Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G083500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6P7C0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G222300 MBTB7 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
2 Sobic.010G136600 - -
3 Sobic.010G028800 oxidoreductase, 2OG-Fe oxygenase family protein, putative, expressed -
4 Sobic.007G065400 expressed protein K14400: pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11
5 Sobic.002G191800 - -
6 Sobic.003G372700 expressed protein -
7 Sobic.010G069100 expressed protein -
8 Sobic.003G170100 - -
9 Sobic.008G173900 "OsPPKL3(Ortholog in rice:Zhan et al., 2012)"(PubMedID : 31659913)@serine/threonine-protein phosphatase BSL2, putative, expressed -
10 Sobic.001G311500 N-acetylglucosaminyl transferase component, putative, expressed K03860: PIGQ, phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit Q
11 Sobic.003G084900 expressed protein -
12 Sobic.002G006900 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed -
13 Sobic.001G241200 protein kinase domain containing protein, expressed -
14 Sobic.002G309600 DNA-binding protein, putative, expressed K14326: UPF1, regulator of nonsense transcripts 1
15 Sobic.001G155000 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2, putative, expressed K03010: RPB2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2
16 Sobic.008G028700 SET domain containing protein, expressed -
17 Sobic.008G162900 peroxisome assembly protein, putative, expressed K06664: PEX2, peroxin-2
18 Sobic.001G222500 pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, putative, expressed K14442: DHX36, ATP-dependent RNA helicase DHX36
19 Sobic.008G047800 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K15361: WDR48, WD repeat-containing protein 48
20 Sobic.001G083400 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic009G083500 Sobic009G083500 Sobic006G222300 Sobic006G222300 Sobic009G083500--Sobic006G222300 Sobic010G136600 Sobic010G136600 Sobic009G083500--Sobic010G136600 Sobic010G028800 Sobic010G028800 Sobic009G083500--Sobic010G028800 Sobic007G065400 Sobic007G065400 Sobic009G083500--Sobic007G065400 Sobic002G191800 Sobic002G191800 Sobic009G083500--Sobic002G191800 Sobic003G372700 Sobic003G372700 Sobic009G083500--Sobic003G372700 Sobic010G069100 Sobic010G069100 Sobic009G083500--Sobic010G069100 Sobic003G170100 Sobic003G170100 Sobic009G083500--Sobic003G170100 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic009G083500--Sobic008G173900 Sobic006G222300--Sobic009G083500 Sobic001G311500 Sobic001G311500 Sobic006G222300--Sobic001G311500 Sobic007G159900 Sobic007G159900 Sobic006G222300--Sobic007G159900 Sobic004G096500 Sobic004G096500 Sobic006G222300--Sobic004G096500 Sobic006G222300--Sobic010G136600 Sobic006G222300--Sobic010G028800 Sobic009G086900 Sobic009G086900 Sobic006G222300--Sobic009G086900 Sobic001G241200 Sobic001G241200 Sobic006G222300--Sobic001G241200 Sobic002G264200 Sobic002G264200 Sobic006G222300--Sobic002G264200 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic010G136600--Sobic007G096600 Sobic004G145500 Sobic004G145500 Sobic010G136600--Sobic004G145500 Sobic002G144933 Sobic002G144933 Sobic010G136600--Sobic002G144933 Sobic010G136600--Sobic008G173900 Sobic008G028700 Sobic008G028700 Sobic010G136600--Sobic008G028700 Sobic009G126400 Sobic009G126400 Sobic010G136600--Sobic009G126400 Sobic010G277500 Sobic010G277500 Sobic010G136600--Sobic010G277500 Sobic009G210500 