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Transcriptome id Sobic.003G144950.1
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UniProt A0A1W0VXC5
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NCBI CDD -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G336800 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.002G031400 OsFBL39 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
3 Sobic.004G174400 ZOS2-09 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
4 Sobic.005G110475 - -
5 Sobic.009G103600 MEE12, putative, expressed -
6 Sobic.005G084400 la domain containing protein, expressed K15191: La-related protein 7
7 Sobic.001G124000 pinin/SDK/memA protein, putative, expressed K13114: pinin
8 Sobic.010G143800 expressed protein -
9 Sobic.008G011100 OsNucAP2 - Putative Nucleoporin Autopeptidase homologue, expressed -
10 Sobic.008G080200 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
11 Sobic.005G079025 - -
12 Sobic.003G176600 expressed protein -
13 Sobic.003G153000 galactosyltransferase family protein, putative, expressed -
14 Sobic.001G035900 expressed protein K13156: U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 48 kDa protein
15 Sobic.005G159000 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, putative, expressed -
16 Sobic.001G081200 TATA binding protein-associated factor, putative, expressed K03131: transcription initiation factor TFIID subunit 6
17 Sobic.003G109700 expressed protein -
18 Sobic.002G313400 pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, putative, expressed K12815: DHX38, pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX38/PRP16
19 Sobic.001G222250 - -
20 Sobic.002G055300 pentatricopeptide, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G144950 Sobic003G144950 Sobic002G336800 Sobic002G336800 Sobic003G144950--Sobic002G336800 Sobic002G031400 Sobic002G031400 Sobic003G144950--Sobic002G031400 Sobic004G174400 Sobic004G174400 Sobic003G144950--Sobic004G174400 Sobic005G110475 Sobic005G110475 Sobic003G144950--Sobic005G110475 Sobic009G103600 Sobic009G103600 Sobic003G144950--Sobic009G103600 Sobic005G084400 Sobic005G084400 Sobic003G144950--Sobic005G084400 Sobic001G124000 Sobic001G124000 Sobic003G144950--Sobic001G124000 Sobic010G143800 Sobic010G143800 Sobic003G144950--Sobic010G143800 Sobic008G011100 Sobic008G011100 Sobic003G144950--Sobic008G011100 Sobic005G079025 Sobic005G079025 Sobic002G336800--Sobic005G079025 Sobic002G336800--Sobic008G011100 Sobic004G087600 Sobic004G087600 Sobic002G336800--Sobic004G087600 Sobic002G336800--Sobic003G144950 Sobic006G078600 Sobic006G078600 Sobic002G336800--Sobic006G078600 Sobic009G005100 Sobic009G005100 Sobic002G336800--Sobic009G005100 Sobic009G007800 Sobic009G007800 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Octagon: transcription factors


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