Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G454301.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SAN9
Pfam -
Panther DB PTHR23193
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g48602.1 : EMB1011, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a049199
Brachypodium KQK14576
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G116400 - -
2 Sobic.002G421700 OsFBX368 - F-box domain containing protein, expressed -
3 Sobic.008G117200 RING finger and CHY zinc finger domain-containing protein 1, putative, expressed K10144: RCHY1, RING finger and CHY zinc finger domain-containing protein 1
4 Sobic.001G094000 expressed protein -
5 Sobic.009G104300 - -
6 Sobic.009G239351 - -
7 Sobic.001G303675 - -
8 Sobic.002G140800 RNA pseudouridine synthase, putative, expressed -
9 Sobic.006G217200 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.006G210200 zinc finger domain, LSD1 subclass family protein, expressed -
11 Sobic.006G039900 - -
12 Sobic.006G013500 hydrolase/ zinc ion binding protein, putative, expressed K15442: TAD3, tRNA-specific adenosine deaminase 3
13 Sobic.010G153466 - -
14 Sobic.004G169501 - -
15 Sobic.010G113900 Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed -
16 Sobic.002G144966 - K02997: RP-S9e, small subunit ribosomal protein S9e
17 Sobic.002G073300 - -
18 Sobic.003G185250 - -
19 Sobic.004G088400 GTPase-activating protein, putative, expressed -
20 Sobic.009G239301 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G454301 Sobic001G454301 Sobic007G116400 Sobic007G116400 Sobic001G454301--Sobic007G116400 Sobic002G421700 Sobic002G421700 Sobic001G454301--Sobic002G421700 Sobic008G117200 Sobic008G117200 Sobic001G454301--Sobic008G117200 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic001G454301--Sobic001G094000 Sobic009G104300 Sobic009G104300 Sobic001G454301--Sobic009G104300 Sobic009G239351 Sobic009G239351 Sobic001G454301--Sobic009G239351 Sobic001G303675 Sobic001G303675 Sobic001G454301--Sobic001G303675 Sobic002G140800 Sobic002G140800 Sobic001G454301--Sobic002G140800 Sobic006G217200 Sobic006G217200 Sobic001G454301--Sobic006G217200 Sobic007G116400--Sobic001G094000 Sobic007G116400--Sobic001G454301 Sobic007G116400--Sobic009G104300 Sobic008G068800 Sobic008G068800 Sobic007G116400--Sobic008G068800 Sobic007G116400--Sobic008G117200 Sobic006G080300 Sobic006G080300 Sobic007G116400--Sobic006G080300 Sobic004G169501 Sobic004G169501 Sobic007G116400--Sobic004G169501 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic007G116400--Sobic001G477800 Sobic007G116400--Sobic009G239351 Sobic008G034600 Sobic008G034600 Sobic002G421700--Sobic008G034600 Sobic002G421700--Sobic008G117200 Sobic002G421700--Sobic001G454301 Sobic002G061400 Sobic002G061400 Sobic002G421700--Sobic002G061400 Sobic005G015900 Sobic005G015900 Sobic002G421700--Sobic005G015900 Sobic008G129700 Sobic008G129700 Sobic002G421700--Sobic008G129700 Sobic002G421700--Sobic007G116400 Sobic002G421700--Sobic001G094000 Sobic002G421700--Sobic006G217200 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic008G117200--Sobic010G263800 Sobic008G117200--Sobic008G034600 Sobic008G117200--Sobic001G094000 Sobic004G088400 Sobic004G088400 Sobic008G117200--Sobic004G088400 Sobic002G177400 Sobic002G177400 Sobic008G117200--Sobic002G177400 Sobic008G117200--Sobic002G421700 Sobic008G117200--Sobic007G116400 Sobic007G011400 Sobic007G011400 Sobic008G117200--Sobic007G011400 Sobic008G117200--Sobic001G477800 Sobic001G094000--Sobic007G011400 Sobic009G040700 Sobic009G040700 Sobic001G094000--Sobic009G040700 Sobic001G094000--Sobic001G477800 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic001G094000--Sobic002G157000 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic001G094000--Sobic003G268300 Sobic002G157300 Sobic002G157300 Sobic001G094000--Sobic002G157300 Sobic003G187400 Sobic003G187400 Sobic001G094000--Sobic003G187400 Sobic004G031700 Sobic004G031700 Sobic001G094000--Sobic004G031700 Sobic001G094000--Sobic006G080300 Sobic009G104300--Sobic007G116400 Sobic009G104300--Sobic006G080300 Sobic003G170100 Sobic003G170100 Sobic009G104300--Sobic003G170100 Sobic009G104300--Sobic001G094000 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic009G104300--Sobic001G543900 Sobic009G104300--Sobic001G454301 Sobic007G137900 Sobic007G137900 Sobic009G104300--Sobic007G137900 Sobic001G272000 Sobic001G272000 Sobic009G104300--Sobic001G272000 Sobic009G104300--Sobic001G477800 Sobic009G239351--Sobic007G116400 Sobic009G239351--Sobic001G454301 Sobic009G239301 Sobic009G239301 Sobic009G239351--Sobic009G239301 Sobic006G210200 Sobic006G210200 Sobic009G239351--Sobic006G210200 Sobic009G239351--Sobic009G104300 Sobic009G239351--Sobic001G094000 Sobic009G239351--Sobic003G170100 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic009G239351--Sobic001G162300 Sobic009G239351--Sobic001G303675 Sobic001G306900 Sobic001G306900 Sobic001G303675--Sobic001G306900 Sobic001G303675--Sobic001G094000 Sobic002G144933 Sobic002G144933 Sobic001G303675--Sobic002G144933 Sobic009G100050 Sobic009G100050 Sobic001G303675--Sobic009G100050 Sobic001G303675--Sobic005G015900 Sobic002G320500 Sobic002G320500 Sobic001G303675--Sobic002G320500 Sobic004G096500 Sobic004G096500 Sobic001G303675--Sobic004G096500 Sobic002G151600 Sobic002G151600 Sobic001G303675--Sobic002G151600 Sobic001G303675--Sobic003G170100 Sobic002G140800--Sobic001G454301 Sobic003G128600 Sobic003G128600 Sobic002G140800--Sobic003G128600 Sobic002G140800--Sobic004G169501 Sobic002G140800--Sobic007G116400 Sobic002G140800--Sobic004G088400 Sobic002G050500 Sobic002G050500 Sobic002G140800--Sobic002G050500 Sobic010G139301 Sobic010G139301 Sobic002G140800--Sobic010G139301 Sobic002G140800--Sobic008G117200 Sobic009G059600 Sobic009G059600 Sobic002G140800--Sobic009G059600 Sobic006G217200--Sobic001G454301 Sobic006G217200--Sobic002G421700 Sobic005G133500 Sobic005G133500 Sobic006G217200--Sobic005G133500 Sobic002G259800 Sobic002G259800 Sobic006G217200--Sobic002G259800 Sobic007G000800 Sobic007G000800 Sobic006G217200--Sobic007G000800 Sobic003G239900 Sobic003G239900 Sobic006G217200--Sobic003G239900 Sobic009G151200 Sobic009G151200 Sobic006G217200--Sobic009G151200 Sobic005G009200 Sobic005G009200 Sobic006G217200--Sobic005G009200 Sobic006G013500 Sobic006G013500 Sobic006G217200--Sobic006G013500
Octagon: transcription factors


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