Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G219100.2,Sobic.004G219100.4,Sobic.004G219100.5,Sobic.004G219100.6,Sobic.004G219100.1,Sobic.004G219100.3
Synonym Sb04g026410, SETH1
Functional annotation phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit C, putative, expressed
UniProt C5XXS6
Pfam PF06432
Panther DB PTHR12982
NCBI CDD KOG3059; N-acetylglucosaminyltransferase complex, subunit PIG-C/GPI2, required for phosphatidylinositol biosynthesis
KEGG Orthology K03859; PIGC, phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit C
Gene Ontology GO:0017176; phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase activity GO:0016021integral component of membrane GO:0006506GPI anchor biosynthetic process


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G34980 : phosphatidylinositolglycan synthase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g40870.2,LOC_Os02g40870.1 : phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit C, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a032015
Brachypodium KQK00395
Barley HORVU6Hr1G058240.3 , HORVU6Hr1G058240.2 , HORVU6Hr1G058240.1 , HORVU6Hr1G058240.4
Wheat -
Populus PNT44197 , PNT54851


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G015900 dnaJ domain containing protein, expressed -
2 Sobic.001G407200 SacI homology domain containing protein, expressed -
3 Sobic.005G013200 BAH domain containing protein, expressed -
4 Sobic.002G320500 MYB family transcription factor, putative, expressed -
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6 Sobic.010G129200 - -
7 Sobic.006G032400 expressed protein -
8 Sobic.008G149800 histone acetyltransferase HAC5, putative, expressed K04498: EP300, CREBBP, E1A/CREB-binding protein
9 Sobic.001G303675 - -
10 Sobic.009G065100 splicing factor, putative, expressed K12850: pre-mRNA-splicing factor 38B
11 Sobic.001G176200 FHA domain containing protein, putative, expressed K13216: PPP1R8, nuclear inhibitor of protein phosphatase 1
12 Sobic.004G057400 copper-transporting ATPase, putative, expressed K17686: copA, ctpA, P-type Cu+ transporter
13 Sobic.002G053000 expressed protein -
14 Sobic.005G154500 OsFBX407 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.006G052300 dnaJ domain containing protein, expressed -
16 Sobic.003G445400 vacuolar fusion protein MON1 homolog A, putative, expressed -
17 Sobic.009G210500 expressed protein -
18 Sobic.001G090400 PHD-finger domain containing protein, putative, expressed K11346: inhibitor of growth protein 4
19 Sobic.001G167200 DNA-directed polymerase, putative, expressed K03511: DNA polymerase kappa
20 Sobic.004G067700 BRCA1-associated protein, putative, expressed K10632: BRCA1-associated protein


