Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G144966.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W412
Pfam PF01251
Panther DB PTHR11278 PTHR11278:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology K02997; RP-S9e, small subunit ribosomal protein S9e
Gene Ontology GO:0006412; translation GO:0005840ribosome GO:0005622intracellular GO:0003735structural constituent of ribosome


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G02560 : Ribosomal protein S7e family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g18580.1 : 40S ribosomal protein S7, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a052627 , Zm00025a002038
Brachypodium KQJ96484 , KQK22092 , KQK22091
Barley HORVU4Hr1G055230.3 , HORVU4Hr1G055230.2 , HORVU4Hr1G055230.1 , HORVU4Hr1G055230.6 , HORVU4Hr1G055230.5 , HORVU4Hr1G055230.4 , HORVU1Hr1G029870.3 , HORVU1Hr1G029870.2 , HORVU1Hr1G029870.1 , HORVU1Hr1G029870.4
Wheat TraesCS4D02G191400 , TraesCS1B02G146100 , TraesCS4D02G191400 , TraesCS4A02G114100 , TraesCS1A02G129100 , TraesCS4B02G190000
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G464200 flap endonuclease, putative, expressed K10846: ERCC5, XPG, DNA excision repair protein ERCC-5
2 Sobic.006G262200 - -
3 Sobic.005G077466 - -
4 Sobic.001G111900 - -
5 Sobic.003G087400 - -
6 Sobic.009G065100 splicing factor, putative, expressed K12850: pre-mRNA-splicing factor 38B
7 Sobic.006G076300 RING-H2 finger protein, putative, expressed K19040: E3 ubiquitin-protein ligase ATL10/75/76/77/78
8 Sobic.004G039700 OsFBX188 - F-box domain containing protein, expressed -
9 Sobic.001G511500 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K12837: splicing factor U2AF 65 kDa subunit
10 Sobic.007G000100 PWWP domain containing protein, expressed -
11 Sobic.010G056000 GAGA-binding protein, putative, expressed -
12 Sobic.006G009400 G-patch domain containing protein, expressed -
13 Sobic.006G128900 cyclin-dependent kinase G-2, putative, expressed K08818: cell division cycle 2-like
14 Sobic.001G303675 - -
15 Sobic.007G178700 - -
16 Sobic.001G454401 - -
17 Sobic.001G094000 expressed protein -
18 Sobic.010G225226 - -
19 Sobic.008G173900 "OsPPKL3(Ortholog in rice:Zhan et al., 2012)"(PubMedID : 31659913)@serine/threonine-protein phosphatase BSL2, putative, expressed -
20 Sobic.006G246900 expressed protein -


Gene co-expression network
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Sobic001G306900 Sobic001G511500--Sobic001G306900 Sobic001G511500--Sobic003G445400 Sobic001G511500--Sobic003G307000 Sobic006G032400 Sobic006G032400 Sobic001G511500--Sobic006G032400
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