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Transcriptome id Sobic.001G451450.1
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UniProt A0A1Z5SAN7
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NCBI CDD -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G111850 - -
2 Sobic.003G166750 - K15188: cyclin T
3 Sobic.009G165700 SAC3/GANP family protein, putative, expressed -
4 Sobic.009G201300 - -
5 Sobic.009G255700 SIT4 phosphatase-associated protein domain containing protein, expressed K15501: PPP6R3, serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 3
6 Sobic.001G439300 AGAP009131-PA, putative, expressed K18826: calmodulin-lysine N-methyltransferase
7 Sobic.002G211800 AT-rich interaction region, putative, expressed -
8 Sobic.008G001200 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.010G226000 expressed protein -
10 Sobic.008G087866 - -
11 Sobic.001G370900 expressed protein K11665: INO80, DNA helicase INO80
12 Sobic.003G170900 - -
13 Sobic.001G457800 U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, putative, expressed K18663: activating signal cointegrator complex subunit 3
14 Sobic.004G001500 HECT-domain domain containing protein, expressed K10590: E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12
15 Sobic.003G196300 DNA binding protein, putative, expressed -
16 Sobic.001G527800 DCL2, putative, expressed K11592: DICER1, endoribonuclease Dicer
17 Sobic.003G155100 suppressor of Mek, putative, expressed K17491: SMEK, protein phosphatase 4 regulatory subunit 3
18 Sobic.007G031900 OsFBX207 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.001G451400 HEAT repeat family protein, putative, expressed K15305: VAC14, vacuole morphology and inheritance protein 14
20 Sobic.010G123600 WW domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G451450 Sobic001G451450 Sobic001G111850 Sobic001G111850 Sobic001G451450--Sobic001G111850 Sobic003G166750 Sobic003G166750 Sobic001G451450--Sobic003G166750 Sobic009G165700 Sobic009G165700 Sobic001G451450--Sobic009G165700 Sobic009G201300 Sobic009G201300 Sobic001G451450--Sobic009G201300 Sobic009G255700 Sobic009G255700 Sobic001G451450--Sobic009G255700 Sobic001G439300 Sobic001G439300 Sobic001G451450--Sobic001G439300 Sobic002G211800 Sobic002G211800 Sobic001G451450--Sobic002G211800 Sobic008G001200 Sobic008G001200 Sobic001G451450--Sobic008G001200 Sobic010G226000 Sobic010G226000 Sobic001G451450--Sobic010G226000 Sobic001G111850--Sobic003G166750 Sobic001G111850--Sobic009G165700 Sobic001G111850--Sobic001G439300 Sobic001G111850--Sobic008G001200 Sobic009G256400 Sobic009G256400 Sobic001G111850--Sobic009G256400 Sobic001G433800 Sobic001G433800 Sobic001G111850--Sobic001G433800 Sobic001G370900 Sobic001G370900 Sobic001G111850--Sobic001G370900 Sobic010G123600 Sobic010G123600 Sobic001G111850--Sobic010G123600 Sobic002G042600 Sobic002G042600 Sobic001G111850--Sobic002G042600 Sobic003G166750--Sobic009G165700 Sobic003G166750--Sobic008G001200 Sobic003G166750--Sobic009G256400 Sobic003G166750--Sobic001G370900 Sobic001G289800 Sobic001G289800 Sobic003G166750--Sobic001G289800 Sobic002G316600 Sobic002G316600 Sobic003G166750--Sobic002G316600 Sobic001G194200 Sobic001G194200 Sobic003G166750--Sobic001G194200 Sobic001G527800 Sobic001G527800 Sobic003G166750--Sobic001G527800 Sobic001G457800 Sobic001G457800 