Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G239301.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R3W3
Pfam PF00117
Panther DB PTHR11550
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006221; pyrimidine nucleotide biosynthetic process GO:0003883CTP synthase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G34890 : CTP synthase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g49770.1 : CTP synthase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a036664 , Zm00025a044646
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G239351 - -
2 Sobic.001G454301 - -
3 Sobic.010G153466 - -
4 Sobic.007G046900 MBTB32 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
5 Sobic.006G252000 - -
6 Sobic.006G210200 zinc finger domain, LSD1 subclass family protein, expressed -
7 Sobic.007G116400 - -
8 Sobic.006G217200 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.006G013500 hydrolase/ zinc ion binding protein, putative, expressed K15442: TAD3, tRNA-specific adenosine deaminase 3
10 Sobic.002G140800 RNA pseudouridine synthase, putative, expressed -
11 Sobic.002G223300 nucleoporin p58/p45, putative, expressed K14307: NUPL1, nucleoporin p58/p45
12 Sobic.004G078100 zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein, expressed -
13 Sobic.008G056350 - -
14 Sobic.004G085300 Sel1 repeat domain containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.002G050500 type I inositol-1,4,5-trisphosphate 5-phosphatase, putative, expressed -
16 Sobic.004G086200 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed K09566: peptidyl-prolyl isomerase G (cyclophilin G)
17 Sobic.002G421700 OsFBX368 - F-box domain containing protein, expressed -
18 Sobic.001G166700 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
19 Sobic.002G073300 - -
20 Sobic.009G053101 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G239301 Sobic009G239301 Sobic009G239351 Sobic009G239351 Sobic009G239301--Sobic009G239351 Sobic001G454301 Sobic001G454301 Sobic009G239301--Sobic001G454301 Sobic010G153466 Sobic010G153466 Sobic009G239301--Sobic010G153466 Sobic007G046900 Sobic007G046900 Sobic009G239301--Sobic007G046900 Sobic006G252000 Sobic006G252000 Sobic009G239301--Sobic006G252000 Sobic006G210200 Sobic006G210200 Sobic009G239301--Sobic006G210200 Sobic007G116400 Sobic007G116400 Sobic009G239301--Sobic007G116400 Sobic006G217200 Sobic006G217200 Sobic009G239301--Sobic006G217200 Sobic006G013500 Sobic006G013500 Sobic009G239301--Sobic006G013500 Sobic009G239351--Sobic007G116400 Sobic009G239351--Sobic001G454301 Sobic009G239351--Sobic009G239301 Sobic009G239351--Sobic006G210200 Sobic009G104300 Sobic009G104300 Sobic009G239351--Sobic009G104300 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic009G239351--Sobic001G094000 Sobic003G170100 Sobic003G170100 Sobic009G239351--Sobic003G170100 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic009G239351--Sobic001G162300 Sobic001G303675 Sobic001G303675 Sobic009G239351--Sobic001G303675 Sobic001G454301--Sobic007G116400 Sobic002G421700 Sobic002G421700 Sobic001G454301--Sobic002G421700 Sobic008G117200 Sobic008G117200 Sobic001G454301--Sobic008G117200 Sobic001G454301--Sobic001G094000 Sobic001G454301--Sobic009G104300 Sobic001G454301--Sobic009G239351 Sobic001G454301--Sobic001G303675 Sobic002G140800 Sobic002G140800 Sobic001G454301--Sobic002G140800 