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Transcriptome id Sobic.009G053101.1
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Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R108
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Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G239301 - -
2 Sobic.002G140800 RNA pseudouridine synthase, putative, expressed -
3 Sobic.006G088400 OsFBX135 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.009G239351 - -
5 Sobic.002G416150 - -
6 Sobic.001G454301 - -
7 Sobic.001G179900 DCL2, putative, expressed K11592: DICER1, endoribonuclease Dicer
8 Sobic.006G217200 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.008G056350 - -
10 Sobic.008G089600 - -
11 Sobic.003G002700 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K11806: DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13
12 Sobic.004G086200 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed K09566: peptidyl-prolyl isomerase G (cyclophilin G)
13 Sobic.005G178800 OsFBX135 - F-box domain containing protein, expressed -
14 Sobic.007G116400 - -
15 Sobic.001G018100 "qTGW3/GL3.3/TGW3(Ortholog in rice:Hu et al., 2018/Xia et al., 2018/Ying et al., 2018 )"(PubMedID : 31659830)@CGMC_GSK.5 - CGMC includes CDA, MAPK, GSK3, and CLKC kinases, expressed K03083: glycogen synthase kinase 3 beta
16 Sobic.002G429700 AMP deaminase, putative, expressed K01490: AMP deaminase
17 Sobic.003G189333 - -
18 Sobic.010G195200 N-rich protein, putative, expressed -
19 Sobic.001G517200 tRNA nucleotidyltransferase/polyA polymerase family protein, putative, expressed -
20 Sobic.009G155900 hhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G053101 Sobic009G053101 Sobic009G239301 Sobic009G239301 Sobic009G053101--Sobic009G239301 Sobic002G140800 Sobic002G140800 Sobic009G053101--Sobic002G140800 Sobic006G088400 Sobic006G088400 Sobic009G053101--Sobic006G088400 Sobic009G239351 Sobic009G239351 Sobic009G053101--Sobic009G239351 Sobic002G416150 Sobic002G416150 Sobic009G053101--Sobic002G416150 Sobic001G454301 Sobic001G454301 Sobic009G053101--Sobic001G454301 Sobic001G179900 Sobic001G179900 Sobic009G053101--Sobic001G179900 Sobic006G217200 Sobic006G217200 Sobic009G053101--Sobic006G217200 Sobic008G056350 Sobic008G056350 Sobic009G053101--Sobic008G056350 Sobic009G239301--Sobic009G239351 Sobic009G239301--Sobic001G454301 Sobic010G153466 Sobic010G153466 Sobic009G239301--Sobic010G153466 Sobic007G046900 Sobic007G046900 Sobic009G239301--Sobic007G046900 Sobic006G252000 Sobic006G252000 Sobic009G239301--Sobic006G252000 Sobic006G210200 Sobic006G210200 Sobic009G239301--Sobic006G210200 Sobic007G116400 Sobic007G116400 Sobic009G239301--Sobic007G116400 Sobic009G239301--Sobic006G217200 Sobic006G013500 Sobic006G013500 Sobic009G239301--Sobic006G013500 Sobic002G140800--Sobic001G454301 Sobic003G128600 Sobic003G128600 Sobic002G140800--Sobic003G128600 Sobic004G169501 Sobic004G169501 Sobic002G140800--Sobic004G169501 Sobic002G140800--Sobic007G116400 Sobic004G088400 Sobic004G088400 Sobic002G140800--Sobic004G088400 Sobic002G050500 Sobic002G050500 Sobic002G140800--Sobic002G050500 Sobic010G139301 Sobic010G139301 Sobic002G140800--Sobic010G139301 Sobic008G117200 Sobic008G117200 Sobic002G140800--Sobic008G117200 