Sobic009G210500 Sobic010G136600--Sobic009G210500 Sobic004G009600 Sobic004G009600 Sobic010G136600--Sobic004G009600 Sobic003G084900 Sobic003G084900 Sobic010G028800--Sobic003G084900 Sobic010G101800 Sobic010G101800 Sobic010G028800--Sobic010G101800 Sobic010G056000 Sobic010G056000 Sobic010G028800--Sobic010G056000 Sobic002G310200 Sobic002G310200 Sobic010G028800--Sobic002G310200 Sobic007G186900 Sobic007G186900 Sobic010G028800--Sobic007G186900 Sobic006G165000 Sobic006G165000 Sobic010G028800--Sobic006G165000 Sobic001G155000 Sobic001G155000 Sobic010G028800--Sobic001G155000 Sobic010G028800--Sobic009G083500 Sobic001G407200 Sobic001G407200 Sobic010G028800--Sobic001G407200 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic007G065400--Sobic002G006900 Sobic007G065400--Sobic002G191800 Sobic008G009700 Sobic008G009700 Sobic007G065400--Sobic008G009700 Sobic009G040600 Sobic009G040600 Sobic007G065400--Sobic009G040600 Sobic007G065400--Sobic004G145500 Sobic007G065400--Sobic009G210500 Sobic003G119000 Sobic003G119000 Sobic007G065400--Sobic003G119000 Sobic007G065400--Sobic003G372700 Sobic007G065400--Sobic008G028700 Sobic002G191800--Sobic007G065400 Sobic002G191800--Sobic003G372700 Sobic002G180666 Sobic002G180666 Sobic002G191800--Sobic002G180666 Sobic002G191800--Sobic002G006900 Sobic010G201500 Sobic010G201500 Sobic002G191800--Sobic010G201500 Sobic002G191800--Sobic001G241200 Sobic002G191800--Sobic007G096600 Sobic002G191800--Sobic010G277500 Sobic002G191800--Sobic003G119000 Sobic003G372700--Sobic002G006900 Sobic003G372700--Sobic003G119000 Sobic003G372700--Sobic007G065400 Sobic005G112300 Sobic005G112300 Sobic003G372700--Sobic005G112300 Sobic003G372700--Sobic002G191800 Sobic003G372700--Sobic009G040600 Sobic002G309600 Sobic002G309600 Sobic003G372700--Sobic002G309600 Sobic003G280800 Sobic003G280800 Sobic003G372700--Sobic003G280800 Sobic001G474600 Sobic001G474600 Sobic003G372700--Sobic001G474600 Sobic002G071500 Sobic002G071500 Sobic010G069100--Sobic002G071500 Sobic010G069100--Sobic002G264200 Sobic010G069100--Sobic005G112300 Sobic008G047800 Sobic008G047800 Sobic010G069100--Sobic008G047800 Sobic010G069100--Sobic008G009700 Sobic001G154900 Sobic001G154900 Sobic010G069100--Sobic001G154900 Sobic004G146500 Sobic004G146500 Sobic010G069100--Sobic004G146500 Sobic010G069100--Sobic007G065400 Sobic009G005500 Sobic009G005500 Sobic010G069100--Sobic009G005500 Sobic005G110472 Sobic005G110472 Sobic003G170100--Sobic005G110472 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic003G170100--Sobic003G268300 Sobic003G200200 Sobic003G200200 Sobic003G170100--Sobic003G200200 Sobic003G170100--Sobic007G096600 Sobic003G170100--Sobic002G144933 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic003G170100--Sobic002G157000 Sobic001G152320 Sobic001G152320 Sobic003G170100--Sobic001G152320 Sobic007G137900 Sobic007G137900 Sobic003G170100--Sobic007G137900 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic003G170100--Sobic001G162300 Sobic008G173900--Sobic002G157000 Sobic008G173900--Sobic002G144933 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic008G173900--Sobic001G420200 Sobic008G173900--Sobic003G268300 Sobic008G054500 Sobic008G054500 Sobic008G173900--Sobic008G054500 Sobic008G173900--Sobic003G200200 Sobic001G274200 Sobic001G274200 Sobic008G173900--Sobic001G274200 Sobic001G413500 Sobic001G413500 Sobic008G173900--Sobic001G413500 Sobic008G173900--Sobic007G096600
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