Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G216100.1,Sobic.006G216100.2,Sobic.006G216100.3
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PN83 , A0A1Z5RFP5 , A0A1Z5REZ3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g39370.1,LOC_Os07g10090.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G034800 OsFBX440 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.002G042800 expressed protein -
3 Sobic.003G168100 BZIP protein, putative, expressed -
4 Sobic.001G455600 cysteine synthase, putative, expressed K01738: cysteine synthase
5 Sobic.006G252900 ubiquitin family protein, putative, expressed -
6 Sobic.009G132700 - -
7 Sobic.007G031900 OsFBX207 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.003G398700 expressed protein K15210: snRNA-activating protein complex subunit 3
9 Sobic.004G244900 expressed protein -
10 Sobic.004G185800 expressed protein -
11 Sobic.003G095900 pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, putative, expressed K14442: DHX36, ATP-dependent RNA helicase DHX36
12 Sobic.003G120300 NAD dependent epimerase/dehydratase family protein, putative, expressed -
13 Sobic.009G239200 - -
14 Sobic.010G140400 poor homologous synapsis 1 protein, putative, expressed -
15 Sobic.002G211800 AT-rich interaction region, putative, expressed -
16 Sobic.002G029900 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
17 Sobic.007G017800 OsFBX142 - F-box domain containing protein, expressed -
18 Sobic.006G096900 expressed protein -
19 Sobic.009G129100 preprotein translocase subunit secY, putative, expressed -
20 Sobic.004G134200 GTP binding protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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