Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G015800.4,Sobic.009G015800.3,Sobic.009G015800.1
Synonym Sb09g001510
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6P5Y3 , A0A1B6P5Z5
Pfam -
Panther DB PTHR34952
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G53670 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g02260.2 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a035414 , Zm00025a008252 , Zm00025a049264 , Zm00025a040910
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.009G015800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G015100 OsFBX291 - F-box domain containing protein, expressed -
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17 Sobic.003G442000 IPP transferase, putative, expressed K00791: miaA, tRNA dimethylallyltransferase
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19 Sobic.004G271900 RMD5 homolog A, putative, expressed -
20 Sobic.008G034600 protein kinase PKN/PRK1, effector, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G015800 Sobic009G015800 Sobic005G015100 Sobic005G015100 Sobic009G015800--Sobic005G015100 Sobic009G225200 Sobic009G225200 Sobic009G015800--Sobic009G225200 Sobic002G259800 Sobic002G259800 Sobic009G015800--Sobic002G259800 Sobic002G158700 Sobic002G158700 Sobic009G015800--Sobic002G158700 Sobic002G421700 Sobic002G421700 Sobic009G015800--Sobic002G421700 Sobic001G087100 Sobic001G087100 Sobic009G015800--Sobic001G087100 Sobic004G232000 Sobic004G232000 Sobic009G015800--Sobic004G232000 Sobic005G015900 Sobic005G015900 Sobic009G015800--Sobic005G015900 Sobic001G315100 Sobic001G315100 Sobic009G015800--Sobic001G315100 Sobic002G051450 Sobic002G051450 Sobic005G015100--Sobic002G051450 Sobic008G034600 Sobic008G034600 Sobic005G015100--Sobic008G034600 Sobic005G015100--Sobic002G158700 Sobic001G464200 Sobic001G464200 Sobic005G015100--Sobic001G464200 Sobic006G128900 Sobic006G128900 Sobic005G015100--Sobic006G128900 Sobic006G145000 Sobic006G145000 Sobic005G015100--Sobic006G145000 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Sobic001G315100--Sobic001G176200 Sobic003G081000 Sobic003G081000 Sobic001G315100--Sobic003G081000 Sobic003G241200 Sobic003G241200 Sobic001G315100--Sobic003G241200 Sobic004G057400 Sobic004G057400 Sobic001G315100--Sobic004G057400
Octagon: transcription factors


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