Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G161550.1
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Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R324
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G139000 - -
2 Sobic.004G174200 pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, putative, expressed K12813: pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16
3 Sobic.010G141800 expressed protein -
4 Sobic.005G182000 - -
5 Sobic.004G091100 nuclear protein ZAP-related, putative, expressed K17602: YLP motif-containing protein 1
6 Sobic.004G263600 - K03655: ATP-dependent DNA helicase RecG
7 Sobic.002G034100 D-alanine--D-alanine ligase family, putative, expressed -
8 Sobic.001G365900 PWWP domain containing protein, expressed -
9 Sobic.006G142775 - K11592: DICER1, endoribonuclease Dicer
10 Sobic.001G534700 plus-3 domain containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.002G411600 CW-type Zinc Finger, putative, expressed -
12 Sobic.001G100900 OsDegp14 - Putative Deg protease homologue, expressed -
13 Sobic.007G193700 Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein, putative, expressed -
14 Sobic.010G206900 transcription initiation factor TFIID subunit 1, putative, expressed K03125: transcription initiation factor TFIID subunit 1
15 Sobic.010G141966 - -
16 Sobic.006G182900 expressed protein -
17 Sobic.009G165700 SAC3/GANP family protein, putative, expressed -
18 Sobic.003G086900 C2 domain containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.008G087866 - -
20 Sobic.004G306500 OsMADS22 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G161550 Sobic009G161550 Sobic009G139000 Sobic009G139000 Sobic009G161550--Sobic009G139000 Sobic004G174200 Sobic004G174200 Sobic009G161550--Sobic004G174200 Sobic010G141800 Sobic010G141800 Sobic009G161550--Sobic010G141800 Sobic005G182000 Sobic005G182000 Sobic009G161550--Sobic005G182000 Sobic004G091100 Sobic004G091100 Sobic009G161550--Sobic004G091100 Sobic004G263600 Sobic004G263600 Sobic009G161550--Sobic004G263600 Sobic002G034100 Sobic002G034100 Sobic009G161550--Sobic002G034100 Sobic001G365900 Sobic001G365900 Sobic009G161550--Sobic001G365900 Sobic006G142775 Sobic006G142775 Sobic009G161550--Sobic006G142775 Sobic009G139000--Sobic009G161550 Sobic009G139000--Sobic004G174200 Sobic009G139000--Sobic005G182000 Sobic009G139000--Sobic010G141800 Sobic008G087866 Sobic008G087866 Sobic009G139000--Sobic008G087866 Sobic009G110000 Sobic009G110000 Sobic009G139000--Sobic009G110000 Sobic009G139000--Sobic004G263600 Sobic009G165700 Sobic009G165700 Sobic009G139000--Sobic009G165700 Sobic001G072500 Sobic001G072500 Sobic009G139000--Sobic001G072500 Sobic004G291900 Sobic004G291900 Sobic004G174200--Sobic004G291900 Sobic002G411600 Sobic002G411600 Sobic004G174200--Sobic002G411600 Sobic008G001200 Sobic008G001200 Sobic004G174200--Sobic008G001200 Sobic010G206900 Sobic010G206900 Sobic004G174200--Sobic010G206900 Sobic002G008900 Sobic002G008900 Sobic004G174200--Sobic002G008900 Sobic001G289800 Sobic001G289800 Sobic004G174200--Sobic001G289800 Sobic005G001000 Sobic005G001000 Sobic004G174200--Sobic005G001000 Sobic003G422500 Sobic003G422500 Sobic004G174200--Sobic003G422500 Sobic001G194200 Sobic001G194200 