Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G242500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QKQ4
Pfam PF02037
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a006874 , Zm00025a006870
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G118100 kelch repeat protein, putative, expressed -
2 Sobic.003G188600 expressed protein -
3 Sobic.008G090400 - -
4 Sobic.010G087100 MCM9 - Putative minichromosome maintenance MCM family subunit 9, expressed K10738: DNA helicase MCM9
5 Sobic.006G281900 down-regulated TF in developmental senescence(PubMedID : 27586543)@no apical meristem protein, putative, expressed -
6 Sobic.002G317700 BNR/Asp-box repeat family protein, putative, expressed -
7 Sobic.004G190500 sucrose transporters("PubMedID : 27986867,PubMedID : 23805151")@Sucrose transporter genes(PubMedID : 24456189)@Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@sucrose transporter BoSUT1, putative, expressed K15378: solute carrier family 45, member 1/2/4
8 Sobic.007G187700 retinoblastoma-related protein-like, putative, expressed K04681: retinoblastoma-like protein 1
9 Sobic.001G377700 expressed protein K10895: fanconi anemia group I protein
10 Sobic.002G021200 expressed protein K19001: HELLS, ATP-dependent DNA helicase
11 Sobic.010G190800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@DUF1680 domain containing protein, putative, expressed K09955: uncharacterized protein
12 Sobic.007G121650 - -
13 Sobic.004G078500 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
14 Sobic.004G238801 - -
15 Sobic.002G168000 expressed protein -
16 Sobic.003G370300 GPI transamidase subunit PIG-U domain containing protein, expressed K10879: DNA-repair protein XRCC2
17 Sobic.002G215200 lung seven transmembrane domain containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.005G157300 protein binding protein, putative, expressed -
19 Sobic.004G321400 BRUSHY 1, putative, expressed -
20 Sobic.006G262501 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G242500 Sobic001G242500 Sobic008G118100 Sobic008G118100 Sobic001G242500--Sobic008G118100 Sobic003G188600 Sobic003G188600 Sobic001G242500--Sobic003G188600 Sobic008G090400 Sobic008G090400 Sobic001G242500--Sobic008G090400 Sobic010G087100 Sobic010G087100 Sobic001G242500--Sobic010G087100 Sobic006G281900 Sobic006G281900 Sobic001G242500--Sobic006G281900 Sobic002G317700 Sobic002G317700 Sobic001G242500--Sobic002G317700 Sobic004G190500 Sobic004G190500 Sobic001G242500--Sobic004G190500 Sobic007G187700 Sobic007G187700 Sobic001G242500--Sobic007G187700 Sobic001G377700 Sobic001G377700 Sobic001G242500--Sobic001G377700 Sobic007G050800 Sobic007G050800 Sobic008G118100--Sobic007G050800 Sobic002G187600 Sobic002G187600 Sobic008G118100--Sobic002G187600 Sobic004G286200 Sobic004G286200 Sobic008G118100--Sobic004G286200 Sobic008G118100--Sobic006G281900 Sobic009G225500 Sobic009G225500 Sobic008G118100--Sobic009G225500 Sobic002G095300 Sobic002G095300 Sobic008G118100--Sobic002G095300 Sobic009G002200 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Octagon: transcription factors


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