Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G009200.1
Synonym DMS4, RDM4, Sb05g000860
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y335
Pfam -
Panther DB PTHR31934 PTHR31934:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G30280 : RNA-directed DNA methylation 4
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g01880.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a053673
Brachypodium KQJ89605 , KQJ89604 , PNT64262
Barley -
Wheat TraesCS4B02G135400 , TraesCS4B02G135400 , TraesCS4B02G135400 , TraesCS4D02G130100 , TraesCS4D02G130100 , TraesCS4A02G183200 , TraesCS4A02G183200
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cDNA sequences
Sobic.005G009200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G362300 prefoldin, putative, expressed -
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14 Sobic.002G177400 expressed protein -
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18 Sobic.006G248500 expressed protein -
19 Sobic.006G210200 zinc finger domain, LSD1 subclass family protein, expressed -
20 Sobic.003G239900 ketol-acid reductoisomerase, chloroplast precursor, putative, expressed K00053: ketol-acid reductoisomerase


Gene co-expression network
sample Sobic005G009200 Sobic005G009200 Sobic002G362300 Sobic002G362300 Sobic005G009200--Sobic002G362300 Sobic003G442000 Sobic003G442000 Sobic005G009200--Sobic003G442000 Sobic001G371000 Sobic001G371000 Sobic005G009200--Sobic001G371000 Sobic008G129700 Sobic008G129700 Sobic005G009200--Sobic008G129700 Sobic008G117200 Sobic008G117200 Sobic005G009200--Sobic008G117200 Sobic009G151200 Sobic009G151200 Sobic005G009200--Sobic009G151200 Sobic002G259800 Sobic002G259800 Sobic005G009200--Sobic002G259800 Sobic002G421700 Sobic002G421700 Sobic005G009200--Sobic002G421700 Sobic008G034600 Sobic008G034600 Sobic005G009200--Sobic008G034600 Sobic002G362300--Sobic005G009200 Sobic002G362300--Sobic001G371000 Sobic003G433500 Sobic003G433500 Sobic002G362300--Sobic003G433500 Sobic005G229000 Sobic005G229000 Sobic002G362300--Sobic005G229000 Sobic008G073000 Sobic008G073000 Sobic002G362300--Sobic008G073000 Sobic009G030300 Sobic009G030300 Sobic002G362300--Sobic009G030300 Sobic002G095700 Sobic002G095700 Sobic002G362300--Sobic002G095700 Sobic005G030300 Sobic005G030300 Sobic002G362300--Sobic005G030300 Sobic009G044900 Sobic009G044900 Sobic002G362300--Sobic009G044900 Sobic003G442000--Sobic005G009200 Sobic005G015900 Sobic005G015900 Sobic003G442000--Sobic005G015900 Sobic004G018300 Sobic004G018300 Sobic003G442000--Sobic004G018300 Sobic003G258900 Sobic003G258900 Sobic003G442000--Sobic003G258900 Sobic010G202600 Sobic010G202600 Sobic003G442000--Sobic010G202600 Sobic009G074700 Sobic009G074700 Sobic003G442000--Sobic009G074700 Sobic002G197100 Sobic002G197100 Sobic003G442000--Sobic002G197100 Sobic002G158700 Sobic002G158700 Sobic003G442000--Sobic002G158700 Sobic001G090400 Sobic001G090400 Sobic003G442000--Sobic001G090400 Sobic001G371000--Sobic002G362300 Sobic001G371000--Sobic005G009200 Sobic004G026100 Sobic004G026100 Sobic001G371000--Sobic004G026100 Sobic003G239900 Sobic003G239900 Sobic001G371000--Sobic003G239900 Sobic009G216000 Sobic009G216000 Sobic001G371000--Sobic009G216000 