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Transcriptome id Sobic.002G416150.1
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UniProt A0A1W0W7U8
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G116500 expressed protein -
2 Sobic.006G088400 OsFBX135 - F-box domain containing protein, expressed -
3 Sobic.001G264201 - -
4 Sobic.005G120600 Highest expression level in embryo(PubMedID : 27501690)@OsSPL19 - SBP-box gene family member, expressed -
5 Sobic.005G139300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@amidase, putative, expressed -
6 Sobic.004G353400 leucine-rich repeat-containing protein 40, putative, expressed -
7 Sobic.009G224300 expressed protein -
8 Sobic.010G221200 neurochondrin family protein, putative, expressed -
9 Sobic.009G155900 hhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein, expressed -
10 Sobic.001G268700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@lysosomal alpha-mannosidase precursor, putative, expressed K01191: alpha-mannosidase
11 Sobic.010G114100 nucleolar complex protein 2, putative, expressed -
12 Sobic.008G090300 - -
13 Sobic.002G127900 ELMO/CED-12 family protein, putative, expressed K08869: ADCK, aarF domain-containing kinase
14 Sobic.003G368901 - -
15 Sobic.002G284400 peroxisomal multifunctional enzyme type 2, putative, expressed -
16 Sobic.009G053101 - -
17 Sobic.003G147500 PHS1, putative, expressed K14165: atypical dual specificity phosphatase
18 Sobic.005G138000 zinc knuckle domain containing protein, expressed -
19 Sobic.004G286250 - -
20 Sobic.007G082000 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein


Gene co-expression network
sample Sobic002G416150 Sobic002G416150 Sobic004G116500 Sobic004G116500 Sobic002G416150--Sobic004G116500 Sobic006G088400 Sobic006G088400 Sobic002G416150--Sobic006G088400 Sobic001G264201 Sobic001G264201 Sobic002G416150--Sobic001G264201 Sobic005G120600 Sobic005G120600 Sobic002G416150--Sobic005G120600 Sobic005G139300 Sobic005G139300 Sobic002G416150--Sobic005G139300 Sobic004G353400 Sobic004G353400 Sobic002G416150--Sobic004G353400 Sobic009G224300 Sobic009G224300 Sobic002G416150--Sobic009G224300 Sobic010G221200 Sobic010G221200 Sobic002G416150--Sobic010G221200 Sobic009G155900 Sobic009G155900 Sobic002G416150--Sobic009G155900 Sobic004G116500--Sobic005G120600 Sobic004G116500--Sobic010G221200 Sobic004G248700 Sobic004G248700 Sobic004G116500--Sobic004G248700 Sobic004G116500--Sobic002G416150 Sobic001G268700 Sobic001G268700 Sobic004G116500--Sobic001G268700 Sobic004G289500 Sobic004G289500 Sobic004G116500--Sobic004G289500 Sobic006G269600 Sobic006G269600 Sobic004G116500--Sobic006G269600 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Sobic009G155900--Sobic002G429700 Sobic009G155900--Sobic009G224300 Sobic005G138000 Sobic005G138000 Sobic009G155900--Sobic005G138000 Sobic009G155900--Sobic004G248700 Sobic003G434300 Sobic003G434300 Sobic009G155900--Sobic003G434300 Sobic009G155900--Sobic002G266300
Octagon: transcription factors


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