Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G145101.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R3U8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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MaizeGDB (Corn) Zm00025a027410
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G081000 nucleotide-binding protein-like, putative, expressed K03593: mrp, ATP-binding protein involved in chromosome partitioning
2 Sobic.006G231800 double-strand break repair protein MRE11, putative, expressed K10865: double-strand break repair protein MRE11
3 Sobic.005G059200 bromodomain domain containing protein, expressed -
4 Sobic.003G189333 - -
5 Sobic.002G105101 - -
6 Sobic.006G226300 SDA1, putative, expressed K14856: SDA1, protein SDA1
7 Sobic.003G221600 expressed protein -
8 Sobic.007G217100 sas10/Utp3 family protein, expressed K14767: UTP3, U3 small nucleolar RNA-associated protein 3
9 Sobic.009G251200 expressed protein -
10 Sobic.005G157100 THUMP domain-containing protein, putative, expressed K06963: TAN1, tRNA acetyltransferase TAN1
11 Sobic.002G275600 RFC1 - Putative clamp loader of PCNA, replication factor C subunit 1, expressed K10754: replication factor C subunit 1
12 Sobic.006G102100 ZOS3-17 - C2H2 zinc finger protein, expressed K12827: SF3A3, SAP61, splicing factor 3A subunit 3
13 Sobic.003G258900 ZOS3-17 - C2H2 zinc finger protein, expressed K12827: SF3A3, SAP61, splicing factor 3A subunit 3
14 Sobic.003G382500 serine/threonine-protein kinase RIO-like, putative, expressed K07179: RIO kinase 2
15 Sobic.001G422500 N-dimethylguanosine tRNA methyltransferase, putative, expressed K00555: TRMT1, tRNA (guanine26-N2/guanine27-N2)-dimethyltransferase
16 Sobic.004G321700 mitochondrial transcription termination factor family protein, putative, expressed K15032: mTERF domain-containing protein, mitochondrial
17 Sobic.008G014500 RNA recognition motif containing protein, expressed K13161: heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R
18 Sobic.009G213200 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.004G030800 expressed protein -
20 Sobic.006G185200 RNA polymerase IV subunit, putative, expressed K16250: DNA-directed RNA polymerase IV subunit 1


Gene co-expression network
sample Sobic009G145101 Sobic009G145101 Sobic001G081000 Sobic001G081000 Sobic009G145101--Sobic001G081000 Sobic006G231800 Sobic006G231800 Sobic009G145101--Sobic006G231800 Sobic005G059200 Sobic005G059200 Sobic009G145101--Sobic005G059200 Sobic003G189333 Sobic003G189333 Sobic009G145101--Sobic003G189333 Sobic002G105101 Sobic002G105101 Sobic009G145101--Sobic002G105101 Sobic006G226300 Sobic006G226300 Sobic009G145101--Sobic006G226300 Sobic003G221600 Sobic003G221600 Sobic009G145101--Sobic003G221600 Sobic007G217100 Sobic007G217100 Sobic009G145101--Sobic007G217100 Sobic009G251200 Sobic009G251200 Sobic009G145101--Sobic009G251200 Sobic004G018300 Sobic004G018300 Sobic001G081000--Sobic004G018300 Sobic001G081000--Sobic003G221600 Sobic008G131000 Sobic008G131000 Sobic001G081000--Sobic008G131000 Sobic003G141500 Sobic003G141500 Sobic001G081000--Sobic003G141500 Sobic008G014500 Sobic008G014500 Sobic001G081000--Sobic008G014500 Sobic003G258900 Sobic003G258900 Sobic001G081000--Sobic003G258900 Sobic008G083000 Sobic008G083000 Sobic001G081000--Sobic008G083000 Sobic007G220300 Sobic007G220300 Sobic001G081000--Sobic007G220300 Sobic001G081000--Sobic009G145101 Sobic001G422500 Sobic001G422500 Sobic006G231800--Sobic001G422500 Sobic006G231800--Sobic009G145101 Sobic002G378100 Sobic002G378100 Sobic006G231800--Sobic002G378100 Sobic006G185200 Sobic006G185200 