Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G129200.1,Sobic.010G129200.4,Sobic.010G129200.2,Sobic.010G129200.5,Sobic.010G129200.7,Sobic.010G129200.3,Sobic.010G129200.6
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YIU1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G045300 PX domain containing protein, putative, expressed K17925: sorting nexin-13
2 Sobic.005G013200 BAH domain containing protein, expressed -
3 Sobic.009G126400 glycine-rich protein, putative, expressed K14845: RAI1, RAT1-interacting protein
4 Sobic.008G024600 expressed protein -
5 Sobic.006G209850 - -
6 Sobic.001G407200 SacI homology domain containing protein, expressed -
7 Sobic.002G053000 expressed protein -
8 Sobic.010G277500 expressed protein -
9 Sobic.010G136600 - -
10 Sobic.003G390400 expressed protein -
11 Sobic.008G162900 peroxisome assembly protein, putative, expressed K06664: PEX2, peroxin-2
12 Sobic.003G200200 SIT4 phosphatase-associated protein domain containing protein, expressed K15501: PPP6R3, serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 3
13 Sobic.009G210500 expressed protein -
14 Sobic.008G047800 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K15361: WDR48, WD repeat-containing protein 48
15 Sobic.007G096600 - -
16 Sobic.004G219100 phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit C, putative, expressed K03859: PIGC, phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit C
17 Sobic.002G006900 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed -
18 Sobic.003G170100 - -
19 Sobic.001G155000 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2, putative, expressed K03010: RPB2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2
20 Sobic.006G128900 cyclin-dependent kinase G-2, putative, expressed K08818: cell division cycle 2-like


Gene co-expression network
sample Sobic010G129200 Sobic010G129200 Sobic005G045300 Sobic005G045300 Sobic010G129200--Sobic005G045300 Sobic005G013200 Sobic005G013200 Sobic010G129200--Sobic005G013200 Sobic009G126400 Sobic009G126400 Sobic010G129200--Sobic009G126400 Sobic008G024600 Sobic008G024600 Sobic010G129200--Sobic008G024600 Sobic006G209850 Sobic006G209850 Sobic010G129200--Sobic006G209850 Sobic001G407200 Sobic001G407200 Sobic010G129200--Sobic001G407200 Sobic002G053000 Sobic002G053000 Sobic010G129200--Sobic002G053000 Sobic010G277500 Sobic010G277500 Sobic010G129200--Sobic010G277500 Sobic010G136600 Sobic010G136600 Sobic010G129200--Sobic010G136600 Sobic001G512700 Sobic001G512700 Sobic005G045300--Sobic001G512700 Sobic003G408500 Sobic003G408500 Sobic005G045300--Sobic003G408500 Sobic005G045300--Sobic010G129200 Sobic003G445400 Sobic003G445400 Sobic005G045300--Sobic003G445400 Sobic009G166300 Sobic009G166300 Sobic005G045300--Sobic009G166300 Sobic004G031700 Sobic004G031700 Sobic005G045300--Sobic004G031700 Sobic006G128900 Sobic006G128900 Sobic005G045300--Sobic006G128900 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic005G045300--Sobic002G006900 Sobic005G045300--Sobic008G024600 Sobic002G103600 Sobic002G103600 Sobic005G013200--Sobic002G103600 Sobic005G013200--Sobic010G129200 Sobic008G162900 Sobic008G162900 Sobic005G013200--Sobic008G162900 Sobic005G013200--Sobic001G407200 Sobic001G222500 Sobic001G222500 Sobic005G013200--Sobic001G222500 Sobic002G408200 Sobic002G408200 Sobic005G013200--Sobic002G408200 Sobic008G028700 Sobic008G028700 Sobic005G013200--Sobic008G028700 Sobic001G251700 Sobic001G251700 Sobic005G013200--Sobic001G251700 Sobic004G084300 Sobic004G084300 Sobic005G013200--Sobic004G084300 Sobic003G052200 Sobic003G052200 Sobic009G126400--Sobic003G052200 Sobic009G040600 Sobic009G040600 Sobic009G126400--Sobic009G040600 Sobic008G047800 Sobic008G047800 Sobic009G126400--Sobic008G047800 Sobic003G280800 Sobic003G280800 Sobic009G126400--Sobic003G280800 Sobic009G126400--Sobic001G222500 Sobic009G126400--Sobic008G162900 Sobic007G096000 Sobic007G096000 Sobic009G126400--Sobic007G096000 Sobic004G208900 Sobic004G208900 Sobic009G126400--Sobic004G208900 Sobic002G309600 Sobic002G309600 Sobic009G126400--Sobic002G309600 Sobic008G024600--Sobic006G209850 Sobic008G024600--Sobic002G053000 Sobic008G024600--Sobic006G128900 Sobic009G040700 Sobic009G040700 Sobic008G024600--Sobic009G040700 Sobic008G024600--Sobic010G129200 Sobic002G158700 Sobic002G158700 Sobic008G024600--Sobic002G158700 Sobic002G343800 Sobic002G343800 Sobic008G024600--Sobic002G343800 Sobic008G024600--Sobic003G280800 Sobic008G024600--Sobic005G045300 Sobic006G209850--Sobic006G128900 Sobic001G511500 Sobic001G511500 Sobic006G209850--Sobic001G511500 Sobic006G209850--Sobic003G280800 Sobic006G209850--Sobic010G277500 Sobic006G209850--Sobic008G024600 Sobic006G209850--Sobic002G053000 Sobic006G209850--Sobic010G129200 Sobic004G145500 Sobic004G145500 Sobic006G209850--Sobic004G145500 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic006G209850--Sobic002G243900 Sobic009G210500 Sobic009G210500 Sobic001G407200--Sobic009G210500 Sobic001G407200--Sobic008G162900 Sobic001G407200--Sobic005G013200 Sobic002G144933 Sobic002G144933 Sobic001G407200--Sobic002G144933 Sobic001G407200--Sobic010G129200 Sobic001G407200--Sobic010G277500 Sobic001G407200--Sobic009G126400 Sobic001G407200--Sobic004G084300 Sobic001G407200--Sobic008G047800 Sobic002G053000--Sobic008G024600 Sobic002G053000--Sobic003G280800 Sobic002G053000--Sobic006G209850 Sobic002G053000--Sobic006G128900 Sobic002G053000--Sobic009G210500 Sobic002G053000--Sobic010G129200 Sobic002G053000--Sobic003G445400 Sobic007G167500 Sobic007G167500 Sobic002G053000--Sobic007G167500 Sobic002G053000--Sobic005G045300 Sobic010G277500--Sobic004G208900 Sobic010G277500--Sobic006G209850 Sobic007G065400 Sobic007G065400 Sobic010G277500--Sobic007G065400 Sobic009G260500 Sobic009G260500 Sobic010G277500--Sobic009G260500 Sobic010G277500--Sobic003G280800 Sobic004G009600 Sobic004G009600 Sobic010G277500--Sobic004G009600 Sobic010G277500--Sobic008G028700 Sobic004G258700 Sobic004G258700 Sobic010G277500--Sobic004G258700 Sobic006G216800 Sobic006G216800 Sobic010G277500--Sobic006G216800 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic010G136600--Sobic007G096600 Sobic010G136600--Sobic004G145500 Sobic010G136600--Sobic002G144933 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic010G136600--Sobic008G173900 Sobic010G136600--Sobic008G028700 Sobic010G136600--Sobic009G126400 Sobic010G136600--Sobic010G277500 Sobic010G136600--Sobic009G210500 Sobic010G136600--Sobic004G009600
Octagon: transcription factors


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