Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G109700.1
Synonym Sb03g009220
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XFN6
Pfam -
Panther DB PTHR37254
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G16520 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g01040.3 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a002493 , Zm00025a035380
Brachypodium KQK02799
Barley -
Wheat TraesCS3D02G086500 , TraesCS3B02G101600 , TraesCS3A02G086200
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.003G109700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G362200 DHHC zinc finger domain containing protein, expressed K18932: palmitoyltransferase
2 Sobic.010G056000 GAGA-binding protein, putative, expressed -
3 Sobic.006G032900 endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein, putative, expressed -
4 Sobic.008G125501 - -
5 Sobic.003G372800 expressed protein -
6 Sobic.010G028800 oxidoreductase, 2OG-Fe oxygenase family protein, putative, expressed -
7 Sobic.001G222250 - -
8 Sobic.001G267900 - -
9 Sobic.009G103600 MEE12, putative, expressed -
10 Sobic.001G102700 metalloendopeptidase/ metallopeptidase/ zinc ion binding protein, putative, expressed K01404: leishmanolysin
11 Sobic.004G021200 expressed protein -
12 Sobic.004G325400 cyclic nucleotide-gated ion channel 14, putative, expressed K05391: cyclic nucleotide gated channel, plant
13 Sobic.007G186900 PP2A regulatory subunit TAP46, putative, expressed -
14 Sobic.009G215800 OsFBX173 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.005G128400 NLI interacting factor-like phosphatase, putative, expressed K18999: RNA polymerase II C-terminal domain phosphatase-like 3/4
16 Sobic.002G134600 nucleic acid binding protein, putative, expressed -
17 Sobic.002G260900 protein kinase domain containing protein, expressed K13429: chitin elicitor receptor kinase 1
18 Sobic.009G083500 - -
19 Sobic.003G084900 expressed protein -
20 Sobic.001G111600 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic003G109700 Sobic003G109700 Sobic001G362200 Sobic001G362200 Sobic003G109700--Sobic001G362200 Sobic010G056000 Sobic010G056000 Sobic003G109700--Sobic010G056000 Sobic006G032900 Sobic006G032900 Sobic003G109700--Sobic006G032900 Sobic008G125501 Sobic008G125501 Sobic003G109700--Sobic008G125501 Sobic003G372800 Sobic003G372800 Sobic003G109700--Sobic003G372800 Sobic010G028800 Sobic010G028800 Sobic003G109700--Sobic010G028800 Sobic001G222250 Sobic001G222250 Sobic003G109700--Sobic001G222250 Sobic001G267900 Sobic001G267900 Sobic003G109700--Sobic001G267900 Sobic009G103600 Sobic009G103600 Sobic003G109700--Sobic009G103600 Sobic003G332500 Sobic003G332500 Sobic001G362200--Sobic003G332500 Sobic001G362200--Sobic003G109700 Sobic001G362200--Sobic006G032900 Sobic001G102700 Sobic001G102700 Sobic001G362200--Sobic001G102700 Sobic001G515000 Sobic001G515000 Sobic001G362200--Sobic001G515000 Sobic004G192200 Sobic004G192200 Sobic001G362200--Sobic004G192200 Sobic004G072100 Sobic004G072100 Sobic001G362200--Sobic004G072100 Sobic002G134600 Sobic002G134600 Sobic001G362200--Sobic002G134600 Sobic007G183900 Sobic007G183900 Sobic001G362200--Sobic007G183900 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic010G056000--Sobic001G111900 Sobic003G084900 Sobic003G084900 Sobic010G056000--Sobic003G084900 Sobic010G056000--Sobic010G028800 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic010G056000--Sobic009G127900 Sobic003G087400 Sobic003G087400 Sobic010G056000--Sobic003G087400 Sobic003G187400 Sobic003G187400 Sobic010G056000--Sobic003G187400 Sobic005G077466 