Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G031900.3,Sobic.007G031900.4,Sobic.007G031900.1
Synonym Sb07g002760
Functional annotation OsFBX207 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt Q8W0T3 , C5YMZ6
Pfam PF00646
Panther DB PTHR31639 PTHR31639:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G13570 : F-box/RNI-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g49930.1 : OsFBX207 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS1D02G113500 , TraesCS1B02G132200
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G211800 AT-rich interaction region, putative, expressed -
2 Sobic.001G111850 - -
3 Sobic.006G216100 expressed protein -
4 Sobic.003G166750 - K15188: cyclin T
5 Sobic.009G201300 - -
6 Sobic.004G244900 expressed protein -
7 Sobic.006G252900 ubiquitin family protein, putative, expressed -
8 Sobic.001G457800 U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, putative, expressed K18663: activating signal cointegrator complex subunit 3
9 Sobic.006G050700 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
10 Sobic.008G001200 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G100900 OsDegp14 - Putative Deg protease homologue, expressed -
12 Sobic.004G334300 ATMAK10, putative, expressed -
13 Sobic.001G441400 transcription factor, putative, expressed K09060: plant G-box-binding factor
14 Sobic.001G451450 - -
15 Sobic.009G132700 - -
16 Sobic.009G165700 SAC3/GANP family protein, putative, expressed -
17 Sobic.010G226000 expressed protein -
18 Sobic.006G041600 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K17985: activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1
19 Sobic.004G023000 SAC9, putative, expressed -
20 Sobic.001G529600 1,3-beta-glucan synthase component domain containing protein, expressed K11000: callose synthase


Gene co-expression network
sample Sobic007G031900 Sobic007G031900 Sobic002G211800 Sobic002G211800 Sobic007G031900--Sobic002G211800 Sobic001G111850 Sobic001G111850 Sobic007G031900--Sobic001G111850 Sobic006G216100 Sobic006G216100 Sobic007G031900--Sobic006G216100 Sobic003G166750 Sobic003G166750 Sobic007G031900--Sobic003G166750 Sobic009G201300 Sobic009G201300 Sobic007G031900--Sobic009G201300 Sobic004G244900 Sobic004G244900 Sobic007G031900--Sobic004G244900 Sobic006G252900 Sobic006G252900 Sobic007G031900--Sobic006G252900 Sobic001G457800 Sobic001G457800 Sobic007G031900--Sobic001G457800 Sobic006G050700 Sobic006G050700 Sobic007G031900--Sobic006G050700 Sobic009G165700 Sobic009G165700 Sobic002G211800--Sobic009G165700 Sobic002G211800--Sobic007G031900 Sobic002G344000 Sobic002G344000 Sobic002G211800--Sobic002G344000 Sobic002G211800--Sobic003G166750 Sobic004G023000 Sobic004G023000 Sobic002G211800--Sobic004G023000 Sobic009G132700 Sobic009G132700 Sobic002G211800--Sobic009G132700 Sobic003G170900 Sobic003G170900 Sobic002G211800--Sobic003G170900 Sobic002G294800 Sobic002G294800 Sobic002G211800--Sobic002G294800 Sobic003G362600 Sobic003G362600 Sobic002G211800--Sobic003G362600 Sobic001G111850--Sobic003G166750 Sobic001G111850--Sobic009G165700 Sobic001G439300 Sobic001G439300 Sobic001G111850--Sobic001G439300 Sobic008G001200 Sobic008G001200 Sobic001G111850--Sobic008G001200 Sobic009G256400 Sobic009G256400 Sobic001G111850--Sobic009G256400 Sobic001G433800 Sobic001G433800 Sobic001G111850--Sobic001G433800 