Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G075100.1
Synonym Sb05g006170
Functional annotation rp3 protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6PQR3
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF455
NCBI CDD KOG4658; Apoptotic ATPase
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G14470 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g23990.1 : rp3 protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025204
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G115050 - -
2 Sobic.004G181600 calmodulin binding protein, putative, expressed -
3 Sobic.002G173100 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
4 Sobic.002G345700 insulin-degrading enzyme, putative, expressed K01408: IDE, insulysin
5 Sobic.003G190000 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.010G141966 - -
7 Sobic.006G133900 NIN, putative, expressed -
8 Sobic.006G219600 SIT4 phosphatase-associated protein domain containing protein, expressed K15501: PPP6R3, serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 3
9 Sobic.009G097200 saposin-like type B, region 1 family protein, putative, expressed K12382: PSAP, saposin
10 Sobic.001G060500 YT521-B, putative, expressed -
11 Sobic.010G153201 - -
12 Sobic.002G198200 expressed protein K03128: transcription initiation factor TFIID subunit 2
13 Sobic.002G124600 RNA recognition motif family protein, expressed K13094: RNA-binding protein 5/10
14 Sobic.006G030400 xa21, putative, expressed -
15 Sobic.002G097700 expressed protein -
16 Sobic.002G169400 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
17 Sobic.003G203300 stress regulated protein, putative, expressed -
18 Sobic.007G111400 - -
19 Sobic.001G243200 1,2-dihydroxy-3-keto-5-methylthiopentene dioxygenase protein, putative, expressed K08967: mtnD, mtnZ, 1,2-dihydroxy-3-keto-5-methylthiopentene dioxygenase
20 Sobic.006G065100 ERD1 protein, chloroplast precursor, putative, expressed K03696: ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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