Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G110475.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A109NDU4
Pfam PF05096
Panther DB PTHR31270 PTHR31270:SF0
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G25720 : glutaminyl cyclase
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g01410.1 : glutamine cyclotransferase precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a041155
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G336800 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.008G125600 - -
3 Sobic.003G144950 - -
4 Sobic.009G103600 MEE12, putative, expressed -
5 Sobic.009G085400 acyl-activating enzyme 14, putative, expressed -
6 Sobic.008G011100 OsNucAP2 - Putative Nucleoporin Autopeptidase homologue, expressed -
7 Sobic.006G263000 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1, putative, expressed -
8 Sobic.002G144966 - K02997: RP-S9e, small subunit ribosomal protein S9e
9 Sobic.001G081200 TATA binding protein-associated factor, putative, expressed K03131: transcription initiation factor TFIID subunit 6
10 Sobic.003G088700 - -
11 Sobic.001G222250 - -
12 Sobic.002G031400 OsFBL39 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
13 Sobic.005G084400 la domain containing protein, expressed K15191: La-related protein 7
14 Sobic.002G055300 pentatricopeptide, putative, expressed -
15 Sobic.005G079025 - -
16 Sobic.001G191600 TMS membrane protein/tumour differentially expressed protein, putative, expressed -
17 Sobic.003G254000 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.001G111900 - -
19 Sobic.002G114700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
20 Sobic.006G214400 peptidase, trypsin-like serine and cysteine proteases, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G110475 Sobic005G110475 Sobic002G336800 Sobic002G336800 Sobic005G110475--Sobic002G336800 Sobic008G125600 Sobic008G125600 Sobic005G110475--Sobic008G125600 Sobic003G144950 Sobic003G144950 Sobic005G110475--Sobic003G144950 Sobic009G103600 Sobic009G103600 Sobic005G110475--Sobic009G103600 Sobic009G085400 Sobic009G085400 Sobic005G110475--Sobic009G085400 Sobic008G011100 Sobic008G011100 Sobic005G110475--Sobic008G011100 Sobic006G263000 Sobic006G263000 Sobic005G110475--Sobic006G263000 Sobic002G144966 Sobic002G144966 Sobic005G110475--Sobic002G144966 Sobic001G081200 Sobic001G081200 Sobic005G110475--Sobic001G081200 Sobic005G079025 Sobic005G079025 Sobic002G336800--Sobic005G079025 Sobic002G336800--Sobic008G011100 Sobic004G087600 Sobic004G087600 Sobic002G336800--Sobic004G087600 Sobic002G336800--Sobic003G144950 Sobic006G078600 Sobic006G078600 Sobic002G336800--Sobic006G078600 Sobic009G005100 Sobic009G005100 Sobic002G336800--Sobic009G005100 Sobic009G007800 Sobic009G007800 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Octagon: transcription factors


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