Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G166000.3,Sobic.010G166000.1,Sobic.010G166000.2
Synonym Sb10g021940, ESP1
Functional annotation ESP1, putative, expressed
UniProt C5Z4K9 , A0A1W0VTE3 , C5Z4K6
Pfam PF14304 PF14327 PF14327
Panther DB PTHR23139 PTHR23139:SF54
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G73840 : hydroxyproline-rich glycoprotein family protein,cleavage stimulating factor 64
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g43780.1 : ESP1, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a044211
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G158700 TATA binding protein-associated factor, putative, expressed K03131: transcription initiation factor TFIID subunit 6
2 Sobic.008G149800 histone acetyltransferase HAC5, putative, expressed K04498: EP300, CREBBP, E1A/CREB-binding protein
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7 Sobic.009G100050 - -
8 Sobic.006G165000 RNA recognition motif containing protein, expressed -
9 Sobic.005G015100 OsFBX291 - F-box domain containing protein, expressed -
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11 Sobic.007G061700 vacuolar protein sorting-associated protein 18, putative, expressed -
12 Sobic.003G084900 expressed protein -
13 Sobic.001G222500 pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, putative, expressed K14442: DHX36, ATP-dependent RNA helicase DHX36
14 Sobic.002G144966 - K02997: RP-S9e, small subunit ribosomal protein S9e
15 Sobic.002G396000 XPA-binding protein 2, putative, expressed K12867: SYF1, pre-mRNA-splicing factor SYF1
16 Sobic.009G126600 cyclin-dependent kinase D-1, putative, expressed K02202: cyclin-dependent kinase 7
17 Sobic.010G136600 - -
18 Sobic.001G303675 - -
19 Sobic.005G154500 OsFBX407 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.001G094000 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic010G166000 Sobic010G166000 Sobic002G158700 Sobic002G158700 Sobic010G166000--Sobic002G158700 Sobic008G149800 Sobic008G149800 Sobic010G166000--Sobic008G149800 Sobic001G296500 Sobic001G296500 Sobic010G166000--Sobic001G296500 Sobic003G401000 Sobic003G401000 Sobic010G166000--Sobic003G401000 Sobic008G011100 Sobic008G011100 Sobic010G166000--Sobic008G011100 Sobic004G219100 Sobic004G219100 Sobic010G166000--Sobic004G219100 Sobic009G100050 Sobic009G100050 Sobic010G166000--Sobic009G100050 Sobic006G165000 Sobic006G165000 Sobic010G166000--Sobic006G165000 Sobic005G015100 Sobic005G015100 Sobic010G166000--Sobic005G015100 Sobic002G158700--Sobic003G401000 Sobic001G464200 Sobic001G464200 Sobic002G158700--Sobic001G464200 Sobic001G167200 Sobic001G167200 Sobic002G158700--Sobic001G167200 Sobic004G031700 Sobic004G031700 Sobic002G158700--Sobic004G031700 Sobic003G445400 Sobic003G445400 Sobic002G158700--Sobic003G445400 Sobic007G000800 Sobic007G000800 Sobic002G158700--Sobic007G000800 Sobic007G061700 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Octagon: transcription factors


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