Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G186500.2
Synonym Sb01g016390
Functional annotation expressed protein
UniProt -
Pfam PF07762
Panther DB PTHR33074 PTHR33074:SF8
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g29090.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G186500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G186401 - -
2 Sobic.001G111900 - -
3 Sobic.003G113200 5-nucleotidase domain-containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.002G396000 XPA-binding protein 2, putative, expressed K12867: SYF1, pre-mRNA-splicing factor SYF1
5 Sobic.003G258900 ZOS3-17 - C2H2 zinc finger protein, expressed K12827: SF3A3, SAP61, splicing factor 3A subunit 3
6 Sobic.002G158700 TATA binding protein-associated factor, putative, expressed K03131: transcription initiation factor TFIID subunit 6
7 Sobic.002G051450 - -
8 Sobic.006G128900 cyclin-dependent kinase G-2, putative, expressed K08818: cell division cycle 2-like
9 Sobic.005G019600 rp3 protein, putative, expressed -
10 Sobic.005G079025 - -
11 Sobic.006G021250 - -
12 Sobic.006G145000 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
13 Sobic.003G176600 expressed protein -
14 Sobic.005G077466 - -
15 Sobic.001G464200 flap endonuclease, putative, expressed K10846: ERCC5, XPG, DNA excision repair protein ERCC-5
16 Sobic.005G015100 OsFBX291 - F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.003G280800 RNA recognition motif family protein, expressed K13094: RNA-binding protein 5/10
18 Sobic.004G256600 KH domain containing protein, putative, expressed K14945: protein quaking
19 Sobic.005G013000 OsFBX181 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.003G252200 DDT, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G186500 Sobic001G186500 Sobic001G186401 Sobic001G186401 Sobic001G186500--Sobic001G186401 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic001G186500--Sobic001G111900 Sobic003G113200 Sobic003G113200 Sobic001G186500--Sobic003G113200 Sobic002G396000 Sobic002G396000 Sobic001G186500--Sobic002G396000 Sobic003G258900 Sobic003G258900 Sobic001G186500--Sobic003G258900 Sobic002G158700 Sobic002G158700 Sobic001G186500--Sobic002G158700 Sobic002G051450 Sobic002G051450 Sobic001G186500--Sobic002G051450 Sobic006G128900 Sobic006G128900 Sobic001G186500--Sobic006G128900 Sobic005G019600 Sobic005G019600 Sobic001G186500--Sobic005G019600 Sobic001G186401--Sobic001G186500 Sobic001G186401--Sobic001G111900 Sobic001G186401--Sobic002G396000 Sobic001G186401--Sobic003G113200 Sobic010G056000 Sobic010G056000 Sobic001G186401--Sobic010G056000 Sobic003G176600 Sobic003G176600 Sobic001G186401--Sobic003G176600 Sobic001G186401--Sobic003G258900 Sobic006G145000 Sobic006G145000 Sobic001G186401--Sobic006G145000 Sobic003G280800 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Sobic005G019600--Sobic001G028900 Sobic005G019600--Sobic008G024600
Octagon: transcription factors


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