Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G076300.2,Sobic.006G076300.3
Synonym Sb06g016320
Functional annotation RING-H2 finger protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RCR8
Pfam PF13639
Panther DB PTHR14155 PTHR14155:SF106
NCBI CDD -
KEGG Orthology K19040; E3 ubiquitin-protein ligase ATL10/75/76/77/78
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0005515protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G49230 : RING/U-box superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g34230.1 : RING-H2 finger protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ82584
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G144966 - K02997: RP-S9e, small subunit ribosomal protein S9e
2 Sobic.001G303675 - -
3 Sobic.009G065100 splicing factor, putative, expressed K12850: pre-mRNA-splicing factor 38B
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5 Sobic.002G259800 hydroxyproline-rich glycoprotein family protein, putative, expressed -
6 Sobic.003G307000 RNA recognition motif containing protein, expressed K18667: activating signal cointegrator complex subunit 2
7 Sobic.001G454301 - -
8 Sobic.002G320500 MYB family transcription factor, putative, expressed -
9 Sobic.001G257300 OsFBL52 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
10 Sobic.001G246500 GTPase of unknown function domain containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.005G015900 dnaJ domain containing protein, expressed -
12 Sobic.004G158200 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
13 Sobic.005G013200 BAH domain containing protein, expressed -
14 Sobic.004G219100 phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit C, putative, expressed K03859: PIGC, phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit C
15 Sobic.002G151600 R-interacting factor 1, putative, expressed -
16 Sobic.006G039900 - -
17 Sobic.001G162300 KH domain containing protein, putative, expressed K13162: poly(rC)-binding protein 2
18 Sobic.003G197800 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed K12737: peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SDCCAG10
19 Sobic.001G206100 expressed protein -
20 Sobic.003G445400 vacuolar fusion protein MON1 homolog A, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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