sobic005G112300 Sobic004G242400 Sobic004G242400 Sobic004G209600--Sobic004G242400 Sobic003G280800 Sobic003G280800 Sobic004G209600--Sobic003G280800 Sobic007G193700 Sobic007G193700 Sobic004G263600--Sobic007G193700 Sobic004G174200 Sobic004G174200 Sobic004G263600--Sobic004G174200 Sobic001G194200 Sobic001G194200 Sobic004G263600--Sobic001G194200 Sobic004G263600--Sobic006G055200 Sobic004G291900 Sobic004G291900 Sobic004G263600--Sobic004G291900 Sobic005G001000 Sobic005G001000 Sobic004G263600--Sobic005G001000 Sobic008G001200 Sobic008G001200 Sobic004G263600--Sobic008G001200 Sobic004G263600--Sobic001G072500 Sobic004G023000 Sobic004G023000 Sobic004G263600--Sobic004G023000 Sobic001G036050 Sobic001G036050 Sobic004G096600--Sobic001G036050 Sobic004G096600--Sobic006G182900 Sobic004G096600--Sobic010G139000 Sobic001G456900 Sobic001G456900 Sobic004G096600--Sobic001G456900 Sobic010G279450 Sobic010G279450 Sobic004G096600--Sobic010G279450 Sobic004G096600--Sobic004G209600 Sobic007G116200 Sobic007G116200 Sobic004G096600--Sobic007G116200 Sobic003G429650 Sobic003G429650 Sobic004G096600--Sobic003G429650 Sobic006G216800 Sobic006G216800 Sobic004G096600--Sobic006G216800 Sobic006G182900--Sobic003G429650 Sobic006G182900--Sobic006G048500 Sobic007G161000 Sobic007G161000 Sobic006G182900--Sobic007G161000 Sobic001G365900 Sobic001G365900 Sobic006G182900--Sobic001G365900 Sobic006G182900--Sobic007G116200 Sobic006G182900--Sobic004G096600 Sobic006G182900--Sobic002G134200 Sobic001G214300 Sobic001G214300 Sobic006G182900--Sobic001G214300 Sobic009G209300 Sobic009G209300 Sobic006G182900--Sobic009G209300 Sobic010G176550 Sobic010G176550 Sobic009G170000--Sobic010G176550 Sobic001G227200 Sobic001G227200 Sobic009G170000--Sobic001G227200 Sobic001G261573 Sobic001G261573 Sobic009G170000--Sobic001G261573 Sobic009G170000--Sobic009G209300 Sobic002G343901 Sobic002G343901 Sobic009G170000--Sobic002G343901 Sobic009G170000--Sobic001G036050 Sobic003G254000 Sobic003G254000 Sobic009G170000--Sobic003G254000 Sobic004G208900 Sobic004G208900 Sobic009G170000--Sobic004G208900 Sobic009G170000--Sobic010G139000 Sobic004G359800--Sobic007G116200 Sobic002G169633 Sobic002G169633 Sobic004G359800--Sobic002G169633 Sobic003G138500 Sobic003G138500 Sobic004G359800--Sobic003G138500 Sobic004G359800--Sobic002G134200 Sobic004G359800--Sobic003G280800 Sobic004G359800--Sobic010G139000 Sobic004G359800--Sobic006G182900 Sobic004G359800--Sobic010G176550 Sobic002G127550 Sobic002G127550 Sobic004G359800--Sobic002G127550 Sobic005G110300 Sobic005G110300 Sobic005G110200--Sobic005G110300 Sobic005G110200--Sobic002G134200 Sobic005G110200--Sobic007G116200 Sobic008G185300 Sobic008G185300 Sobic005G110200--Sobic008G185300 Sobic005G110200--Sobic005G090401 Sobic005G110200--Sobic006G182900 Sobic005G110200--Sobic003G280800 Sobic005G110200--Sobic005G032800 Sobic006G032500 Sobic006G032500 Sobic005G110200--Sobic006G032500
Octagon: transcription factors


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