Sobic006G231800--Sobic006G185200 Sobic009G213200 Sobic009G213200 Sobic006G231800--Sobic009G213200 Sobic006G049600 Sobic006G049600 Sobic006G231800--Sobic006G049600 Sobic001G119600 Sobic001G119600 Sobic006G231800--Sobic001G119600 Sobic010G003400 Sobic010G003400 Sobic006G231800--Sobic010G003400 Sobic002G373950 Sobic002G373950 Sobic006G231800--Sobic002G373950 Sobic005G059200--Sobic003G258900 Sobic005G059200--Sobic009G145101 Sobic001G246200 Sobic001G246200 Sobic005G059200--Sobic001G246200 Sobic005G059200--Sobic009G251200 Sobic005G059200--Sobic001G081000 Sobic008G101000 Sobic008G101000 Sobic005G059200--Sobic008G101000 Sobic009G221000 Sobic009G221000 Sobic005G059200--Sobic009G221000 Sobic005G059200--Sobic003G189333 Sobic002G223401 Sobic002G223401 Sobic005G059200--Sobic002G223401 Sobic003G189333--Sobic009G145101 Sobic003G189333--Sobic009G251200 Sobic002G380100 Sobic002G380100 Sobic003G189333--Sobic002G380100 Sobic005G028300 Sobic005G028300 Sobic003G189333--Sobic005G028300 Sobic003G189333--Sobic006G226300 Sobic003G189333--Sobic005G059200 Sobic003G189333--Sobic001G081000 Sobic003G189333--Sobic006G185200 Sobic004G119400 Sobic004G119400 Sobic003G189333--Sobic004G119400 Sobic002G105101--Sobic007G217100 Sobic001G052400 Sobic001G052400 Sobic002G105101--Sobic001G052400 Sobic008G147200 Sobic008G147200 Sobic002G105101--Sobic008G147200 Sobic009G211200 Sobic009G211200 Sobic002G105101--Sobic009G211200 Sobic010G224700 Sobic010G224700 Sobic002G105101--Sobic010G224700 Sobic010G215900 Sobic010G215900 Sobic002G105101--Sobic010G215900 Sobic004G321700 Sobic004G321700 Sobic002G105101--Sobic004G321700 Sobic002G105101--Sobic009G145101 Sobic003G409200 Sobic003G409200 Sobic002G105101--Sobic003G409200 Sobic002G142600 Sobic002G142600 Sobic006G226300--Sobic002G142600 Sobic001G346900 Sobic001G346900 Sobic006G226300--Sobic001G346900 Sobic005G157100 Sobic005G157100 Sobic006G226300--Sobic005G157100 Sobic003G042400 Sobic003G042400 Sobic006G226300--Sobic003G042400 Sobic004G285000 Sobic004G285000 Sobic006G226300--Sobic004G285000 Sobic006G226300--Sobic008G147200 Sobic005G137700 Sobic005G137700 Sobic006G226300--Sobic005G137700 Sobic006G226300--Sobic003G258900 Sobic001G246500 Sobic001G246500 Sobic006G226300--Sobic001G246500 Sobic003G221600--Sobic001G081000 Sobic003G221600--Sobic003G258900 Sobic008G078300 Sobic008G078300 Sobic003G221600--Sobic008G078300 Sobic003G221600--Sobic009G145101 Sobic003G221600--Sobic005G157100 Sobic003G221600--Sobic007G220300 Sobic003G221600--Sobic008G131000 Sobic003G267800 Sobic003G267800 Sobic003G221600--Sobic003G267800 Sobic003G221600--Sobic006G226300 Sobic007G217100--Sobic001G052400 Sobic007G217100--Sobic002G105101 Sobic006G125900 Sobic006G125900 Sobic007G217100--Sobic006G125900 Sobic007G217100--Sobic003G042400 Sobic007G217100--Sobic004G321700 Sobic001G453400 Sobic001G453400 Sobic007G217100--Sobic001G453400 Sobic009G101200 Sobic009G101200 Sobic007G217100--Sobic009G101200 Sobic004G224600 Sobic004G224600 Sobic007G217100--Sobic004G224600 Sobic008G163500 Sobic008G163500 Sobic007G217100--Sobic008G163500 Sobic002G298100 Sobic002G298100 Sobic009G251200--Sobic002G298100 Sobic003G133900 Sobic003G133900 Sobic009G251200--Sobic003G133900 Sobic005G160100 Sobic005G160100 Sobic009G251200--Sobic005G160100 Sobic009G251200--Sobic001G081000 Sobic009G251200--Sobic006G226300 Sobic004G309900 Sobic004G309900 Sobic009G251200--Sobic004G309900 Sobic009G251200--Sobic006G185200 Sobic001G393900 Sobic001G393900 Sobic009G251200--Sobic001G393900 Sobic009G251200--Sobic008G014500
Octagon: transcription factors


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