Gene co-expression network
sample Sobic004G219100 Sobic004G219100 Sobic005G015900 Sobic005G015900 Sobic004G219100--Sobic005G015900 Sobic001G407200 Sobic001G407200 Sobic004G219100--Sobic001G407200 Sobic005G013200 Sobic005G013200 Sobic004G219100--Sobic005G013200 Sobic002G320500 Sobic002G320500 Sobic004G219100--Sobic002G320500 Sobic002G158700 Sobic002G158700 Sobic004G219100--Sobic002G158700 Sobic010G129200 Sobic010G129200 Sobic004G219100--Sobic010G129200 Sobic006G032400 Sobic006G032400 Sobic004G219100--Sobic006G032400 Sobic008G149800 Sobic008G149800 Sobic004G219100--Sobic008G149800 Sobic001G303675 Sobic001G303675 Sobic004G219100--Sobic001G303675 Sobic005G015900--Sobic006G032400 Sobic004G031700 Sobic004G031700 Sobic005G015900--Sobic004G031700 Sobic005G015900--Sobic004G219100 Sobic001G176200 Sobic001G176200 Sobic005G015900--Sobic001G176200 Sobic005G015900--Sobic002G320500 Sobic001G090400 Sobic001G090400 Sobic005G015900--Sobic001G090400 Sobic005G015900--Sobic002G158700 Sobic005G015900--Sobic001G303675 Sobic003G445400 Sobic003G445400 Sobic005G015900--Sobic003G445400 Sobic009G210500 Sobic009G210500 Sobic001G407200--Sobic009G210500 Sobic008G162900 Sobic008G162900 Sobic001G407200--Sobic008G162900 Sobic001G407200--Sobic005G013200 Sobic002G144933 Sobic002G144933 Sobic001G407200--Sobic002G144933 Sobic001G407200--Sobic010G129200 Sobic010G277500 Sobic010G277500 Sobic001G407200--Sobic010G277500 Sobic009G126400 Sobic009G126400 Sobic001G407200--Sobic009G126400 Sobic004G084300 Sobic004G084300 Sobic001G407200--Sobic004G084300 Sobic008G047800 Sobic008G047800 Sobic001G407200--Sobic008G047800 Sobic002G103600 Sobic002G103600 Sobic005G013200--Sobic002G103600 Sobic005G013200--Sobic010G129200 Sobic005G013200--Sobic008G162900 Sobic005G013200--Sobic001G407200 Sobic001G222500 Sobic001G222500 Sobic005G013200--Sobic001G222500 Sobic002G408200 Sobic002G408200 Sobic005G013200--Sobic002G408200 Sobic008G028700 Sobic008G028700 Sobic005G013200--Sobic008G028700 Sobic001G251700 Sobic001G251700 Sobic005G013200--Sobic001G251700 Sobic005G013200--Sobic004G084300 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic002G320500--Sobic002G157000 Sobic002G248400 Sobic002G248400 Sobic002G320500--Sobic002G248400 Sobic009G065100 Sobic009G065100 Sobic002G320500--Sobic009G065100 Sobic002G320500--Sobic009G210500 Sobic006G133800 Sobic006G133800 Sobic002G320500--Sobic006G133800 Sobic001G107500 Sobic001G107500 Sobic002G320500--Sobic001G107500 Sobic002G320500--Sobic006G032400 Sobic009G000500 Sobic009G000500 Sobic002G320500--Sobic009G000500 Sobic002G320500--Sobic001G090400 Sobic003G401000 Sobic003G401000 Sobic002G158700--Sobic003G401000 Sobic001G464200 Sobic001G464200 Sobic002G158700--Sobic001G464200 Sobic001G167200 Sobic001G167200 Sobic002G158700--Sobic001G167200 Sobic002G158700--Sobic004G031700 Sobic002G158700--Sobic003G445400 Sobic007G000800 Sobic007G000800 Sobic002G158700--Sobic007G000800 Sobic007G061700 Sobic007G061700 Sobic002G158700--Sobic007G061700 Sobic002G158700--Sobic008G149800 Sobic002G396000 Sobic002G396000 Sobic002G158700--Sobic002G396000 Sobic005G045300 Sobic005G045300 Sobic010G129200--Sobic005G045300 Sobic010G129200--Sobic005G013200 Sobic010G129200--Sobic009G126400 Sobic008G024600 Sobic008G024600 Sobic010G129200--Sobic008G024600 Sobic006G209850 Sobic006G209850 Sobic010G129200--Sobic006G209850 Sobic010G129200--Sobic001G407200 Sobic002G053000 Sobic002G053000 Sobic010G129200--Sobic002G053000 Sobic010G129200--Sobic010G277500 Sobic010G136600 Sobic010G136600 Sobic010G129200--Sobic010G136600 Sobic006G032400--Sobic002G320500 Sobic006G032400--Sobic002G248400 Sobic006G032400--Sobic005G015900 Sobic003G241200 Sobic003G241200 Sobic006G032400--Sobic003G241200 Sobic006G032400--Sobic009G210500 Sobic006G032400--Sobic001G090400 Sobic006G173100 Sobic006G173100 Sobic006G032400--Sobic006G173100 Sobic004G271000 Sobic004G271000 Sobic006G032400--Sobic004G271000 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic006G032400--Sobic001G094000 Sobic006G116100 Sobic006G116100 Sobic008G149800--Sobic006G116100 Sobic008G153000 Sobic008G153000 Sobic008G149800--Sobic008G153000 Sobic008G149800--Sobic007G061700 Sobic002G357700 Sobic002G357700 Sobic008G149800--Sobic002G357700 Sobic002G164300 Sobic002G164300 Sobic008G149800--Sobic002G164300 Sobic004G246100 Sobic004G246100 Sobic008G149800--Sobic004G246100 Sobic008G149800--Sobic002G158700 Sobic005G154500 Sobic005G154500 Sobic008G149800--Sobic005G154500 Sobic001G155000 Sobic001G155000 Sobic008G149800--Sobic001G155000 Sobic001G306900 Sobic001G306900 Sobic001G303675--Sobic001G306900 Sobic001G303675--Sobic001G094000 Sobic001G303675--Sobic002G144933 Sobic009G100050 Sobic009G100050 Sobic001G303675--Sobic009G100050 Sobic001G303675--Sobic005G015900 Sobic001G303675--Sobic002G320500 Sobic004G096500 Sobic004G096500 Sobic001G303675--Sobic004G096500 Sobic002G151600 Sobic002G151600 Sobic001G303675--Sobic002G151600 Sobic003G170100 Sobic003G170100 Sobic001G303675--Sobic003G170100
Octagon: transcription factors


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