Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G053000.2
Synonym Sb02g004450
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6Q9C1
Pfam PF03735
Panther DB PTHR31917 PTHR31917:SF19
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G32440 : Plant Tudor-like RNA-binding protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g08220.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a045175 , Zm00025a016083
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G053000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G024600 expressed protein -
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13 Sobic.007G096000 expressed protein -
14 Sobic.010G277500 expressed protein -
15 Sobic.004G031700 expressed protein -
16 Sobic.007G096600 - -
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19 Sobic.008G084700 - -
20 Sobic.001G407200 SacI homology domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G053000 Sobic002G053000 Sobic008G024600 Sobic008G024600 Sobic002G053000--Sobic008G024600 Sobic003G280800 Sobic003G280800 Sobic002G053000--Sobic003G280800 Sobic006G209850 Sobic006G209850 Sobic002G053000--Sobic006G209850 Sobic006G128900 Sobic006G128900 Sobic002G053000--Sobic006G128900 Sobic009G210500 Sobic009G210500 Sobic002G053000--Sobic009G210500 Sobic010G129200 Sobic010G129200 Sobic002G053000--Sobic010G129200 Sobic003G445400 Sobic003G445400 Sobic002G053000--Sobic003G445400 Sobic007G167500 Sobic007G167500 Sobic002G053000--Sobic007G167500 Sobic005G045300 Sobic005G045300 Sobic002G053000--Sobic005G045300 Sobic008G024600--Sobic006G209850 Sobic008G024600--Sobic002G053000 Sobic008G024600--Sobic006G128900 Sobic009G040700 Sobic009G040700 Sobic008G024600--Sobic009G040700 Sobic008G024600--Sobic010G129200 Sobic002G158700 Sobic002G158700 Sobic008G024600--Sobic002G158700 Sobic002G343800 Sobic002G343800 Sobic008G024600--Sobic002G343800 Sobic008G024600--Sobic003G280800 Sobic008G024600--Sobic005G045300 Sobic002G309600 Sobic002G309600 Sobic003G280800--Sobic002G309600 Sobic001G071400 Sobic001G071400 Sobic003G280800--Sobic001G071400 Sobic002G134200 Sobic002G134200 Sobic003G280800--Sobic002G134200 Sobic003G280800--Sobic006G209850 Sobic003G119000 Sobic003G119000 Sobic003G280800--Sobic003G119000 Sobic001G474600 Sobic001G474600 Sobic003G280800--Sobic001G474600 Sobic007G117400 Sobic007G117400 Sobic003G280800--Sobic007G117400 Sobic006G216800 Sobic006G216800 Sobic003G280800--Sobic006G216800 Sobic003G372700 Sobic003G372700 Sobic003G280800--Sobic003G372700 Sobic006G209850--Sobic006G128900 Sobic001G511500 Sobic001G511500 Sobic006G209850--Sobic001G511500 Sobic006G209850--Sobic003G280800 Sobic010G277500 Sobic010G277500 Sobic006G209850--Sobic010G277500 Sobic006G209850--Sobic008G024600 Sobic006G209850--Sobic002G053000 Sobic006G209850--Sobic010G129200 Sobic004G145500 Sobic004G145500 Sobic006G209850--Sobic004G145500 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic006G209850--Sobic002G243900 Sobic006G128900--Sobic006G209850 Sobic006G128900--Sobic001G511500 Sobic004G031700 Sobic004G031700 Sobic006G128900--Sobic004G031700 Sobic009G000500 Sobic009G000500 Sobic006G128900--Sobic009G000500 Sobic001G090400 Sobic001G090400 Sobic006G128900--Sobic001G090400 Sobic006G128900--Sobic003G445400 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic006G128900--Sobic003G268300 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic006G128900--Sobic001G477800 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic006G128900--Sobic002G157000 Sobic002G320500 Sobic002G320500 Sobic009G210500--Sobic002G320500 Sobic007G065400 Sobic007G065400 Sobic009G210500--Sobic007G065400 Sobic009G210500--Sobic002G157000 Sobic006G032400 Sobic006G032400 Sobic009G210500--Sobic006G032400 Sobic009G210500--Sobic003G268300 Sobic001G407200 Sobic001G407200 Sobic009G210500--Sobic001G407200 Sobic009G210500--Sobic007G167500 Sobic009G210500--Sobic001G090400 Sobic009G210500--Sobic004G145500 Sobic010G129200--Sobic005G045300 Sobic005G013200 Sobic005G013200 Sobic010G129200--Sobic005G013200 Sobic009G126400 Sobic009G126400 Sobic010G129200--Sobic009G126400 Sobic010G129200--Sobic008G024600 Sobic010G129200--Sobic006G209850 Sobic010G129200--Sobic001G407200 Sobic010G129200--Sobic002G053000 Sobic010G129200--Sobic010G277500 Sobic010G136600 Sobic010G136600 Sobic010G129200--Sobic010G136600 Sobic003G445400--Sobic004G031700 Sobic003G445400--Sobic009G000500 Sobic008G067600 Sobic008G067600 Sobic003G445400--Sobic008G067600 Sobic003G307000 Sobic003G307000 Sobic003G445400--Sobic003G307000 Sobic003G445400--Sobic002G158700 Sobic003G445400--Sobic006G128900 Sobic007G096000 Sobic007G096000 Sobic003G445400--Sobic007G096000 Sobic003G445400--Sobic001G511500 Sobic008G153000 Sobic008G153000 Sobic003G445400--Sobic008G153000 Sobic007G167500--Sobic003G119000 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic007G167500--Sobic002G006900 Sobic003G397800 Sobic003G397800 Sobic007G167500--Sobic003G397800 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic007G167500--Sobic007G096600 Sobic010G101800 Sobic010G101800 Sobic007G167500--Sobic010G101800 Sobic007G167500--Sobic007G065400 Sobic007G167500--Sobic009G210500 Sobic003G332800 Sobic003G332800 Sobic007G167500--Sobic003G332800 Sobic007G167500--Sobic003G372700 Sobic001G512700 Sobic001G512700 Sobic005G045300--Sobic001G512700 Sobic003G408500 Sobic003G408500 Sobic005G045300--Sobic003G408500 Sobic005G045300--Sobic010G129200 Sobic005G045300--Sobic003G445400 Sobic009G166300 Sobic009G166300 Sobic005G045300--Sobic009G166300 Sobic005G045300--Sobic004G031700 Sobic005G045300--Sobic006G128900 Sobic005G045300--Sobic002G006900 Sobic005G045300--Sobic008G024600
Octagon: transcription factors


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