Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G059200.1
Synonym
Functional annotation bromodomain domain containing protein, expressed
UniProt C5Y626
Pfam PF00439
Panther DB PTHR22880 PTHR22880:SF155
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G46550 : DNA-binding bromodomain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g32420.3 : bromodomain domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a012846 , Zm00025a033989
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G258900 ZOS3-17 - C2H2 zinc finger protein, expressed K12827: SF3A3, SAP61, splicing factor 3A subunit 3
2 Sobic.009G145101 - -
3 Sobic.001G246200 MBTB49 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
4 Sobic.009G251200 expressed protein -
5 Sobic.001G081000 nucleotide-binding protein-like, putative, expressed K03593: mrp, ATP-binding protein involved in chromosome partitioning
6 Sobic.008G101000 powdery mildew resistance protein PM3b, putative, expressed -
7 Sobic.009G221000 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
8 Sobic.003G189333 - -
9 Sobic.002G223401 - -
10 Sobic.003G106200 expressed protein K13144: integrator complex subunit 7
11 Sobic.001G171600 PPR repeat containing protein, expressed K17964: leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial
12 Sobic.003G221600 expressed protein -
13 Sobic.006G226300 SDA1, putative, expressed K14856: SDA1, protein SDA1
14 Sobic.006G185200 RNA polymerase IV subunit, putative, expressed K16250: DNA-directed RNA polymerase IV subunit 1
15 Sobic.005G173366 - -
16 Sobic.002G275600 RFC1 - Putative clamp loader of PCNA, replication factor C subunit 1, expressed K10754: replication factor C subunit 1
17 Sobic.008G185300 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.004G204200 EMB2423, putative, expressed K11137: TELO2, telomere length regulation protein
19 Sobic.007G099000 - -
20 Sobic.005G160100 RFC1 - Putative clamp loader of PCNA, replication factor C subunit 1, expressed K10754: replication factor C subunit 1


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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