Sobic004G174200--Sobic001G194200 Sobic010G141966 Sobic010G141966 Sobic010G141800--Sobic010G141966 Sobic010G141800--Sobic009G161550 Sobic010G141800--Sobic005G182000 Sobic010G141800--Sobic002G034100 Sobic010G141800--Sobic009G139000 Sobic008G122600 Sobic008G122600 Sobic010G141800--Sobic008G122600 Sobic007G020600 Sobic007G020600 Sobic010G141800--Sobic007G020600 Sobic005G090401 Sobic005G090401 Sobic010G141800--Sobic005G090401 Sobic009G092800 Sobic009G092800 Sobic010G141800--Sobic009G092800 Sobic005G182000--Sobic009G161550 Sobic005G182000--Sobic009G139000 Sobic005G182000--Sobic010G141800 Sobic002G427050 Sobic002G427050 Sobic005G182000--Sobic002G427050 Sobic001G262700 Sobic001G262700 Sobic005G182000--Sobic001G262700 Sobic001G481900 Sobic001G481900 Sobic005G182000--Sobic001G481900 Sobic002G427000 Sobic002G427000 Sobic005G182000--Sobic002G427000 Sobic005G182000--Sobic004G091100 Sobic003G247300 Sobic003G247300 Sobic005G182000--Sobic003G247300 Sobic004G091100--Sobic009G165700 Sobic001G451400 Sobic001G451400 Sobic004G091100--Sobic001G451400 Sobic010G118950 Sobic010G118950 Sobic004G091100--Sobic010G118950 Sobic009G191000 Sobic009G191000 Sobic004G091100--Sobic009G191000 Sobic004G091100--Sobic008G087866 Sobic001G128300 Sobic001G128300 Sobic004G091100--Sobic001G128300 Sobic001G534700 Sobic001G534700 Sobic004G091100--Sobic001G534700 Sobic004G091100--Sobic003G422500 Sobic001G050200 Sobic001G050200 Sobic004G091100--Sobic001G050200 Sobic007G193700 Sobic007G193700 Sobic004G263600--Sobic007G193700 Sobic004G263600--Sobic004G174200 Sobic004G263600--Sobic001G194200 Sobic006G055200 Sobic006G055200 Sobic004G263600--Sobic006G055200 Sobic004G263600--Sobic004G291900 Sobic004G263600--Sobic005G001000 Sobic004G263600--Sobic008G001200 Sobic004G263600--Sobic001G072500 Sobic004G023000 Sobic004G023000 Sobic004G263600--Sobic004G023000 Sobic002G034100--Sobic004G023000 Sobic001G100900 Sobic001G100900 Sobic002G034100--Sobic001G100900 Sobic002G034100--Sobic009G161550 Sobic002G034100--Sobic004G263600 Sobic002G034100--Sobic004G091100 Sobic005G110200 Sobic005G110200 Sobic002G034100--Sobic005G110200 Sobic002G034100--Sobic004G174200 Sobic002G034100--Sobic005G090401 Sobic002G034100--Sobic010G141800 Sobic001G365900--Sobic010G206900 Sobic001G365900--Sobic001G534700 Sobic001G289600 Sobic001G289600 Sobic001G365900--Sobic001G289600 Sobic008G130100 Sobic008G130100 Sobic001G365900--Sobic008G130100 Sobic001G365900--Sobic002G411600 Sobic001G365900--Sobic002G008900 Sobic001G365900--Sobic009G191000 Sobic004G034900 Sobic004G034900 Sobic001G365900--Sobic004G034900 Sobic001G540400 Sobic001G540400 Sobic001G365900--Sobic001G540400 Sobic003G275700 Sobic003G275700 Sobic006G142775--Sobic003G275700 Sobic001G389100 Sobic001G389100 Sobic006G142775--Sobic001G389100 Sobic001G191600 Sobic001G191600 Sobic006G142775--Sobic001G191600 Sobic007G186900 Sobic007G186900 Sobic006G142775--Sobic007G186900 Sobic006G142775--Sobic009G165700 Sobic003G029700 Sobic003G029700 Sobic006G142775--Sobic003G029700 Sobic006G142775--Sobic009G161550 Sobic006G142775--Sobic001G128300 Sobic003G221900 Sobic003G221900 Sobic006G142775--Sobic003G221900
Octagon: transcription factors


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