Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G274900.1,Sobic.001G274900.2,Sobic.001G274900.3,Sobic.001G274900.4
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S7U3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
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Barley -
Wheat -
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cDNA sequences
Sobic.001G274900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G204400 M-phase phosphoprotein 10, putative, expressed K14559: U3 small nucleolar RNA-associated protein MPP10
2 Sobic.001G186401 - -
3 Sobic.004G010800 - -
4 Sobic.003G040000 tRNA synthetase class II core domain containing protein, expressed K01892: HARS, histidyl-tRNA synthetase
5 Sobic.009G103600 MEE12, putative, expressed -
6 Sobic.003G109700 expressed protein -
7 Sobic.001G186500 expressed protein -
8 Sobic.008G125600 - -
9 Sobic.004G225000 -(PubMedID : 27964718)@nitrilase, putative, expressed K01501: nitrilase
10 Sobic.010G276900 - -
11 Sobic.007G189500 - -
12 Sobic.001G111900 - -
13 Sobic.002G396000 XPA-binding protein 2, putative, expressed K12867: SYF1, pre-mRNA-splicing factor SYF1
14 Sobic.008G000900 - -
15 Sobic.006G052500 2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component, mitochondrial precursor, putative, expressed K00164: OGDH, 2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component
16 Sobic.001G171600 PPR repeat containing protein, expressed K17964: leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial
17 Sobic.010G076300 - -
18 Sobic.003G258900 ZOS3-17 - C2H2 zinc finger protein, expressed K12827: SF3A3, SAP61, splicing factor 3A subunit 3
19 Sobic.002G114400 GAGA-binding protein, putative, expressed -
20 Sobic.008G011100 OsNucAP2 - Putative Nucleoporin Autopeptidase homologue, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G274900 Sobic001G274900 Sobic009G204400 Sobic009G204400 Sobic001G274900--Sobic009G204400 Sobic001G186401 Sobic001G186401 Sobic001G274900--Sobic001G186401 Sobic004G010800 Sobic004G010800 Sobic001G274900--Sobic004G010800 Sobic003G040000 Sobic003G040000 Sobic001G274900--Sobic003G040000 Sobic009G103600 Sobic009G103600 Sobic001G274900--Sobic009G103600 Sobic003G109700 Sobic003G109700 Sobic001G274900--Sobic003G109700 Sobic001G186500 Sobic001G186500 Sobic001G274900--Sobic001G186500 Sobic008G125600 Sobic008G125600 Sobic001G274900--Sobic008G125600 Sobic004G225000 Sobic004G225000 Sobic001G274900--Sobic004G225000 Sobic001G171600 Sobic001G171600 Sobic009G204400--Sobic001G171600 Sobic009G204400--Sobic001G274900 Sobic010G276900 Sobic010G276900 Sobic009G204400--Sobic010G276900 Sobic003G258900 Sobic003G258900 Sobic009G204400--Sobic003G258900 Sobic010G007100 Sobic010G007100 Sobic009G204400--Sobic010G007100 Sobic006G086600 Sobic006G086600 Sobic009G204400--Sobic006G086600 Sobic002G275600 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Octagon: transcription factors


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