Sobic001G454301--Sobic006G217200 Sobic010G153466--Sobic001G454301 Sobic010G153466--Sobic009G239301 Sobic010G153466--Sobic006G252000 Sobic010G153466--Sobic006G013500 Sobic010G153466--Sobic007G116400 Sobic010G153466--Sobic006G217200 Sobic002G181450 Sobic002G181450 Sobic010G153466--Sobic002G181450 Sobic010G153466--Sobic002G421700 Sobic010G153466--Sobic009G239351 Sobic004G078100 Sobic004G078100 Sobic007G046900--Sobic004G078100 Sobic002G060450 Sobic002G060450 Sobic007G046900--Sobic002G060450 Sobic002G223300 Sobic002G223300 Sobic007G046900--Sobic002G223300 Sobic002G018600 Sobic002G018600 Sobic007G046900--Sobic002G018600 Sobic001G215400 Sobic001G215400 Sobic007G046900--Sobic001G215400 Sobic002G095700 Sobic002G095700 Sobic007G046900--Sobic002G095700 Sobic007G046900--Sobic009G239301 Sobic002G089900 Sobic002G089900 Sobic007G046900--Sobic002G089900 Sobic003G433500 Sobic003G433500 Sobic007G046900--Sobic003G433500 Sobic001G257300 Sobic001G257300 Sobic006G252000--Sobic001G257300 Sobic001G228701 Sobic001G228701 Sobic006G252000--Sobic001G228701 Sobic006G252000--Sobic006G013500 Sobic001G206100 Sobic001G206100 Sobic006G252000--Sobic001G206100 Sobic006G252000--Sobic010G153466 Sobic009G086900 Sobic009G086900 Sobic006G252000--Sobic009G086900 Sobic006G252000--Sobic003G170100 Sobic008G192500 Sobic008G192500 Sobic006G252000--Sobic008G192500 Sobic006G252000--Sobic001G454301 Sobic002G050500 Sobic002G050500 Sobic006G210200--Sobic002G050500 Sobic006G210200--Sobic001G454301 Sobic002G151600 Sobic002G151600 Sobic006G210200--Sobic002G151600 Sobic003G023400 Sobic003G023400 Sobic006G210200--Sobic003G023400 Sobic002G157200 Sobic002G157200 Sobic006G210200--Sobic002G157200 Sobic003G185250 Sobic003G185250 Sobic006G210200--Sobic003G185250 Sobic006G210200--Sobic002G060450 Sobic006G210200--Sobic001G303675 Sobic006G210200--Sobic009G239351 Sobic007G116400--Sobic001G094000 Sobic007G116400--Sobic001G454301 Sobic007G116400--Sobic009G104300 Sobic008G068800 Sobic008G068800 Sobic007G116400--Sobic008G068800 Sobic007G116400--Sobic008G117200 Sobic006G080300 Sobic006G080300 Sobic007G116400--Sobic006G080300 Sobic004G169501 Sobic004G169501 Sobic007G116400--Sobic004G169501 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic007G116400--Sobic001G477800 Sobic007G116400--Sobic009G239351 Sobic006G217200--Sobic001G454301 Sobic006G217200--Sobic002G421700 Sobic005G133500 Sobic005G133500 Sobic006G217200--Sobic005G133500 Sobic002G259800 Sobic002G259800 Sobic006G217200--Sobic002G259800 Sobic007G000800 Sobic007G000800 Sobic006G217200--Sobic007G000800 Sobic003G239900 Sobic003G239900 Sobic006G217200--Sobic003G239900 Sobic009G151200 Sobic009G151200 Sobic006G217200--Sobic009G151200 Sobic005G009200 Sobic005G009200 Sobic006G217200--Sobic005G009200 Sobic006G217200--Sobic006G013500 Sobic006G013500--Sobic001G206100 Sobic006G013500--Sobic001G257300 Sobic001G306900 Sobic001G306900 Sobic006G013500--Sobic001G306900 Sobic006G013500--Sobic006G080300 Sobic004G031700 Sobic004G031700 Sobic006G013500--Sobic004G031700 Sobic009G000500 Sobic009G000500 Sobic006G013500--Sobic009G000500 Sobic003G197800 Sobic003G197800 Sobic006G013500--Sobic003G197800 Sobic006G013500--Sobic001G094000 Sobic006G046700 Sobic006G046700 Sobic006G013500--Sobic006G046700
Octagon: transcription factors


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