Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G080200.1,Sobic.008G080200.4,Sobic.008G080200.2,Sobic.008G080200.3
Synonym Sb08g007590
Functional annotation leucine-rich repeat family protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5R5B7 , A0A1Z5R5C6 , A0A1Z5R5C2 , A0A1B6PCQ7
Pfam -
Panther DB PTHR24106 PTHR24106:SF146
NCBI CDD KOG1909; Ran GTPase-activating protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G20210 : RNI-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g12740.1 : leucine-rich repeat family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025035 , Zm00025a052593
Brachypodium KQJ91805
Barley HORVU2Hr1G016030.2 , HORVU2Hr1G016030.1
Wheat TraesCS2A02G096300 , TraesCS2A02G096300 , TraesCS2D02G094600
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G362200 DHHC zinc finger domain containing protein, expressed K18932: palmitoyltransferase
2 Sobic.001G003500 la domain containing protein, putative, expressed K18757: la-related protein 1
3 Sobic.001G226700 WD repeat-containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.006G032900 endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein, putative, expressed -
5 Sobic.001G222250 - -
6 Sobic.010G143800 expressed protein -
7 Sobic.003G144950 - -
8 Sobic.004G021200 expressed protein -
9 Sobic.004G033600 expressed protein -
10 Sobic.009G238850 - -
11 Sobic.008G051200 chaperone protein dnaJ, putative, expressed K03686: molecular chaperone DnaJ
12 Sobic.003G266001 - -
13 Sobic.001G431000 Sel1 repeat domain containing protein, putative, expressed K14026: SEL1, SEL1 protein
14 Sobic.004G246900 ankyrin repeat-containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.002G294800 cyclic nucleotide-gated ion channel, putative, expressed K05391: cyclic nucleotide gated channel, plant
16 Sobic.009G103600 MEE12, putative, expressed -
17 Sobic.010G007100 AAA family ATPase, putative, expressed K14571: RIX7, ribosome biogenesis ATPase
18 Sobic.002G134600 nucleic acid binding protein, putative, expressed -
19 Sobic.002G310200 expressed protein -
20 Sobic.005G027400 RNA recognition motif containing protein, expressed K13161: heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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