Sobic001G371000--Sobic009G151200 Sobic009G022100 Sobic009G022100 Sobic001G371000--Sobic009G022100 Sobic001G371000--Sobic003G442000 Sobic001G371000--Sobic008G117200 Sobic003G336800 Sobic003G336800 Sobic008G129700--Sobic003G336800 Sobic004G061900 Sobic004G061900 Sobic008G129700--Sobic004G061900 Sobic002G061400 Sobic002G061400 Sobic008G129700--Sobic002G061400 Sobic008G129700--Sobic008G117200 Sobic002G177400 Sobic002G177400 Sobic008G129700--Sobic002G177400 Sobic007G185900 Sobic007G185900 Sobic008G129700--Sobic007G185900 Sobic008G078100 Sobic008G078100 Sobic008G129700--Sobic008G078100 Sobic003G248500 Sobic003G248500 Sobic008G129700--Sobic003G248500 Sobic004G088400 Sobic004G088400 Sobic008G129700--Sobic004G088400 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic008G117200--Sobic010G263800 Sobic008G117200--Sobic008G034600 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic008G117200--Sobic001G094000 Sobic008G117200--Sobic004G088400 Sobic008G117200--Sobic002G177400 Sobic008G117200--Sobic002G421700 Sobic007G116400 Sobic007G116400 Sobic008G117200--Sobic007G116400 Sobic007G011400 Sobic007G011400 Sobic008G117200--Sobic007G011400 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic008G117200--Sobic001G477800 Sobic006G248500 Sobic006G248500 Sobic009G151200--Sobic006G248500 Sobic009G151200--Sobic002G259800 Sobic005G133500 Sobic005G133500 Sobic009G151200--Sobic005G133500 Sobic004G285000 Sobic004G285000 Sobic009G151200--Sobic004G285000 Sobic001G424600 Sobic001G424600 Sobic009G151200--Sobic001G424600 Sobic004G085300 Sobic004G085300 Sobic009G151200--Sobic004G085300 Sobic008G100100 Sobic008G100100 Sobic009G151200--Sobic008G100100 Sobic004G086200 Sobic004G086200 Sobic009G151200--Sobic004G086200 Sobic004G156500 Sobic004G156500 Sobic009G151200--Sobic004G156500 Sobic009G195200 Sobic009G195200 Sobic002G259800--Sobic009G195200 Sobic001G306900 Sobic001G306900 Sobic002G259800--Sobic001G306900 Sobic002G259800--Sobic005G015900 Sobic003G394300 Sobic003G394300 Sobic002G259800--Sobic003G394300 Sobic002G259800--Sobic006G248500 Sobic001G246500 Sobic001G246500 Sobic002G259800--Sobic001G246500 Sobic005G084100 Sobic005G084100 Sobic002G259800--Sobic005G084100 Sobic002G423200 Sobic002G423200 Sobic002G259800--Sobic002G423200 Sobic002G259800--Sobic004G156500 Sobic002G421700--Sobic008G034600 Sobic002G421700--Sobic008G117200 Sobic001G454301 Sobic001G454301 Sobic002G421700--Sobic001G454301 Sobic002G421700--Sobic002G061400 Sobic002G421700--Sobic005G015900 Sobic002G421700--Sobic008G129700 Sobic002G421700--Sobic007G116400 Sobic002G421700--Sobic001G094000 Sobic006G217200 Sobic006G217200 Sobic002G421700--Sobic006G217200 Sobic007G205800 Sobic007G205800 Sobic008G034600--Sobic007G205800 Sobic008G034600--Sobic007G011400 Sobic008G034600--Sobic010G263800 Sobic004G271900 Sobic004G271900 Sobic008G034600--Sobic004G271900 Sobic008G034600--Sobic008G117200 Sobic008G034600--Sobic002G421700 Sobic009G022200 Sobic009G022200 Sobic008G034600--Sobic009G022200 Sobic007G224900 Sobic007G224900 Sobic008G034600--Sobic007G224900 Sobic003G346000 Sobic003G346000 Sobic008G034600--Sobic003G346000
Octagon: transcription factors


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