Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G186401.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S6A8
Pfam PF07762
Panther DB PTHR33074 PTHR33074:SF8
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g29090.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G186500 expressed protein -
2 Sobic.001G111900 - -
3 Sobic.002G396000 XPA-binding protein 2, putative, expressed K12867: SYF1, pre-mRNA-splicing factor SYF1
4 Sobic.003G113200 5-nucleotidase domain-containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.010G056000 GAGA-binding protein, putative, expressed -
6 Sobic.003G176600 expressed protein -
7 Sobic.003G258900 ZOS3-17 - C2H2 zinc finger protein, expressed K12827: SF3A3, SAP61, splicing factor 3A subunit 3
8 Sobic.006G145000 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
9 Sobic.003G280800 RNA recognition motif family protein, expressed K13094: RNA-binding protein 5/10
10 Sobic.006G021250 - -
11 Sobic.002G158700 TATA binding protein-associated factor, putative, expressed K03131: transcription initiation factor TFIID subunit 6
12 Sobic.005G019600 rp3 protein, putative, expressed -
13 Sobic.006G128900 cyclin-dependent kinase G-2, putative, expressed K08818: cell division cycle 2-like
14 Sobic.005G079025 - -
15 Sobic.005G077466 - -
16 Sobic.005G013000 OsFBX181 - F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.003G020000 - -
18 Sobic.008G024600 expressed protein -
19 Sobic.007G096000 expressed protein -
20 Sobic.009G040700 "OsPPKL2(Ortholog in rice:Zhan et al., 2012)"(PubMedID : 31659919)@serine/threonine protein phosphatase, putative, expressed K01090: protein phosphatase


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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