Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G141800.2,Sobic.010G141800.4,Sobic.010G141800.3,Sobic.010G141800.1
Synonym Sb10g016955
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0VT12 , A0A1W0VSY9 , A0A1W0VSY6 , A0A194YJ52
Pfam PF02902
Panther DB PTHR12606 PTHR12606:SF31
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008234; cysteine-type peptidase activity GO:0006508proteolysis


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g17290.2 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G141966 - -
2 Sobic.009G161550 - -
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4 Sobic.002G034100 D-alanine--D-alanine ligase family, putative, expressed -
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15 Sobic.010G025850 - -
16 Sobic.002G115050 - -
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19 Sobic.006G048600 - -
20 Sobic.003G275700 myosin head family protein, expressed K10357: myosin V


Gene co-expression network
sample Sobic010G141800 Sobic010G141800 Sobic010G141966 Sobic010G141966 Sobic010G141800--Sobic010G141966 Sobic009G161550 Sobic009G161550 Sobic010G141800--Sobic009G161550 Sobic005G182000 Sobic005G182000 Sobic010G141800--Sobic005G182000 Sobic002G034100 Sobic002G034100 Sobic010G141800--Sobic002G034100 Sobic009G139000 Sobic009G139000 Sobic010G141800--Sobic009G139000 Sobic008G122600 Sobic008G122600 Sobic010G141800--Sobic008G122600 Sobic007G020600 Sobic007G020600 Sobic010G141800--Sobic007G020600 Sobic005G090401 Sobic005G090401 Sobic010G141800--Sobic005G090401 Sobic009G092800 Sobic009G092800 Sobic010G141800--Sobic009G092800 Sobic010G141966--Sobic010G141800 Sobic002G115050 Sobic002G115050 Sobic010G141966--Sobic002G115050 Sobic005G075100 Sobic005G075100 Sobic010G141966--Sobic005G075100 Sobic010G141966--Sobic009G161550 Sobic002G097700 Sobic002G097700 Sobic010G141966--Sobic002G097700 Sobic006G133900 Sobic006G133900 Sobic010G141966--Sobic006G133900 Sobic010G100516 Sobic010G100516 Sobic010G141966--Sobic010G100516 Sobic010G239600 Sobic010G239600 Sobic010G141966--Sobic010G239600 Sobic002G169400 Sobic002G169400 Sobic010G141966--Sobic002G169400 Sobic009G161550--Sobic009G139000 Sobic004G174200 Sobic004G174200 Sobic009G161550--Sobic004G174200 Sobic009G161550--Sobic010G141800 Sobic009G161550--Sobic005G182000 Sobic004G091100 Sobic004G091100 Sobic009G161550--Sobic004G091100 Sobic004G263600 Sobic004G263600 Sobic009G161550--Sobic004G263600 Sobic009G161550--Sobic002G034100 Sobic001G365900 Sobic001G365900 Sobic009G161550--Sobic001G365900 Sobic006G142775 Sobic006G142775 Sobic009G161550--Sobic006G142775 Sobic005G182000--Sobic009G161550 Sobic005G182000--Sobic009G139000 Sobic005G182000--Sobic010G141800 Sobic002G427050 Sobic002G427050 Sobic005G182000--Sobic002G427050 Sobic001G262700 Sobic001G262700 Sobic005G182000--Sobic001G262700 Sobic001G481900 Sobic001G481900 Sobic005G182000--Sobic001G481900 Sobic002G427000 Sobic002G427000 Sobic005G182000--Sobic002G427000 Sobic005G182000--Sobic004G091100 Sobic003G247300 Sobic003G247300 Sobic005G182000--Sobic003G247300 Sobic004G023000 Sobic004G023000 Sobic002G034100--Sobic004G023000 Sobic001G100900 Sobic001G100900 Sobic002G034100--Sobic001G100900 Sobic002G034100--Sobic009G161550 Sobic002G034100--Sobic004G263600 Sobic002G034100--Sobic004G091100 Sobic005G110200 Sobic005G110200 Sobic002G034100--Sobic005G110200 Sobic002G034100--Sobic004G174200 Sobic002G034100--Sobic005G090401 Sobic002G034100--Sobic010G141800 Sobic009G139000--Sobic009G161550 Sobic009G139000--Sobic004G174200 Sobic009G139000--Sobic005G182000 Sobic009G139000--Sobic010G141800 Sobic008G087866 Sobic008G087866 Sobic009G139000--Sobic008G087866 Sobic009G110000 Sobic009G110000 Sobic009G139000--Sobic009G110000 Sobic009G139000--Sobic004G263600 Sobic009G165700 Sobic009G165700 Sobic009G139000--Sobic009G165700 Sobic001G072500 Sobic001G072500 Sobic009G139000--Sobic001G072500 Sobic008G122600--Sobic009G161550 Sobic008G122600--Sobic010G141800 Sobic008G122600--Sobic005G090401 Sobic006G182900 Sobic006G182900 Sobic008G122600--Sobic006G182900 Sobic008G122600--Sobic002G034100 Sobic001G287201 Sobic001G287201 Sobic008G122600--Sobic001G287201 Sobic006G105400 Sobic006G105400 Sobic008G122600--Sobic006G105400 Sobic008G122600--Sobic005G110200 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic008G122600--Sobic006G048500 Sobic004G306500 Sobic004G306500 Sobic007G020600--Sobic004G306500 Sobic003G372500 Sobic003G372500 Sobic007G020600--Sobic003G372500 Sobic007G020600--Sobic001G481900 Sobic001G128300 Sobic001G128300 Sobic007G020600--Sobic001G128300 Sobic002G187700 Sobic002G187700 Sobic007G020600--Sobic002G187700 Sobic003G029700 Sobic003G029700 Sobic007G020600--Sobic003G029700 Sobic009G191000 Sobic009G191000 Sobic007G020600--Sobic009G191000 Sobic003G198800 Sobic003G198800 Sobic007G020600--Sobic003G198800 Sobic007G020600--Sobic010G141800 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic005G090401--Sobic004G007100 Sobic005G090401--Sobic006G182900 Sobic005G090401--Sobic006G048500 Sobic006G048600 Sobic006G048600 Sobic005G090401--Sobic006G048600 Sobic002G173000 Sobic002G173000 Sobic005G090401--Sobic002G173000 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic005G090401--Sobic002G243900 Sobic005G090401--Sobic005G110200 Sobic007G161300 Sobic007G161300 Sobic005G090401--Sobic007G161300 Sobic005G032800 Sobic005G032800 Sobic005G090401--Sobic005G032800 Sobic001G388250 Sobic001G388250 Sobic009G092800--Sobic001G388250 Sobic009G092800--Sobic010G141800 Sobic010G089100 Sobic010G089100 Sobic009G092800--Sobic010G089100 Sobic009G092800--Sobic008G122600 Sobic003G056100 Sobic003G056100 Sobic009G092800--Sobic003G056100 Sobic008G027000 Sobic008G027000 Sobic009G092800--Sobic008G027000 Sobic009G092800--Sobic007G020600 Sobic007G020000 Sobic007G020000 Sobic009G092800--Sobic007G020000 Sobic006G051700 Sobic006G051700 Sobic009G092800--Sobic006G051700
Octagon: transcription factors


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