Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G210500.3,Sobic.009G210500.1,Sobic.009G210500.2
Synonym Sb09g026660
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PAA1 , A0A1B6P9Q5 , A0A1Z5R3Q2
Pfam PF09405
Panther DB PTHR22814 PTHR22814:SF87
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G80000 : CASC3/Barentsz eIF4AIII binding
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g45830.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a044348 , Zm00025a038021
Brachypodium KQK05212
Barley HORVU1Hr1G080750.4 , HORVU1Hr1G080750.5 , HORVU1Hr1G080750.3 , HORVU1Hr1G080750.2 , HORVU1Hr1G080750.1
Wheat TraesCS1B02G371100 , TraesCS1A02G352000 , TraesCS1A02G352000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G320500 MYB family transcription factor, putative, expressed -
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20 Sobic.002G248400 ENT domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G210500 Sobic009G210500 Sobic002G320500 Sobic002G320500 Sobic009G210500--Sobic002G320500 Sobic007G065400 Sobic007G065400 Sobic009G210500--Sobic007G065400 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic009G210500--Sobic002G157000 Sobic006G032400 Sobic006G032400 Sobic009G210500--Sobic006G032400 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic009G210500--Sobic003G268300 Sobic001G407200 Sobic001G407200 Sobic009G210500--Sobic001G407200 Sobic007G167500 Sobic007G167500 Sobic009G210500--Sobic007G167500 Sobic001G090400 Sobic001G090400 Sobic009G210500--Sobic001G090400 Sobic004G145500 Sobic004G145500 Sobic009G210500--Sobic004G145500 Sobic002G320500--Sobic002G157000 Sobic002G248400 Sobic002G248400 Sobic002G320500--Sobic002G248400 Sobic009G065100 Sobic009G065100 Sobic002G320500--Sobic009G065100 Sobic002G320500--Sobic009G210500 Sobic006G133800 Sobic006G133800 Sobic002G320500--Sobic006G133800 Sobic001G107500 Sobic001G107500 Sobic002G320500--Sobic001G107500 Sobic002G320500--Sobic006G032400 Sobic009G000500 Sobic009G000500 Sobic002G320500--Sobic009G000500 Sobic002G320500--Sobic001G090400 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic007G065400--Sobic002G006900 Sobic002G191800 Sobic002G191800 Sobic007G065400--Sobic002G191800 Sobic008G009700 Sobic008G009700 Sobic007G065400--Sobic008G009700 Sobic009G040600 Sobic009G040600 Sobic007G065400--Sobic009G040600 Sobic007G065400--Sobic004G145500 Sobic007G065400--Sobic009G210500 Sobic003G119000 Sobic003G119000 Sobic007G065400--Sobic003G119000 Sobic003G372700 Sobic003G372700 Sobic007G065400--Sobic003G372700 Sobic008G028700 Sobic008G028700 Sobic007G065400--Sobic008G028700 Sobic002G157000--Sobic002G248400 Sobic002G157000--Sobic002G320500 Sobic003G200200 Sobic003G200200 Sobic002G157000--Sobic003G200200 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic002G157000--Sobic001G420200 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic002G157000--Sobic008G173900 Sobic002G157000--Sobic003G268300 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic002G157000--Sobic001G162300 Sobic003G108700 Sobic003G108700 Sobic002G157000--Sobic003G108700 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic002G157000--Sobic001G094000 Sobic006G032400--Sobic002G320500 Sobic006G032400--Sobic002G248400 Sobic005G015900 Sobic005G015900 Sobic006G032400--Sobic005G015900 Sobic003G241200 Sobic003G241200 Sobic006G032400--Sobic003G241200 Sobic006G032400--Sobic009G210500 Sobic006G032400--Sobic001G090400 Sobic006G173100 Sobic006G173100 Sobic006G032400--Sobic006G173100 Sobic004G271000 Sobic004G271000 Sobic006G032400--Sobic004G271000 Sobic006G032400--Sobic001G094000 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic003G268300--Sobic007G096600 Sobic003G268300--Sobic002G157000 Sobic003G268300--Sobic001G420200 Sobic003G268300--Sobic003G200200 Sobic003G268300--Sobic002G248400 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic003G268300--Sobic009G127900 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic003G268300--Sobic007G178700 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic003G268300--Sobic007G037900 Sobic003G268300--Sobic008G173900 Sobic001G407200--Sobic009G210500 Sobic008G162900 Sobic008G162900 Sobic001G407200--Sobic008G162900 Sobic005G013200 Sobic005G013200 Sobic001G407200--Sobic005G013200 Sobic002G144933 Sobic002G144933 Sobic001G407200--Sobic002G144933 Sobic010G129200 Sobic010G129200 Sobic001G407200--Sobic010G129200 Sobic010G277500 Sobic010G277500 Sobic001G407200--Sobic010G277500 Sobic009G126400 Sobic009G126400 Sobic001G407200--Sobic009G126400 Sobic004G084300 Sobic004G084300 Sobic001G407200--Sobic004G084300 Sobic008G047800 Sobic008G047800 Sobic001G407200--Sobic008G047800 Sobic007G167500--Sobic003G119000 Sobic007G167500--Sobic002G006900 Sobic003G397800 Sobic003G397800 Sobic007G167500--Sobic003G397800 Sobic007G167500--Sobic007G096600 Sobic010G101800 Sobic010G101800 Sobic007G167500--Sobic010G101800 Sobic007G167500--Sobic007G065400 Sobic007G167500--Sobic009G210500 Sobic003G332800 Sobic003G332800 Sobic007G167500--Sobic003G332800 Sobic007G167500--Sobic003G372700 Sobic008G067600 Sobic008G067600 Sobic001G090400--Sobic008G067600 Sobic001G090400--Sobic006G173100 Sobic004G057400 Sobic004G057400 Sobic001G090400--Sobic004G057400 Sobic001G176200 Sobic001G176200 Sobic001G090400--Sobic001G176200 Sobic001G090400--Sobic002G320500 Sobic001G090400--Sobic009G000500 Sobic002G157300 Sobic002G157300 Sobic001G090400--Sobic002G157300 Sobic004G205600 Sobic004G205600 Sobic001G090400--Sobic004G205600 Sobic001G090400--Sobic002G248400 Sobic004G145500--Sobic007G065400 Sobic004G145500--Sobic008G173900 Sobic004G145500--Sobic002G144933 Sobic004G145500--Sobic008G009700 Sobic001G306900 Sobic001G306900 Sobic004G145500--Sobic001G306900 Sobic004G145500--Sobic003G200200 Sobic004G145500--Sobic009G210500 Sobic010G136600 Sobic010G136600 Sobic004G145500--Sobic010G136600 Sobic001G241200 Sobic001G241200 Sobic004G145500--Sobic001G241200
Octagon: transcription factors


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