Sobic003G166750--Sobic001G457800 Sobic003G422500 Sobic003G422500 Sobic009G165700--Sobic003G422500 Sobic010G247800 Sobic010G247800 Sobic009G165700--Sobic010G247800 Sobic010G206900 Sobic010G206900 Sobic009G165700--Sobic010G206900 Sobic009G165700--Sobic003G166750 Sobic008G087866 Sobic008G087866 Sobic009G165700--Sobic008G087866 Sobic001G451400 Sobic001G451400 Sobic009G165700--Sobic001G451400 Sobic003G170900 Sobic003G170900 Sobic009G165700--Sobic003G170900 Sobic001G534700 Sobic001G534700 Sobic009G165700--Sobic001G534700 Sobic009G165700--Sobic008G001200 Sobic006G219600 Sobic006G219600 Sobic009G201300--Sobic006G219600 Sobic003G155100 Sobic003G155100 Sobic009G201300--Sobic003G155100 Sobic006G050700 Sobic006G050700 Sobic009G201300--Sobic006G050700 Sobic003G119600 Sobic003G119600 Sobic009G201300--Sobic003G119600 Sobic004G244900 Sobic004G244900 Sobic009G201300--Sobic004G244900 Sobic001G133000 Sobic001G133000 Sobic009G201300--Sobic001G133000 Sobic009G201300--Sobic008G001200 Sobic009G201300--Sobic001G457800 Sobic009G201300--Sobic002G211800 Sobic001G192000 Sobic001G192000 Sobic009G255700--Sobic001G192000 Sobic008G088872 Sobic008G088872 Sobic009G255700--Sobic008G088872 Sobic002G275700 Sobic002G275700 Sobic009G255700--Sobic002G275700 Sobic009G255700--Sobic001G370900 Sobic005G162500 Sobic005G162500 Sobic009G255700--Sobic005G162500 Sobic006G184900 Sobic006G184900 Sobic009G255700--Sobic006G184900 Sobic002G308700 Sobic002G308700 Sobic009G255700--Sobic002G308700 Sobic002G335600 Sobic002G335600 Sobic009G255700--Sobic002G335600 Sobic009G255700--Sobic004G244900 Sobic001G439300--Sobic001G111850 Sobic001G439300--Sobic003G119600 Sobic001G439300--Sobic001G370900 Sobic001G439300--Sobic002G042600 Sobic001G439300--Sobic009G255700 Sobic001G439300--Sobic001G451450 Sobic001G439300--Sobic001G194200 Sobic001G065100 Sobic001G065100 Sobic001G439300--Sobic001G065100 Sobic001G439300--Sobic008G001200 Sobic002G211800--Sobic009G165700 Sobic007G031900 Sobic007G031900 Sobic002G211800--Sobic007G031900 Sobic002G344000 Sobic002G344000 Sobic002G211800--Sobic002G344000 Sobic002G211800--Sobic003G166750 Sobic004G023000 Sobic004G023000 Sobic002G211800--Sobic004G023000 Sobic009G132700 Sobic009G132700 Sobic002G211800--Sobic009G132700 Sobic002G211800--Sobic003G170900 Sobic002G294800 Sobic002G294800 Sobic002G211800--Sobic002G294800 Sobic003G362600 Sobic003G362600 Sobic002G211800--Sobic003G362600 Sobic008G001200--Sobic003G155100 Sobic008G001200--Sobic010G206900 Sobic008G001200--Sobic009G256400 Sobic003G205200 Sobic003G205200 Sobic008G001200--Sobic003G205200 Sobic010G010700 Sobic010G010700 Sobic008G001200--Sobic010G010700 Sobic008G001200--Sobic001G194200 Sobic005G001000 Sobic005G001000 Sobic008G001200--Sobic005G001000 Sobic004G276400 Sobic004G276400 Sobic008G001200--Sobic004G276400 Sobic004G174200 Sobic004G174200 Sobic008G001200--Sobic004G174200 Sobic010G226000--Sobic001G451400 Sobic010G226000--Sobic009G256400 Sobic004G209700 Sobic004G209700 Sobic010G226000--Sobic004G209700 Sobic010G226000--Sobic009G165700 Sobic010G226000--Sobic003G166750 Sobic001G441400 Sobic001G441400 Sobic010G226000--Sobic001G441400 Sobic010G226000--Sobic001G457800 Sobic010G226000--Sobic001G111850 Sobic003G444800 Sobic003G444800 Sobic010G226000--Sobic003G444800
Octagon: transcription factors


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