Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G421700.1
Synonym Sb02g043290
Functional annotation OsFBX368 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt C5X5Q0
Pfam PF12937
Panther DB PTHR32133 PTHR32133:SF93
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G18330 : F-box family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g05210.1 : OsFBX368 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT67111 , KQJ96118
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.002G421700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G034600 protein kinase PKN/PRK1, effector, putative, expressed -
2 Sobic.008G117200 RING finger and CHY zinc finger domain-containing protein 1, putative, expressed K10144: RCHY1, RING finger and CHY zinc finger domain-containing protein 1
3 Sobic.001G454301 - -
4 Sobic.002G061400 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
5 Sobic.005G015900 dnaJ domain containing protein, expressed -
6 Sobic.008G129700 PAPA-1-like conserved region family protein, expressed K11666: INO80B, ZNHIT4, INO80 complex subunit B
7 Sobic.007G116400 - -
8 Sobic.001G094000 expressed protein -
9 Sobic.006G217200 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.005G015100 OsFBX291 - F-box domain containing protein, expressed -
11 Sobic.004G088400 GTPase-activating protein, putative, expressed -
12 Sobic.003G440700 leucine rich repeat domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.003G359300 ELM2 domain containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.007G011400 armadillo/beta-catenin repeat family protein, putative, expressed -
15 Sobic.004G197900 - -
16 Sobic.004G031700 expressed protein -
17 Sobic.005G009200 expressed protein -
18 Sobic.001G303675 - -
19 Sobic.006G128800 expressed protein -
20 Sobic.003G336800 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G421700 Sobic002G421700 Sobic008G034600 Sobic008G034600 Sobic002G421700--Sobic008G034600 Sobic008G117200 Sobic008G117200 Sobic002G421700--Sobic008G117200 Sobic001G454301 Sobic001G454301 Sobic002G421700--Sobic001G454301 Sobic002G061400 Sobic002G061400 Sobic002G421700--Sobic002G061400 Sobic005G015900 Sobic005G015900 Sobic002G421700--Sobic005G015900 Sobic008G129700 Sobic008G129700 Sobic002G421700--Sobic008G129700 Sobic007G116400 Sobic007G116400 Sobic002G421700--Sobic007G116400 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic002G421700--Sobic001G094000 Sobic006G217200 Sobic006G217200 Sobic002G421700--Sobic006G217200 Sobic007G205800 Sobic007G205800 Sobic008G034600--Sobic007G205800 Sobic007G011400 Sobic007G011400 Sobic008G034600--Sobic007G011400 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic008G034600--Sobic010G263800 Sobic004G271900 Sobic004G271900 Sobic008G034600--Sobic004G271900 Sobic008G034600--Sobic008G117200 Sobic008G034600--Sobic002G421700 Sobic009G022200 Sobic009G022200 Sobic008G034600--Sobic009G022200 Sobic007G224900 Sobic007G224900 Sobic008G034600--Sobic007G224900 Sobic003G346000 Sobic003G346000 Sobic008G034600--Sobic003G346000 Sobic008G117200--Sobic010G263800 Sobic008G117200--Sobic008G034600 Sobic008G117200--Sobic001G094000 Sobic004G088400 Sobic004G088400 Sobic008G117200--Sobic004G088400 Sobic002G177400 Sobic002G177400 Sobic008G117200--Sobic002G177400 Sobic008G117200--Sobic002G421700 Sobic008G117200--Sobic007G116400 Sobic008G117200--Sobic007G011400 