Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G034100.1
Synonym Sb02g002970
Functional annotation D-alanine--D-alanine ligase family, putative, expressed
UniProt A0A1B6Q8Z7
Pfam PF07478 PF01820
Panther DB PTHR23132 PTHR23132:SF0
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008716; D-alanine-D-alanine ligase activity GO:0005737cytoplasm


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G08840 : D-alanine--D-alanine ligase family
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g49110.1 : D-alanine--D-alanine ligase family, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a015500
Brachypodium KQK14508 , KQK14509
Barley HORVU2Hr1G015430.5 , HORVU2Hr1G015430.4 , HORVU2Hr1G015430.3 , HORVU2Hr1G015430.2 , HORVU2Hr1G015430.1
Wheat TraesCS2D02G091400 , TraesCS2D02G091400 , TraesCS2B02G107200 , TraesCS2A02G092400
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G034100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic002G034100 Sobic002G034100 Sobic004G023000 Sobic004G023000 Sobic002G034100--Sobic004G023000 Sobic001G100900 Sobic001G100900 Sobic002G034100--Sobic001G100900 Sobic009G161550 Sobic009G161550 Sobic002G034100--Sobic009G161550 Sobic004G263600 Sobic004G263600 Sobic002G034100--Sobic004G263600 Sobic004G091100 Sobic004G091100 Sobic002G034100--Sobic004G091100 Sobic005G110200 Sobic005G110200 Sobic002G034100--Sobic005G110200 Sobic004G174200 Sobic004G174200 Sobic002G034100--Sobic004G174200 Sobic005G090401 Sobic005G090401 Sobic002G034100--Sobic005G090401 Sobic010G141800 Sobic010G141800 Sobic002G034100--Sobic010G141800 Sobic009G165700 Sobic009G165700 Sobic004G023000--Sobic009G165700 Sobic010G247800 Sobic010G247800 Sobic004G023000--Sobic010G247800 Sobic003G095900 Sobic003G095900 Sobic004G023000--Sobic003G095900 Sobic004G314000 Sobic004G314000 Sobic004G023000--Sobic004G314000 Sobic009G256400 Sobic009G256400 Sobic004G023000--Sobic009G256400 Sobic010G139000 Sobic010G139000 Sobic004G023000--Sobic010G139000 Sobic002G211800 Sobic002G211800 Sobic004G023000--Sobic002G211800 Sobic004G023000--Sobic004G263600 Sobic010G206900 Sobic010G206900 Sobic004G023000--Sobic010G206900 Sobic001G100900--Sobic004G174200 Sobic003G155100 Sobic003G155100 Sobic001G100900--Sobic003G155100 Sobic004G291900 Sobic004G291900 Sobic001G100900--Sobic004G291900 Sobic009G201300 Sobic009G201300 Sobic001G100900--Sobic009G201300 Sobic009G074400 Sobic009G074400 Sobic001G100900--Sobic009G074400 Sobic008G001200 Sobic008G001200 Sobic001G100900--Sobic008G001200 Sobic006G219600 Sobic006G219600 Sobic001G100900--Sobic006G219600 Sobic001G100900--Sobic002G211800 Sobic003G220800 Sobic003G220800 Sobic001G100900--Sobic003G220800 Sobic009G139000 Sobic009G139000 Sobic009G161550--Sobic009G139000 Sobic009G161550--Sobic004G174200 Sobic009G161550--Sobic010G141800 Sobic005G182000 Sobic005G182000 Sobic009G161550--Sobic005G182000 Sobic009G161550--Sobic004G091100 Sobic009G161550--Sobic004G263600 Sobic009G161550--Sobic002G034100 Sobic001G365900 Sobic001G365900 Sobic009G161550--Sobic001G365900 Sobic006G142775 Sobic006G142775 Sobic009G161550--Sobic006G142775 Sobic007G193700 Sobic007G193700 Sobic004G263600--Sobic007G193700 Sobic004G263600--Sobic004G174200 Sobic001G194200 Sobic001G194200 Sobic004G263600--Sobic001G194200 Sobic006G055200 Sobic006G055200 Sobic004G263600--Sobic006G055200 Sobic004G263600--Sobic004G291900 Sobic005G001000 Sobic005G001000 Sobic004G263600--Sobic005G001000 Sobic004G263600--Sobic008G001200 Sobic001G072500 Sobic001G072500 Sobic004G263600--Sobic001G072500 Sobic004G263600--Sobic004G023000 Sobic004G091100--Sobic009G165700 Sobic001G451400 Sobic001G451400 Sobic004G091100--Sobic001G451400 Sobic010G118950 Sobic010G118950 Sobic004G091100--Sobic010G118950 Sobic009G191000 Sobic009G191000 Sobic004G091100--Sobic009G191000 Sobic008G087866 Sobic008G087866 Sobic004G091100--Sobic008G087866 Sobic001G128300 Sobic001G128300 Sobic004G091100--Sobic001G128300 Sobic001G534700 Sobic001G534700 Sobic004G091100--Sobic001G534700 Sobic003G422500 Sobic003G422500 Sobic004G091100--Sobic003G422500 Sobic001G050200 Sobic001G050200 Sobic004G091100--Sobic001G050200 Sobic005G110300 Sobic005G110300 Sobic005G110200--Sobic005G110300 Sobic002G134200 Sobic002G134200 Sobic005G110200--Sobic002G134200 Sobic007G116200 Sobic007G116200 Sobic005G110200--Sobic007G116200 Sobic008G185300 Sobic008G185300 Sobic005G110200--Sobic008G185300 Sobic005G110200--Sobic005G090401 Sobic006G182900 Sobic006G182900 Sobic005G110200--Sobic006G182900 Sobic003G280800 Sobic003G280800 Sobic005G110200--Sobic003G280800 Sobic005G032800 Sobic005G032800 Sobic005G110200--Sobic005G032800 Sobic006G032500 Sobic006G032500 Sobic005G110200--Sobic006G032500 Sobic004G174200--Sobic004G291900 Sobic002G411600 Sobic002G411600 Sobic004G174200--Sobic002G411600 Sobic004G174200--Sobic008G001200 Sobic004G174200--Sobic010G206900 Sobic002G008900 Sobic002G008900 Sobic004G174200--Sobic002G008900 Sobic001G289800 Sobic001G289800 Sobic004G174200--Sobic001G289800 Sobic004G174200--Sobic005G001000 Sobic004G174200--Sobic003G422500 Sobic004G174200--Sobic001G194200 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic005G090401--Sobic004G007100 Sobic005G090401--Sobic006G182900 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic005G090401--Sobic006G048500 Sobic006G048600 Sobic006G048600 Sobic005G090401--Sobic006G048600 Sobic002G173000 Sobic002G173000 Sobic005G090401--Sobic002G173000 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic005G090401--Sobic002G243900 Sobic005G090401--Sobic005G110200 Sobic007G161300 Sobic007G161300 Sobic005G090401--Sobic007G161300 Sobic005G090401--Sobic005G032800 Sobic010G141966 Sobic010G141966 Sobic010G141800--Sobic010G141966 Sobic010G141800--Sobic009G161550 Sobic010G141800--Sobic005G182000 Sobic010G141800--Sobic002G034100 Sobic010G141800--Sobic009G139000 Sobic008G122600 Sobic008G122600 Sobic010G141800--Sobic008G122600 Sobic007G020600 Sobic007G020600 Sobic010G141800--Sobic007G020600 Sobic010G141800--Sobic005G090401 Sobic009G092800 Sobic009G092800 Sobic010G141800--Sobic009G092800
Octagon: transcription factors


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