Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G221000.2,Sobic.009G221000.1
Synonym
Functional annotation NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6P9U3 , A0A1Z5R4L8
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF414
NCBI CDD KOG1947; Leucine rich repeat proteins, some proteins contain F-box
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G14470 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g53160.1 : NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G019600 rp3 protein, putative, expressed -
2 Sobic.005G032800 splicing factor, putative, expressed K13109: IK, RED, IK cytokine
3 Sobic.002G173000 disease resistance protein RGA2, putative, expressed -
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10 Sobic.001G228800 - -
11 Sobic.005G090401 - -
12 Sobic.003G252200 DDT, putative, expressed -
13 Sobic.003G171200 caffeine-induced death protein 1, putative, expressed -
14 Sobic.005G154850 - K00029: E1.1.1.40, malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)(NADP+)
15 Sobic.006G021250 - -
16 Sobic.002G169633 - -
17 Sobic.001G474600 calmodulin-binding transcription activator, putative, expressed -
18 Sobic.003G280800 RNA recognition motif family protein, expressed K13094: RNA-binding protein 5/10
19 Sobic.005G110200 - -
20 Sobic.007G099000 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G221000 Sobic009G221000 Sobic005G019600 Sobic005G019600 Sobic009G221000--Sobic005G019600 Sobic005G032800 Sobic005G032800 Sobic009G221000--Sobic005G032800 Sobic002G173000 Sobic002G173000 Sobic009G221000--Sobic002G173000 Sobic008G101000 Sobic008G101000 Sobic009G221000--Sobic008G101000 Sobic005G209100 Sobic005G209100 Sobic009G221000--Sobic005G209100 Sobic002G161900 Sobic002G161900 Sobic009G221000--Sobic002G161900 Sobic008G027000 Sobic008G027000 Sobic009G221000--Sobic008G027000 Sobic003G113200 Sobic003G113200 Sobic009G221000--Sobic003G113200 Sobic008G185300 Sobic008G185300 Sobic009G221000--Sobic008G185300 Sobic005G019600--Sobic009G221000 Sobic005G019600--Sobic002G161900 Sobic005G019600--Sobic002G173000 Sobic005G019600--Sobic005G032800 Sobic006G128900 Sobic006G128900 Sobic005G019600--Sobic006G128900 Sobic001G474600 Sobic001G474600 Sobic005G019600--Sobic001G474600 Sobic005G019600--Sobic003G113200 Sobic001G028900 Sobic001G028900 Sobic005G019600--Sobic001G028900 Sobic008G024600 Sobic008G024600 Sobic005G019600--Sobic008G024600 Sobic003G280800 Sobic003G280800 Sobic005G032800--Sobic003G280800 Sobic005G032800--Sobic001G474600 Sobic005G032800--Sobic002G173000 Sobic006G021250 Sobic006G021250 Sobic005G032800--Sobic006G021250 Sobic002G134200 Sobic002G134200 Sobic005G032800--Sobic002G134200 Sobic002G169633 Sobic002G169633 Sobic005G032800--Sobic002G169633 Sobic001G498600 Sobic001G498600 Sobic005G032800--Sobic001G498600 Sobic010G112000 Sobic010G112000 Sobic005G032800--Sobic010G112000 Sobic001G292200 Sobic001G292200 Sobic005G032800--Sobic001G292200 Sobic006G182900 Sobic006G182900 Sobic002G173000--Sobic006G182900 Sobic001G214300 Sobic001G214300 Sobic002G173000--Sobic001G214300 Sobic002G173000--Sobic005G032800 Sobic002G173000--Sobic006G021250 Sobic010G248700 Sobic010G248700 Sobic002G173000--Sobic010G248700 Sobic002G173000--Sobic008G027000 Sobic001G287201 Sobic001G287201 Sobic002G173000--Sobic001G287201 Sobic001G318432 Sobic001G318432 Sobic002G173000--Sobic001G318432 Sobic002G173000--Sobic001G474600 Sobic008G101000--Sobic009G221000 Sobic008G101000--Sobic008G185300 Sobic001G388250 Sobic001G388250 Sobic008G101000--Sobic001G388250 Sobic005G059200 Sobic005G059200 Sobic008G101000--Sobic005G059200 Sobic005G110200 Sobic005G110200 Sobic008G101000--Sobic005G110200 Sobic008G101000--Sobic005G209100 Sobic010G141800 Sobic010G141800 Sobic008G101000--Sobic010G141800 Sobic005G136900 Sobic005G136900 Sobic008G101000--Sobic005G136900 Sobic002G409700 Sobic002G409700 Sobic008G101000--Sobic002G409700 Sobic005G209100--Sobic009G221000 Sobic005G209100--Sobic008G185300 Sobic005G209100--Sobic005G032800 Sobic001G228800 Sobic001G228800 Sobic005G209100--Sobic001G228800 Sobic001G178700 Sobic001G178700 Sobic005G209100--Sobic001G178700 Sobic009G010600 Sobic009G010600 Sobic005G209100--Sobic009G010600 Sobic008G009900 Sobic008G009900 Sobic005G209100--Sobic008G009900 Sobic005G209100--Sobic008G101000 Sobic006G003400 Sobic006G003400 Sobic005G209100--Sobic006G003400 Sobic002G161900--Sobic005G019600 Sobic002G161900--Sobic010G112000 Sobic002G161900--Sobic002G173000 Sobic002G161900--Sobic005G032800 Sobic002G161900--Sobic001G474600 Sobic002G161900--Sobic009G221000 Sobic008G016300 Sobic008G016300 Sobic002G161900--Sobic008G016300 Sobic001G280900 Sobic001G280900 Sobic002G161900--Sobic001G280900 Sobic007G020500 Sobic007G020500 Sobic002G161900--Sobic007G020500 Sobic001G272532 Sobic001G272532 Sobic008G027000--Sobic001G272532 Sobic003G020000 Sobic003G020000 Sobic008G027000--Sobic003G020000 Sobic008G027000--Sobic002G173000 Sobic009G104201 Sobic009G104201 Sobic008G027000--Sobic009G104201 Sobic010G225226 Sobic010G225226 Sobic008G027000--Sobic010G225226 Sobic008G026900 Sobic008G026900 Sobic008G027000--Sobic008G026900 Sobic005G090401 Sobic005G090401 Sobic008G027000--Sobic005G090401 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic008G027000--Sobic004G007100 Sobic003G056100 Sobic003G056100 Sobic008G027000--Sobic003G056100 Sobic003G113200--Sobic006G128900 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic003G113200--Sobic001G111900 Sobic003G113200--Sobic006G021250 Sobic003G113200--Sobic003G280800 Sobic005G039500 Sobic005G039500 Sobic003G113200--Sobic005G039500 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic003G113200--Sobic007G178700 Sobic006G209850 Sobic006G209850 Sobic003G113200--Sobic006G209850 Sobic003G113200--Sobic008G024600 Sobic003G113200--Sobic005G032800 Sobic008G185300--Sobic005G110200 Sobic008G185300--Sobic005G032800 Sobic004G263600 Sobic004G263600 Sobic008G185300--Sobic004G263600 Sobic010G239600 Sobic010G239600 Sobic008G185300--Sobic010G239600 Sobic005G110300 Sobic005G110300 Sobic008G185300--Sobic005G110300 Sobic008G185300--Sobic002G409700 Sobic008G185300--Sobic002G169633 Sobic008G185300--Sobic005G209100 Sobic008G185300--Sobic009G221000
Octagon: transcription factors


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