Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G517200.3,Sobic.001G517200.2
Synonym Sb01g048240
Functional annotation tRNA nucleotidyltransferase/polyA polymerase family protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5SBL3 , A0A1Z5SBS6
Pfam PF12627 PF01743 PF01743 PF12627
Panther DB PTHR13734:SF48 PTHR13734
NCBI CDD KOG2159; tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003723; RNA binding GO:0006396RNA processing GO:0016779nucleotidyltransferase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G17580 : Polynucleotide adenylyltransferase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g03930.2,LOC_Os03g03930.1 : tRNA nucleotidyltransferase/polyA polymerase family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a000447
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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17 Sobic.004G027400 - -
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20 Sobic.001G372800 nucleolar protein NOP5-1, putative, expressed K14565: nucleolar protein 58


Gene co-expression network
sample Sobic001G517200 Sobic001G517200 Sobic007G187900 Sobic007G187900 Sobic001G517200--Sobic007G187900 Sobic003G368901 Sobic003G368901 Sobic001G517200--Sobic003G368901 Sobic010G063566 Sobic010G063566 Sobic001G517200--Sobic010G063566 Sobic010G015700 Sobic010G015700 Sobic001G517200--Sobic010G015700 Sobic005G028100 Sobic005G028100 Sobic001G517200--Sobic005G028100 Sobic003G189333 Sobic003G189333 Sobic001G517200--Sobic003G189333 Sobic009G145101 Sobic009G145101 Sobic001G517200--Sobic009G145101 Sobic002G105101 Sobic002G105101 Sobic001G517200--Sobic002G105101 Sobic003G002700 Sobic003G002700 Sobic001G517200--Sobic003G002700 Sobic003G408300 Sobic003G408300 Sobic007G187900--Sobic003G408300 Sobic007G187900--Sobic001G517200 Sobic009G105900 Sobic009G105900 Sobic007G187900--Sobic009G105900 Sobic003G235000 Sobic003G235000 Sobic007G187900--Sobic003G235000 Sobic002G429400 Sobic002G429400 Sobic007G187900--Sobic002G429400 Sobic003G006400 Sobic003G006400 Sobic007G187900--Sobic003G006400 Sobic002G429700 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Octagon: transcription factors


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