Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G336800.1
Synonym
Functional annotation PPR repeat domain containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6QEW8
Pfam PF01535 PF13041
Panther DB PTHR24015 PTHR24015:SF351
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G14080 : Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g56960.1 : PPR repeat domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a013101
Brachypodium KQK12890 , PNT74036 , PNT74037 , KQK12889
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G079025 - -
2 Sobic.008G011100 OsNucAP2 - Putative Nucleoporin Autopeptidase homologue, expressed -
3 Sobic.004G087600 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.003G144950 - -
5 Sobic.006G078600 expressed protein K11426: [histone H3]-lysine4/36 N-trimethyltransferase SMYD
6 Sobic.009G005100 - -
7 Sobic.009G007800 TruB family pseudouridylate synthase, putative, expressed K03177: truB, PUS4, tRNA pseudouridine55 synthase
8 Sobic.001G360900 peptidyl-prolyl isomerase PASTICCINO1, putative, expressed -
9 Sobic.009G103600 MEE12, putative, expressed -
10 Sobic.004G018300 expressed protein K06970: 23S rRNA (adenine1618-N6)-methyltransferase
11 Sobic.003G258900 ZOS3-17 - C2H2 zinc finger protein, expressed K12827: SF3A3, SAP61, splicing factor 3A subunit 3
12 Sobic.005G110475 - -
13 Sobic.009G085400 acyl-activating enzyme 14, putative, expressed -
14 Sobic.002G144966 - K02997: RP-S9e, small subunit ribosomal protein S9e
15 Sobic.004G035000 S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase mraW, putative, expressed -
16 Sobic.003G176600 expressed protein -
17 Sobic.010G166000 ESP1, putative, expressed -
18 Sobic.002G031400 OsFBL39 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
19 Sobic.009G100050 - -
20 Sobic.008G081600 expressed protein -


Gene co-expression network
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