Sobic001G370900 Sobic001G370900 Sobic001G111850--Sobic001G370900 Sobic010G123600 Sobic010G123600 Sobic001G111850--Sobic010G123600 Sobic002G042600 Sobic002G042600 Sobic001G111850--Sobic002G042600 Sobic004G034800 Sobic004G034800 Sobic006G216100--Sobic004G034800 Sobic002G042800 Sobic002G042800 Sobic006G216100--Sobic002G042800 Sobic003G168100 Sobic003G168100 Sobic006G216100--Sobic003G168100 Sobic001G455600 Sobic001G455600 Sobic006G216100--Sobic001G455600 Sobic006G216100--Sobic006G252900 Sobic006G216100--Sobic009G132700 Sobic006G216100--Sobic007G031900 Sobic003G398700 Sobic003G398700 Sobic006G216100--Sobic003G398700 Sobic006G216100--Sobic004G244900 Sobic003G166750--Sobic009G165700 Sobic003G166750--Sobic008G001200 Sobic003G166750--Sobic009G256400 Sobic003G166750--Sobic001G370900 Sobic001G289800 Sobic001G289800 Sobic003G166750--Sobic001G289800 Sobic002G316600 Sobic002G316600 Sobic003G166750--Sobic002G316600 Sobic001G194200 Sobic001G194200 Sobic003G166750--Sobic001G194200 Sobic001G527800 Sobic001G527800 Sobic003G166750--Sobic001G527800 Sobic003G166750--Sobic001G457800 Sobic006G219600 Sobic006G219600 Sobic009G201300--Sobic006G219600 Sobic003G155100 Sobic003G155100 Sobic009G201300--Sobic003G155100 Sobic009G201300--Sobic006G050700 Sobic003G119600 Sobic003G119600 Sobic009G201300--Sobic003G119600 Sobic009G201300--Sobic004G244900 Sobic001G133000 Sobic001G133000 Sobic009G201300--Sobic001G133000 Sobic009G201300--Sobic008G001200 Sobic009G201300--Sobic001G457800 Sobic009G201300--Sobic002G211800 Sobic004G244900--Sobic001G457800 Sobic004G334300 Sobic004G334300 Sobic004G244900--Sobic004G334300 Sobic004G244900--Sobic003G119600 Sobic004G244900--Sobic003G155100 Sobic004G244900--Sobic008G001200 Sobic004G356700 Sobic004G356700 Sobic004G244900--Sobic004G356700 Sobic004G244900--Sobic009G201300 Sobic002G275700 Sobic002G275700 Sobic004G244900--Sobic002G275700 Sobic004G244900--Sobic003G168100 Sobic006G252900--Sobic001G433800 Sobic006G041600 Sobic006G041600 Sobic006G252900--Sobic006G041600 Sobic001G363500 Sobic001G363500 Sobic006G252900--Sobic001G363500 Sobic001G441400 Sobic001G441400 Sobic006G252900--Sobic001G441400 Sobic006G252900--Sobic009G256400 Sobic006G096900 Sobic006G096900 Sobic006G252900--Sobic006G096900 Sobic005G112300 Sobic005G112300 Sobic006G252900--Sobic005G112300 Sobic005G027400 Sobic005G027400 Sobic006G252900--Sobic005G027400 Sobic009G177500 Sobic009G177500 Sobic006G252900--Sobic009G177500 Sobic001G457800--Sobic009G256400 Sobic001G457800--Sobic008G001200 Sobic001G457800--Sobic001G370900 Sobic001G457800--Sobic003G166750 Sobic001G457800--Sobic003G155100 Sobic004G001500 Sobic004G001500 Sobic001G457800--Sobic004G001500 Sobic001G230000 Sobic001G230000 Sobic001G457800--Sobic001G230000 Sobic003G043200 Sobic003G043200 Sobic001G457800--Sobic003G043200 Sobic001G457800--Sobic004G334300 Sobic006G050700--Sobic003G155100 Sobic006G050700--Sobic006G219600 Sobic006G050700--Sobic008G001200 Sobic006G050700--Sobic009G201300 Sobic002G346200 Sobic002G346200 Sobic006G050700--Sobic002G346200 Sobic004G042200 Sobic004G042200 Sobic006G050700--Sobic004G042200 Sobic010G206900 Sobic010G206900 Sobic006G050700--Sobic010G206900 Sobic006G050700--Sobic001G230000 Sobic006G050700--Sobic001G527800
Octagon: transcription factors


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