Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G284400.5,Sobic.002G284400.2,Sobic.002G284400.1,Sobic.002G284400.4,Sobic.002G284400.8,Sobic.002G284400.6,Sobic.002G284400.7
Synonym ATECH2, Sb02g031680, ECH2
Functional annotation peroxisomal multifunctional enzyme type 2, putative, expressed
UniProt A0A1W0W628 , A0A1W0W638 , A0A1W0W652 , A0A1W0W626 , A0A1B6QDV8 , A0A1B6QDW9 , A0A1B6QDW1
Pfam PF13452 PF01575 PF13452 PF01575
Panther DB PTHR13078
NCBI CDD KOG1206; Peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein and related enzymes
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G76150 : enoyl-CoA hydratase 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g37280.1,LOC_Os09g37280.2 : peroxisomal multifunctional enzyme type 2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a047993 , Zm00025a057932 , Zm00025a057863 , Zm00025a014492
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G264201 - -
2 Sobic.010G013500 growth-regulating factor, putative, expressed -
3 Sobic.009G105400 OsFBX135 - F-box domain containing protein, expressed -
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7 Sobic.006G281900 down-regulated TF in developmental senescence(PubMedID : 27586543)@no apical meristem protein, putative, expressed -
8 Sobic.001G242500 - -
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10 Sobic.002G416150 - -
11 Sobic.010G175000 expressed protein -
12 Sobic.004G199200 expressed protein K10858: DNA mismatch repair protein PMS2
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18 Sobic.002G095300 deoxynucleoside kinase family, putative, expressed K00893: deoxycitidine kinase
19 Sobic.003G290400 glucan endo-1,3-beta-glucosidase precursor, putative, expressed -
20 Sobic.009G002200 formin-like protein 1 precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G284400 Sobic002G284400 Sobic001G264201 Sobic001G264201 Sobic002G284400--Sobic001G264201 Sobic010G013500 Sobic010G013500 Sobic002G284400--Sobic010G013500 Sobic009G105400 Sobic009G105400 Sobic002G284400--Sobic009G105400 Sobic006G262501 Sobic006G262501 Sobic002G284400--Sobic006G262501 Sobic001G033900 Sobic001G033900 Sobic002G284400--Sobic001G033900 Sobic008G118100 Sobic008G118100 Sobic002G284400--Sobic008G118100 Sobic006G281900 Sobic006G281900 Sobic002G284400--Sobic006G281900 Sobic001G242500 Sobic001G242500 Sobic002G284400--Sobic001G242500 Sobic003G236150 Sobic003G236150 Sobic002G284400--Sobic003G236150 Sobic001G264201--Sobic006G281900 Sobic001G264201--Sobic009G105400 Sobic004G199200 Sobic004G199200 Sobic001G264201--Sobic004G199200 Sobic010G175000 Sobic010G175000 Sobic001G264201--Sobic010G175000 Sobic001G264201--Sobic002G284400 Sobic006G084300 Sobic006G084300 Sobic001G264201--Sobic006G084300 Sobic002G416150 Sobic002G416150 Sobic001G264201--Sobic002G416150 Sobic008G090000 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Sobic003G236150--Sobic001G264201 Sobic003G290400 Sobic003G290400 Sobic003G236150--Sobic003G290400
Octagon: transcription factors


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