Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G092800.4,Sobic.009G092800.2,Sobic.009G092800.3,Sobic.009G092800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt C5YVQ4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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TAIR -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G388250 - -
2 Sobic.010G141800 expressed protein -
3 Sobic.010G089100 nucleolar GTP-binding protein 1, putative, expressed -
4 Sobic.008G122600 - -
5 Sobic.003G056100 transcription initiation factor, putative, expressed K03129: transcription initiation factor TFIID subunit 4
6 Sobic.008G027000 rp1, putative, expressed -
7 Sobic.007G020600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@MATE efflux protein, putative, expressed -
8 Sobic.007G020000 AP-3 complex subunit delta, putative, expressed K12396: AP-3 complex subunit delta
9 Sobic.006G051700 WRKY123, expressed -
10 Sobic.005G182000 - -
11 Sobic.009G167600 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
12 Sobic.004G010800 - -
13 Sobic.001G272532 - -
14 Sobic.001G262700 hhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein, putative, expressed -
15 Sobic.004G267300 bg55, putative, expressed -
16 Sobic.005G104400 - -
17 Sobic.004G204200 EMB2423, putative, expressed K11137: TELO2, telomere length regulation protein
18 Sobic.010G025850 - -
19 Sobic.002G034100 D-alanine--D-alanine ligase family, putative, expressed -
20 Sobic.006G250000 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G092800 Sobic009G092800 Sobic001G388250 Sobic001G388250 Sobic009G092800--Sobic001G388250 Sobic010G141800 Sobic010G141800 Sobic009G092800--Sobic010G141800 Sobic010G089100 Sobic010G089100 Sobic009G092800--Sobic010G089100 Sobic008G122600 Sobic008G122600 Sobic009G092800--Sobic008G122600 Sobic003G056100 Sobic003G056100 Sobic009G092800--Sobic003G056100 Sobic008G027000 Sobic008G027000 Sobic009G092800--Sobic008G027000 Sobic007G020600 Sobic007G020600 Sobic009G092800--Sobic007G020600 Sobic007G020000 Sobic007G020000 Sobic009G092800--Sobic007G020000 Sobic006G051700 Sobic006G051700 Sobic009G092800--Sobic006G051700 Sobic001G388250--Sobic009G092800 Sobic001G388250--Sobic008G027000 Sobic001G388250--Sobic010G089100 Sobic008G055366 Sobic008G055366 Sobic001G388250--Sobic008G055366 Sobic008G055432 Sobic008G055432 Sobic001G388250--Sobic008G055432 Sobic009G104201 Sobic009G104201 Sobic001G388250--Sobic009G104201 Sobic008G101000 Sobic008G101000 Sobic001G388250--Sobic008G101000 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Octagon: transcription factors


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