Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G195200.1,Sobic.010G195200.2
Synonym Sb10g024460
Functional annotation N-rich protein, putative, expressed
UniProt C5Z670
Pfam PF10539
Panther DB PTHR10857 PTHR10857:SF32
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G35140 : DCD (Development and Cell Death) domain protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g39020.1 : N-rich protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a045909
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G094500 KH domain containing protein, putative, expressed -
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3 Sobic.005G108000 - -
4 Sobic.001G245900 expressed protein -
5 Sobic.002G336200 nucleoside transporter, putative, expressed K15014: SLC29A1_2_3, solute carrier family 29 (equilibrative nucleoside transporter), member 1/2/3
6 Sobic.002G127900 ELMO/CED-12 family protein, putative, expressed K08869: ADCK, aarF domain-containing kinase
7 Sobic.009G145101 - -
8 Sobic.004G027400 - -
9 Sobic.001G346900 RNA cap guanine-N2 methyltransferase domain containing protein, expressed K14292: trimethylguanosine synthase
10 Sobic.006G215050 - -
11 Sobic.010G039900 OsFBDUF30 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
12 Sobic.002G127200 CRAL/TRIO domain containing protein, expressed -
13 Sobic.007G014800 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.004G285000 MT-A70 domain containing protein, expressed K05925: mRNA m6A methyltransferase catalytic subunit
15 Sobic.008G002500 RCD1, putative, expressed -
16 Sobic.001G033900 mTERF family protein, expressed K15032: mTERF domain-containing protein, mitochondrial
17 Sobic.005G024400 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed -
18 Sobic.007G187900 OsFBX187 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.004G332400 neurochondrin family protein, putative, expressed -
20 Sobic.002G309200 FAR1 family protein, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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