Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G258900.1
Synonym Sb03g031320, ATO
Functional annotation ZOS3-17 - C2H2 zinc finger protein, expressed
UniProt C5XGS1
Pfam PF12108 PF16837 PF13297 PF11931
Panther DB PTHR12786 PTHR12786:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology K12827; SF3A3, SAP61, splicing factor 3A subunit 3
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G06160 : splicing factor-related
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g50850.1 : ZOS3-17 - C2H2 zinc finger protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a028018 , Zm00025a049575
Brachypodium -
Barley HORVU3Hr1G063220.2 , HORVU3Hr1G063220.3 , HORVU3Hr1G063220.1 , HORVU3Hr1G063220.6 , HORVU3Hr1G063220.7 , HORVU3Hr1G063220.4 , HORVU3Hr1G063220.5
Wheat TraesCS3D02G266300 , TraesCS3D02G266300 , TraesCS3D02G266300 , TraesCS7A02G325300 , TraesCS7A02G325300 , TraesCS7B02G226000 , TraesCS3B02G299500 , TraesCS7D02G321900 , TraesCS3A02G266200 , TraesCS3A02G266200
Populus PNS23563 , PNS99913 , PNS99912 , PNS99911 , PNT08865


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cDNA sequences
Sobic.003G258900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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17 Sobic.007G071950 - -
18 Sobic.005G059200 bromodomain domain containing protein, expressed -
19 Sobic.003G440700 leucine rich repeat domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.001G186401 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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