Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G189333.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VY34
Pfam -
Panther DB PTHR10706 PTHR10706:SF129
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G78760 : F-box/RNI-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g03690.1 : OsFBX346 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G145101 - -
2 Sobic.009G251200 expressed protein -
3 Sobic.002G380100 PPR repeat containing protein, expressed K17964: leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial
4 Sobic.005G028300 Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed -
5 Sobic.006G226300 SDA1, putative, expressed K14856: SDA1, protein SDA1
6 Sobic.005G059200 bromodomain domain containing protein, expressed -
7 Sobic.001G081000 nucleotide-binding protein-like, putative, expressed K03593: mrp, ATP-binding protein involved in chromosome partitioning
8 Sobic.006G185200 RNA polymerase IV subunit, putative, expressed K16250: DNA-directed RNA polymerase IV subunit 1
9 Sobic.004G119400 ATP-binding domain-containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.003G258900 ZOS3-17 - C2H2 zinc finger protein, expressed K12827: SF3A3, SAP61, splicing factor 3A subunit 3
11 Sobic.009G015800 expressed protein -
12 Sobic.004G226900 expressed protein -
13 Sobic.001G246500 GTPase of unknown function domain containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.008G014500 RNA recognition motif containing protein, expressed K13161: heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R
15 Sobic.005G108000 - -
16 Sobic.005G157100 THUMP domain-containing protein, putative, expressed K06963: TAN1, tRNA acetyltransferase TAN1
17 Sobic.002G336800 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.007G094500 KH domain containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.005G020000 pentatricopeptide, putative, expressed -
20 Sobic.006G231800 double-strand break repair protein MRE11, putative, expressed K10865: double-strand break repair protein MRE11


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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