Sobic005G077466 Sobic010G056000--Sobic005G077466 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic010G056000--Sobic001G094000 Sobic002G157300 Sobic002G157300 Sobic010G056000--Sobic002G157300 Sobic006G032900--Sobic001G362200 Sobic006G032900--Sobic003G109700 Sobic001G518400 Sobic001G518400 Sobic006G032900--Sobic001G518400 Sobic002G317300 Sobic002G317300 Sobic006G032900--Sobic002G317300 Sobic001G226700 Sobic001G226700 Sobic006G032900--Sobic001G226700 Sobic008G083000 Sobic008G083000 Sobic006G032900--Sobic008G083000 Sobic003G401100 Sobic003G401100 Sobic006G032900--Sobic003G401100 Sobic006G032900--Sobic001G102700 Sobic006G032900--Sobic009G103600 Sobic006G222300 Sobic006G222300 Sobic008G125501--Sobic006G222300 Sobic008G125600 Sobic008G125600 Sobic008G125501--Sobic008G125600 Sobic008G125501--Sobic003G109700 Sobic004G062800 Sobic004G062800 Sobic008G125501--Sobic004G062800 Sobic009G215800 Sobic009G215800 Sobic008G125501--Sobic009G215800 Sobic008G166300 Sobic008G166300 Sobic008G125501--Sobic008G166300 Sobic001G407200 Sobic001G407200 Sobic008G125501--Sobic001G407200 Sobic008G125501--Sobic010G028800 Sobic002G144933 Sobic002G144933 Sobic008G125501--Sobic002G144933 Sobic006G184500 Sobic006G184500 Sobic003G372800--Sobic006G184500 Sobic003G372800--Sobic003G109700 Sobic003G372800--Sobic002G134600 Sobic003G031800 Sobic003G031800 Sobic003G372800--Sobic003G031800 Sobic003G372800--Sobic001G362200 Sobic001G312900 Sobic001G312900 Sobic003G372800--Sobic001G312900 Sobic003G035100 Sobic003G035100 Sobic003G372800--Sobic003G035100 Sobic002G350600 Sobic002G350600 Sobic003G372800--Sobic002G350600 Sobic002G110300 Sobic002G110300 Sobic003G372800--Sobic002G110300 Sobic010G028800--Sobic003G084900 Sobic010G101800 Sobic010G101800 Sobic010G028800--Sobic010G101800 Sobic010G028800--Sobic010G056000 Sobic002G310200 Sobic002G310200 Sobic010G028800--Sobic002G310200 Sobic007G186900 Sobic007G186900 Sobic010G028800--Sobic007G186900 Sobic006G165000 Sobic006G165000 Sobic010G028800--Sobic006G165000 Sobic001G155000 Sobic001G155000 Sobic010G028800--Sobic001G155000 Sobic009G083500 Sobic009G083500 Sobic010G028800--Sobic009G083500 Sobic010G028800--Sobic001G407200 Sobic010G143800 Sobic010G143800 Sobic001G222250--Sobic010G143800 Sobic005G027400 Sobic005G027400 Sobic001G222250--Sobic005G027400 Sobic010G079900 Sobic010G079900 Sobic001G222250--Sobic010G079900 Sobic004G135300 Sobic004G135300 Sobic001G222250--Sobic004G135300 Sobic001G191600 Sobic001G191600 Sobic001G222250--Sobic001G191600 Sobic001G222250--Sobic003G109700 Sobic001G081200 Sobic001G081200 Sobic001G222250--Sobic001G081200 Sobic001G298600 Sobic001G298600 Sobic001G222250--Sobic001G298600 Sobic001G222250--Sobic001G362200 Sobic001G267900--Sobic010G056000 Sobic001G267900--Sobic006G165000 Sobic001G267900--Sobic003G084900 Sobic001G267900--Sobic010G028800 Sobic001G267900--Sobic001G518400 Sobic003G241200 Sobic003G241200 Sobic001G267900--Sobic003G241200 Sobic001G267900--Sobic001G094000 Sobic001G267900--Sobic006G222300 Sobic001G267900--Sobic001G362200 Sobic009G214200 Sobic009G214200 Sobic009G103600--Sobic009G214200 Sobic009G103600--Sobic003G109700 Sobic009G103600--Sobic006G032900 Sobic002G336800 Sobic002G336800 Sobic009G103600--Sobic002G336800 Sobic005G110475 Sobic005G110475 Sobic009G103600--Sobic005G110475 Sobic003G144950 Sobic003G144950 Sobic009G103600--Sobic003G144950 Sobic004G019500 Sobic004G019500 Sobic009G103600--Sobic004G019500 Sobic003G324100 Sobic003G324100 Sobic009G103600--Sobic003G324100 Sobic009G103600--Sobic009G215800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.