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic008G117200--Sobic001G477800 Sobic001G454301--Sobic007G116400 Sobic001G454301--Sobic002G421700 Sobic001G454301--Sobic008G117200 Sobic001G454301--Sobic001G094000 Sobic009G104300 Sobic009G104300 Sobic001G454301--Sobic009G104300 Sobic009G239351 Sobic009G239351 Sobic001G454301--Sobic009G239351 Sobic001G303675 Sobic001G303675 Sobic001G454301--Sobic001G303675 Sobic002G140800 Sobic002G140800 Sobic001G454301--Sobic002G140800 Sobic001G454301--Sobic006G217200 Sobic002G061400--Sobic008G129700 Sobic003G336800 Sobic003G336800 Sobic002G061400--Sobic003G336800 Sobic002G061400--Sobic002G421700 Sobic010G199800 Sobic010G199800 Sobic002G061400--Sobic010G199800 Sobic002G061400--Sobic008G034600 Sobic008G116500 Sobic008G116500 Sobic002G061400--Sobic008G116500 Sobic002G297800 Sobic002G297800 Sobic002G061400--Sobic002G297800 Sobic002G049000 Sobic002G049000 Sobic002G061400--Sobic002G049000 Sobic002G061400--Sobic008G117200 Sobic006G032400 Sobic006G032400 Sobic005G015900--Sobic006G032400 Sobic004G031700 Sobic004G031700 Sobic005G015900--Sobic004G031700 Sobic004G219100 Sobic004G219100 Sobic005G015900--Sobic004G219100 Sobic001G176200 Sobic001G176200 Sobic005G015900--Sobic001G176200 Sobic002G320500 Sobic002G320500 Sobic005G015900--Sobic002G320500 Sobic001G090400 Sobic001G090400 Sobic005G015900--Sobic001G090400 Sobic002G158700 Sobic002G158700 Sobic005G015900--Sobic002G158700 Sobic005G015900--Sobic001G303675 Sobic003G445400 Sobic003G445400 Sobic005G015900--Sobic003G445400 Sobic008G129700--Sobic003G336800 Sobic004G061900 Sobic004G061900 Sobic008G129700--Sobic004G061900 Sobic008G129700--Sobic002G061400 Sobic008G129700--Sobic008G117200 Sobic008G129700--Sobic002G177400 Sobic007G185900 Sobic007G185900 Sobic008G129700--Sobic007G185900 Sobic008G078100 Sobic008G078100 Sobic008G129700--Sobic008G078100 Sobic003G248500 Sobic003G248500 Sobic008G129700--Sobic003G248500 Sobic008G129700--Sobic004G088400 Sobic007G116400--Sobic001G094000 Sobic007G116400--Sobic001G454301 Sobic007G116400--Sobic009G104300 Sobic008G068800 Sobic008G068800 Sobic007G116400--Sobic008G068800 Sobic007G116400--Sobic008G117200 Sobic006G080300 Sobic006G080300 Sobic007G116400--Sobic006G080300 Sobic004G169501 Sobic004G169501 Sobic007G116400--Sobic004G169501 Sobic007G116400--Sobic001G477800 Sobic007G116400--Sobic009G239351 Sobic001G094000--Sobic007G011400 Sobic009G040700 Sobic009G040700 Sobic001G094000--Sobic009G040700 Sobic001G094000--Sobic001G477800 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic001G094000--Sobic002G157000 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic001G094000--Sobic003G268300 Sobic002G157300 Sobic002G157300 Sobic001G094000--Sobic002G157300 Sobic003G187400 Sobic003G187400 Sobic001G094000--Sobic003G187400 Sobic001G094000--Sobic004G031700 Sobic001G094000--Sobic006G080300 Sobic006G217200--Sobic001G454301 Sobic006G217200--Sobic002G421700 Sobic005G133500 Sobic005G133500 Sobic006G217200--Sobic005G133500 Sobic002G259800 Sobic002G259800 Sobic006G217200--Sobic002G259800 Sobic007G000800 Sobic007G000800 Sobic006G217200--Sobic007G000800 Sobic003G239900 Sobic003G239900 Sobic006G217200--Sobic003G239900 Sobic009G151200 Sobic009G151200 Sobic006G217200--Sobic009G151200 Sobic005G009200 Sobic005G009200 Sobic006G217200--Sobic005G009200 Sobic006G013500 Sobic006G013500 Sobic006G217200--Sobic006G013500
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.