Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G010800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt C5XS98
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.004G010800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G152601 - -
2 Sobic.005G019200 rp3 protein, putative, expressed -
3 Sobic.002G114400 GAGA-binding protein, putative, expressed -
4 Sobic.001G489150 - -
5 Sobic.004G204200 EMB2423, putative, expressed K11137: TELO2, telomere length regulation protein
6 Sobic.003G366850 - -
7 Sobic.005G043800 transporter family protein, putative, expressed -
8 Sobic.003G374500 pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.006G051700 WRKY123, expressed -
10 Sobic.001G239300 AT hook motif domain containing protein, expressed -
11 Sobic.008G065400 - -
12 Sobic.001G274900 - -
13 Sobic.006G250000 - -
14 Sobic.005G154700 OsFBX407 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.001G262900 hhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein, putative, expressed K10801: methyl-CpG-binding domain protein 4
16 Sobic.008G150200 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.010G089100 nucleolar GTP-binding protein 1, putative, expressed -
18 Sobic.002G067100 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K14411: RNA-binding protein Musashi
19 Sobic.002G059800 - -
20 Sobic.006G253400 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic004G010800 Sobic004G010800 Sobic004G152601 Sobic004G152601 Sobic004G010800--Sobic004G152601 Sobic005G019200 Sobic005G019200 Sobic004G010800--Sobic005G019200 Sobic002G114400 Sobic002G114400 Sobic004G010800--Sobic002G114400 Sobic001G489150 Sobic001G489150 Sobic004G010800--Sobic001G489150 Sobic004G204200 Sobic004G204200 Sobic004G010800--Sobic004G204200 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic004G010800--Sobic003G366850 Sobic005G043800 Sobic005G043800 Sobic004G010800--Sobic005G043800 Sobic003G374500 Sobic003G374500 Sobic004G010800--Sobic003G374500 Sobic006G051700 Sobic006G051700 Sobic004G010800--Sobic006G051700 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic004G152601--Sobic008G106400 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic004G152601--Sobic008G065400 Sobic003G201850 Sobic003G201850 Sobic004G152601--Sobic003G201850 Sobic004G152601--Sobic004G010800 Sobic001G262900 Sobic001G262900 Sobic004G152601--Sobic001G262900 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic004G152601--Sobic003G429500 Sobic010G184900 Sobic010G184900 Sobic004G152601--Sobic010G184900 Sobic010G148750 Sobic010G148750 Sobic004G152601--Sobic010G148750 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic004G152601--Sobic008G045600 Sobic005G019200--Sobic004G010800 Sobic009G184700 Sobic009G184700 Sobic005G019200--Sobic009G184700 Sobic009G042700 Sobic009G042700 Sobic005G019200--Sobic009G042700 Sobic001G373200 Sobic001G373200 Sobic005G019200--Sobic001G373200 Sobic005G019200--Sobic006G051700 Sobic004G002100 Sobic004G002100 Sobic005G019200--Sobic004G002100 Sobic010G148501 Sobic010G148501 Sobic005G019200--Sobic010G148501 Sobic005G019200--Sobic003G374500 Sobic007G047700 Sobic007G047700 Sobic005G019200--Sobic007G047700 Sobic002G114400--Sobic004G010800 Sobic002G114400--Sobic001G262900 Sobic010G089100 Sobic010G089100 Sobic002G114400--Sobic010G089100 Sobic001G239300 Sobic001G239300 Sobic002G114400--Sobic001G239300 Sobic010G056000 Sobic010G056000 Sobic002G114400--Sobic010G056000 Sobic007G006900 Sobic007G006900 Sobic002G114400--Sobic007G006900 Sobic002G114400--Sobic006G051700 Sobic002G114400--Sobic004G152601 Sobic002G114400--Sobic005G043800 Sobic007G070500 Sobic007G070500 Sobic001G489150--Sobic007G070500 Sobic001G489150--Sobic004G010800 Sobic002G019750 Sobic002G019750 Sobic001G489150--Sobic002G019750 Sobic001G489150--Sobic008G065400 Sobic003G266700 Sobic003G266700 Sobic001G489150--Sobic003G266700 Sobic003G084750 Sobic003G084750 Sobic001G489150--Sobic003G084750 Sobic001G489150--Sobic004G152601 Sobic001G489150--Sobic003G366850 Sobic009G159300 Sobic009G159300 Sobic001G489150--Sobic009G159300 Sobic002G158700 Sobic002G158700 Sobic004G204200--Sobic002G158700 Sobic002G310200 Sobic002G310200 Sobic004G204200--Sobic002G310200 Sobic001G474600 Sobic001G474600 Sobic004G204200--Sobic001G474600 Sobic008G067600 Sobic008G067600 Sobic004G204200--Sobic008G067600 Sobic001G311500 Sobic001G311500 Sobic004G204200--Sobic001G311500 Sobic008G014500 Sobic008G014500 Sobic004G204200--Sobic008G014500 Sobic003G056100 Sobic003G056100 Sobic004G204200--Sobic003G056100 Sobic002G275600 Sobic002G275600 Sobic004G204200--Sobic002G275600 Sobic001G167200 Sobic001G167200 Sobic004G204200--Sobic001G167200 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic003G366850--Sobic004G121000 Sobic003G366850--Sobic008G065400 Sobic001G261480 Sobic001G261480 Sobic003G366850--Sobic001G261480 Sobic003G366850--Sobic003G429500 Sobic004G200866 Sobic004G200866 Sobic003G366850--Sobic004G200866 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic003G366850--Sobic002G431200 Sobic001G278600 Sobic001G278600 Sobic003G366850--Sobic001G278600 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic003G366850--Sobic005G142200 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic003G366850--Sobic009G101600 Sobic005G043800--Sobic004G121000 Sobic010G164350 Sobic010G164350 Sobic005G043800--Sobic010G164350 Sobic005G043800--Sobic001G261480 Sobic005G043800--Sobic008G045600 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic005G043800--Sobic001G305400 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic005G043800--Sobic002G221200 Sobic005G043800--Sobic005G142200 Sobic010G144000 Sobic010G144000 Sobic005G043800--Sobic010G144000 Sobic005G043800--Sobic003G366850 Sobic003G374500--Sobic008G065400 Sobic003G374500--Sobic001G278600 Sobic003G374500--Sobic003G366850 Sobic007G037301 Sobic007G037301 Sobic003G374500--Sobic007G037301 Sobic005G079700 Sobic005G079700 Sobic003G374500--Sobic005G079700 Sobic001G140200 Sobic001G140200 Sobic003G374500--Sobic001G140200 Sobic003G374500--Sobic001G262900 Sobic003G374500--Sobic003G266700 Sobic003G374500--Sobic002G431200 Sobic004G267300 Sobic004G267300 Sobic006G051700--Sobic004G267300 Sobic006G051700--Sobic010G089100 Sobic006G051700--Sobic005G019200 Sobic006G051700--Sobic003G056100 Sobic006G051700--Sobic001G474600 Sobic006G051700--Sobic004G010800 Sobic005G019600 Sobic005G019600 Sobic006G051700--Sobic005G019600 Sobic001G388250 Sobic001G388250 Sobic006G051700--Sobic001G388250 Sobic007G186900 Sobic007G186900 Sobic006G051700--Sobic007G186900
Octagon: transcription factors


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