Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G169400.2,Sobic.002G169400.1
Synonym Sb02g021535
Functional annotation Leucine Rich Repeat family protein, expressed
UniProt A0A1B6QBX1 , A0A1W0W4J6
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF635
NCBI CDD KOG4658; Apoptotic ATPase
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G14470 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g15850.1 : Leucine Rich Repeat family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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14 Sobic.009G161550 - -
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16 Sobic.004G271600 region found in RelA/SpoT proteins containing protein, expressed -
17 Sobic.004G181600 calmodulin binding protein, putative, expressed -
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19 Sobic.003G203300 stress regulated protein, putative, expressed -
20 Sobic.010G141800 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G169400 Sobic002G169400 Sobic005G075100 Sobic005G075100 Sobic002G169400--Sobic005G075100 Sobic002G173100 Sobic002G173100 Sobic002G169400--Sobic002G173100 Sobic006G051800 Sobic006G051800 Sobic002G169400--Sobic006G051800 Sobic005G201000 Sobic005G201000 Sobic002G169400--Sobic005G201000 Sobic002G379750 Sobic002G379750 Sobic002G169400--Sobic002G379750 Sobic007G111400 Sobic007G111400 Sobic002G169400--Sobic007G111400 Sobic002G124600 Sobic002G124600 Sobic002G169400--Sobic002G124600 Sobic002G115050 Sobic002G115050 Sobic002G169400--Sobic002G115050 Sobic010G141966 Sobic010G141966 Sobic002G169400--Sobic010G141966 Sobic005G075100--Sobic002G115050 Sobic004G181600 Sobic004G181600 Sobic005G075100--Sobic004G181600 Sobic005G075100--Sobic002G173100 Sobic002G345700 Sobic002G345700 Sobic005G075100--Sobic002G345700 Sobic003G190000 Sobic003G190000 Sobic005G075100--Sobic003G190000 Sobic005G075100--Sobic010G141966 Sobic006G133900 Sobic006G133900 Sobic005G075100--Sobic006G133900 Sobic006G219600 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Octagon: transcription factors


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