Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G100516.1,Sobic.010G100516.2
Synonym -
Functional annotation -
UniProt C5Z7K0 , A0A1W0VS94
Pfam PF14929
Panther DB PTHR36720
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G53200 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g13570.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a042647
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G082100 - -
2 Sobic.004G263600 - K03655: ATP-dependent DNA helicase RecG
3 Sobic.001G072500 expressed protein K12879: THO complex subunit 2
4 Sobic.006G036566 - -
5 Sobic.007G111400 - -
6 Sobic.010G153201 - -
7 Sobic.004G025800 phosphoribosyl transferase, putative, expressed K00948: PRPS, ribose-phosphate pyrophosphokinase
8 Sobic.006G055200 RNA-binding motif protein, putative, expressed K13192: RNA-binding protein 26
9 Sobic.002G097700 expressed protein -
10 Sobic.005G075100 rp3 protein, putative, expressed -
11 Sobic.002G169633 - -
12 Sobic.004G291900 ESP4, putative, expressed K06100: symplekin
13 Sobic.010G141966 - -
14 Sobic.004G334300 ATMAK10, putative, expressed -
15 Sobic.008G001200 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.005G110200 - -
17 Sobic.007G193700 Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein, putative, expressed -
18 Sobic.010G239600 RNA polymerase I specific transcription initiation factor RRN3 family protein, putative, expressed K15216: RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3
19 Sobic.003G381200 KH domain containing protein, putative, expressed K14945: protein quaking
20 Sobic.003G190000 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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