Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G303675.4,Sobic.001G303675.2,Sobic.001G303675.1,Sobic.001G303675.3
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S8D8 , A0A1Z5S8C7 , A0A1Z5S8L1
Pfam PF13891
Panther DB PTHR13453
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0000123; histone acetyltransferase complex


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G05860 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g23840.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a043229 , Zm00025a037658
Brachypodium -
Barley HORVU1Hr1G030870.3 , HORVU1Hr1G030870.2 , HORVU1Hr1G030870.4
Wheat TraesCS1D02G131700 , TraesCS1B02G149000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G306900 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed K12600: SKI3, superkiller protein 3
2 Sobic.001G094000 expressed protein -
3 Sobic.002G144933 - -
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8 Sobic.002G151600 R-interacting factor 1, putative, expressed -
9 Sobic.003G170100 - -
10 Sobic.001G511500 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K12837: splicing factor U2AF 65 kDa subunit
11 Sobic.006G080300 SET domain containing protein, expressed -
12 Sobic.002G157000 enhancer of polycomb, putative, expressed K11322: enhancer of polycomb-like protein
13 Sobic.001G477800 expressed protein -
14 Sobic.001G454301 - -
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16 Sobic.009G210500 expressed protein -
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18 Sobic.005G077466 - -
19 Sobic.009G065100 splicing factor, putative, expressed K12850: pre-mRNA-splicing factor 38B
20 Sobic.010G136600 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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