Sobic009G059600 Sobic009G059600 Sobic002G140800--Sobic009G059600 Sobic003G002700 Sobic003G002700 Sobic006G088400--Sobic003G002700 Sobic006G088400--Sobic002G416150 Sobic002G429700 Sobic002G429700 Sobic006G088400--Sobic002G429700 Sobic006G088400--Sobic009G053101 Sobic003G075400 Sobic003G075400 Sobic006G088400--Sobic003G075400 Sobic007G101100 Sobic007G101100 Sobic006G088400--Sobic007G101100 Sobic010G257000 Sobic010G257000 Sobic006G088400--Sobic010G257000 Sobic010G175000 Sobic010G175000 Sobic006G088400--Sobic010G175000 Sobic005G078700 Sobic005G078700 Sobic006G088400--Sobic005G078700 Sobic009G239351--Sobic007G116400 Sobic009G239351--Sobic001G454301 Sobic009G239351--Sobic009G239301 Sobic009G239351--Sobic006G210200 Sobic009G104300 Sobic009G104300 Sobic009G239351--Sobic009G104300 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic009G239351--Sobic001G094000 Sobic003G170100 Sobic003G170100 Sobic009G239351--Sobic003G170100 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic009G239351--Sobic001G162300 Sobic001G303675 Sobic001G303675 Sobic009G239351--Sobic001G303675 Sobic004G116500 Sobic004G116500 Sobic002G416150--Sobic004G116500 Sobic002G416150--Sobic006G088400 Sobic001G264201 Sobic001G264201 Sobic002G416150--Sobic001G264201 Sobic005G120600 Sobic005G120600 Sobic002G416150--Sobic005G120600 Sobic005G139300 Sobic005G139300 Sobic002G416150--Sobic005G139300 Sobic004G353400 Sobic004G353400 Sobic002G416150--Sobic004G353400 Sobic009G224300 Sobic009G224300 Sobic002G416150--Sobic009G224300 Sobic010G221200 Sobic010G221200 Sobic002G416150--Sobic010G221200 Sobic009G155900 Sobic009G155900 Sobic002G416150--Sobic009G155900 Sobic001G454301--Sobic007G116400 Sobic002G421700 Sobic002G421700 Sobic001G454301--Sobic002G421700 Sobic001G454301--Sobic008G117200 Sobic001G454301--Sobic001G094000 Sobic001G454301--Sobic009G104300 Sobic001G454301--Sobic009G239351 Sobic001G454301--Sobic001G303675 Sobic001G454301--Sobic002G140800 Sobic001G454301--Sobic006G217200 Sobic001G179900--Sobic006G217200 Sobic001G179900--Sobic001G454301 Sobic001G179900--Sobic007G116400 Sobic001G179900--Sobic004G088400 Sobic001G179900--Sobic002G140800 Sobic001G179900--Sobic010G153466 Sobic003G336800 Sobic003G336800 Sobic001G179900--Sobic003G336800 Sobic001G179900--Sobic009G239351 Sobic001G179900--Sobic009G239301 Sobic006G217200--Sobic001G454301 Sobic006G217200--Sobic002G421700 Sobic005G133500 Sobic005G133500 Sobic006G217200--Sobic005G133500 Sobic002G259800 Sobic002G259800 Sobic006G217200--Sobic002G259800 Sobic007G000800 Sobic007G000800 Sobic006G217200--Sobic007G000800 Sobic003G239900 Sobic003G239900 Sobic006G217200--Sobic003G239900 Sobic009G151200 Sobic009G151200 Sobic006G217200--Sobic009G151200 Sobic005G009200 Sobic005G009200 Sobic006G217200--Sobic005G009200 Sobic006G217200--Sobic006G013500 Sobic008G056350--Sobic002G050500 Sobic008G056350--Sobic001G454301 Sobic008G056350--Sobic009G239351 Sobic008G056350--Sobic002G421700 Sobic002G060450 Sobic002G060450 Sobic008G056350--Sobic002G060450 Sobic008G056350--Sobic009G239301 Sobic002G223300 Sobic002G223300 Sobic008G056350--Sobic002G223300 Sobic008G056350--Sobic006G217200 Sobic008G056350--Sobic002G140800
Octagon: transcription factors


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