Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G228800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QKG4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.001G228800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G032800 splicing factor, putative, expressed K13109: IK, RED, IK cytokine
2 Sobic.005G209100 SCARECROW, putative, expressed -
3 Sobic.003G113200 5-nucleotidase domain-containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.005G090401 - -
5 Sobic.005G110200 - -
6 Sobic.009G221000 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
7 Sobic.008G185300 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.003G280800 RNA recognition motif family protein, expressed K13094: RNA-binding protein 5/10
9 Sobic.002G053000 expressed protein -
10 Sobic.008G024600 expressed protein -
11 Sobic.006G021250 - -
12 Sobic.006G131500 serine/threonine-protein kinase GCN2, putative, expressed K16196: eukaryotic translation initiation factor 2-alpha kinase 4
13 Sobic.001G292200 dynamin family protein, putative, expressed -
14 Sobic.001G474600 calmodulin-binding transcription activator, putative, expressed -
15 Sobic.003G252200 DDT, putative, expressed -
16 Sobic.004G204200 EMB2423, putative, expressed K11137: TELO2, telomere length regulation protein
17 Sobic.005G019600 rp3 protein, putative, expressed -
18 Sobic.001G186500 expressed protein -
19 Sobic.006G209850 - -
20 Sobic.001G071400 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K11293: HIRA, protein HIRA/HIR1


Gene co-expression network
sample Sobic001G228800 Sobic001G228800 Sobic005G032800 Sobic005G032800 Sobic001G228800--Sobic005G032800 Sobic005G209100 Sobic005G209100 Sobic001G228800--Sobic005G209100 Sobic003G113200 Sobic003G113200 Sobic001G228800--Sobic003G113200 Sobic005G090401 Sobic005G090401 Sobic001G228800--Sobic005G090401 Sobic005G110200 Sobic005G110200 Sobic001G228800--Sobic005G110200 Sobic009G221000 Sobic009G221000 Sobic001G228800--Sobic009G221000 Sobic008G185300 Sobic008G185300 Sobic001G228800--Sobic008G185300 Sobic003G280800 Sobic003G280800 Sobic001G228800--Sobic003G280800 Sobic002G053000 Sobic002G053000 Sobic001G228800--Sobic002G053000 Sobic005G032800--Sobic003G280800 Sobic001G474600 Sobic001G474600 Sobic005G032800--Sobic001G474600 Sobic002G173000 Sobic002G173000 Sobic005G032800--Sobic002G173000 Sobic006G021250 Sobic006G021250 Sobic005G032800--Sobic006G021250 Sobic002G134200 Sobic002G134200 Sobic005G032800--Sobic002G134200 Sobic002G169633 Sobic002G169633 Sobic005G032800--Sobic002G169633 Sobic001G498600 Sobic001G498600 Sobic005G032800--Sobic001G498600 Sobic010G112000 Sobic010G112000 Sobic005G032800--Sobic010G112000 Sobic001G292200 Sobic001G292200 Sobic005G032800--Sobic001G292200 Sobic005G209100--Sobic009G221000 Sobic005G209100--Sobic008G185300 Sobic005G209100--Sobic005G032800 Sobic005G209100--Sobic001G228800 Sobic001G178700 Sobic001G178700 Sobic005G209100--Sobic001G178700 Sobic009G010600 Sobic009G010600 Sobic005G209100--Sobic009G010600 Sobic008G009900 Sobic008G009900 Sobic005G209100--Sobic008G009900 Sobic008G101000 Sobic008G101000 Sobic005G209100--Sobic008G101000 Sobic006G003400 Sobic006G003400 Sobic005G209100--Sobic006G003400 Sobic006G128900 Sobic006G128900 Sobic003G113200--Sobic006G128900 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic003G113200--Sobic001G111900 Sobic003G113200--Sobic006G021250 Sobic003G113200--Sobic003G280800 Sobic005G039500 Sobic005G039500 Sobic003G113200--Sobic005G039500 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic003G113200--Sobic007G178700 Sobic006G209850 Sobic006G209850 Sobic003G113200--Sobic006G209850 Sobic008G024600 Sobic008G024600 Sobic003G113200--Sobic008G024600 Sobic003G113200--Sobic005G032800 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic005G090401--Sobic004G007100 Sobic006G182900 Sobic006G182900 Sobic005G090401--Sobic006G182900 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic005G090401--Sobic006G048500 Sobic006G048600 Sobic006G048600 Sobic005G090401--Sobic006G048600 Sobic005G090401--Sobic002G173000 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic005G090401--Sobic002G243900 Sobic005G090401--Sobic005G110200 Sobic007G161300 Sobic007G161300 Sobic005G090401--Sobic007G161300 Sobic005G090401--Sobic005G032800 Sobic005G110300 Sobic005G110300 Sobic005G110200--Sobic005G110300 Sobic005G110200--Sobic002G134200 Sobic007G116200 Sobic007G116200 Sobic005G110200--Sobic007G116200 Sobic005G110200--Sobic008G185300 Sobic005G110200--Sobic005G090401 Sobic005G110200--Sobic006G182900 Sobic005G110200--Sobic003G280800 Sobic005G110200--Sobic005G032800 Sobic006G032500 Sobic006G032500 Sobic005G110200--Sobic006G032500 Sobic005G019600 Sobic005G019600 Sobic009G221000--Sobic005G019600 Sobic009G221000--Sobic005G032800 Sobic009G221000--Sobic002G173000 Sobic009G221000--Sobic008G101000 Sobic009G221000--Sobic005G209100 Sobic002G161900 Sobic002G161900 Sobic009G221000--Sobic002G161900 Sobic008G027000 Sobic008G027000 Sobic009G221000--Sobic008G027000 Sobic009G221000--Sobic003G113200 Sobic009G221000--Sobic008G185300 Sobic008G185300--Sobic005G110200 Sobic008G185300--Sobic005G032800 Sobic004G263600 Sobic004G263600 Sobic008G185300--Sobic004G263600 Sobic010G239600 Sobic010G239600 Sobic008G185300--Sobic010G239600 Sobic008G185300--Sobic005G110300 Sobic002G409700 Sobic002G409700 Sobic008G185300--Sobic002G409700 Sobic008G185300--Sobic002G169633 Sobic008G185300--Sobic005G209100 Sobic008G185300--Sobic009G221000 Sobic002G309600 Sobic002G309600 Sobic003G280800--Sobic002G309600 Sobic001G071400 Sobic001G071400 Sobic003G280800--Sobic001G071400 Sobic003G280800--Sobic002G134200 Sobic003G280800--Sobic006G209850 Sobic003G119000 Sobic003G119000 Sobic003G280800--Sobic003G119000 Sobic003G280800--Sobic001G474600 Sobic007G117400 Sobic007G117400 Sobic003G280800--Sobic007G117400 Sobic006G216800 Sobic006G216800 Sobic003G280800--Sobic006G216800 Sobic003G372700 Sobic003G372700 Sobic003G280800--Sobic003G372700 Sobic002G053000--Sobic008G024600 Sobic002G053000--Sobic003G280800 Sobic002G053000--Sobic006G209850 Sobic002G053000--Sobic006G128900 Sobic009G210500 Sobic009G210500 Sobic002G053000--Sobic009G210500 Sobic010G129200 Sobic010G129200 Sobic002G053000--Sobic010G129200 Sobic003G445400 Sobic003G445400 Sobic002G053000--Sobic003G445400 Sobic007G167500 Sobic007G167500 Sobic002G053000--Sobic007G167500 Sobic005G045300 Sobic005G045300 Sobic002G053000--Sobic005G045300
Octagon: transcription factors


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