Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G036566.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RBZ4
Pfam PF03004
Panther DB PTHR33063
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g14500.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G100516 - -
2 Sobic.002G033300 expressed protein -
3 Sobic.004G263600 - K03655: ATP-dependent DNA helicase RecG
4 Sobic.005G075100 rp3 protein, putative, expressed -
5 Sobic.003G190000 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.002G345700 insulin-degrading enzyme, putative, expressed K01408: IDE, insulysin
7 Sobic.002G212500 expressed protein -
8 Sobic.010G239600 RNA polymerase I specific transcription initiation factor RRN3 family protein, putative, expressed K15216: RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3
9 Sobic.001G072500 expressed protein K12879: THO complex subunit 2
10 Sobic.002G124600 RNA recognition motif family protein, expressed K13094: RNA-binding protein 5/10
11 Sobic.007G111400 - -
12 Sobic.004G291900 ESP4, putative, expressed K06100: symplekin
13 Sobic.007G103100 SWP, putative, expressed K15156: MED14, mediator of RNA polymerase II transcription subunit 14
14 Sobic.009G220500 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
15 Sobic.001G396000 OsPOP7 - Putative Prolyl Oligopeptidase homologue, expressed -
16 Sobic.002G115050 - -
17 Sobic.005G142800 exportin 1, putative, expressed K15436: TRPO3, transportin-3
18 Sobic.006G055200 RNA-binding motif protein, putative, expressed K13192: RNA-binding protein 26
19 Sobic.001G219700 pentatricopeptide, putative, expressed -
20 Sobic.003G205200 expressed protein K19027: zinc finger FYVE domain-containing protein 26


Gene co-expression network
sample Sobic006G036566 Sobic006G036566 Sobic010G100516 Sobic010G100516 Sobic006G036566--Sobic010G100516 Sobic002G033300 Sobic002G033300 Sobic006G036566--Sobic002G033300 Sobic004G263600 Sobic004G263600 Sobic006G036566--Sobic004G263600 Sobic005G075100 Sobic005G075100 Sobic006G036566--Sobic005G075100 Sobic003G190000 Sobic003G190000 Sobic006G036566--Sobic003G190000 Sobic002G345700 Sobic002G345700 Sobic006G036566--Sobic002G345700 Sobic002G212500 Sobic002G212500 Sobic006G036566--Sobic002G212500 Sobic010G239600 Sobic010G239600 Sobic006G036566--Sobic010G239600 Sobic001G072500 Sobic001G072500 Sobic006G036566--Sobic001G072500 Sobic008G082100 Sobic008G082100 Sobic010G100516--Sobic008G082100 Sobic010G100516--Sobic004G263600 Sobic010G100516--Sobic001G072500 Sobic010G100516--Sobic006G036566 Sobic007G111400 Sobic007G111400 Sobic010G100516--Sobic007G111400 Sobic010G153201 Sobic010G153201 Sobic010G100516--Sobic010G153201 Sobic004G025800 Sobic004G025800 Sobic010G100516--Sobic004G025800 Sobic006G055200 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Octagon: transcription factors


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