Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G179900.1,Sobic.001G179900.2
Synonym DCL2, ATDCL2
Functional annotation DCL2, putative, expressed
UniProt A0A1B6QJK2 , A0A1Z5S699
Pfam PF00035 PF00636
Panther DB PTHR14950 PTHR14950:SF19
NCBI CDD -
KEGG Orthology K11592; DICER1, endoribonuclease Dicer
Gene Ontology GO:0006396; RNA processing GO:0004525ribonuclease III activity GO:0003723RNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G03300 : dicer-like 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g38740.1 : Dicer, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a017365
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G019300.11 , HORVU5Hr1G019300.16 , HORVU5Hr1G019300.17 , HORVU5Hr1G019300.8 , HORVU5Hr1G019300.9 , HORVU5Hr1G019300.3 , HORVU5Hr1G019300.1 , HORVU5Hr1G019300.7 , HORVU5Hr1G019300.4 , HORVU5Hr1G019300.5 , HORVU5Hr1G019300.19 , HORVU5Hr1G019300.10 , HORVU5Hr1G019300.13 , HORVU5Hr1G019300.14 , HORVU5Hr1G019300.15 , HORVU5Hr1G019300.20 , HORVU5Hr1G019300.23 , HORVU5Hr1G019300.22
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G179900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G217200 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
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3 Sobic.007G116400 - -
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8 Sobic.009G239351 - -
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12 Sobic.007G185900 IBR domain containing protein, putative, expressed K11968: ariadne-1
13 Sobic.002G177400 expressed protein -
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15 Sobic.008G129700 PAPA-1-like conserved region family protein, expressed K11666: INO80B, ZNHIT4, INO80 complex subunit B
16 Sobic.009G104300 - -
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19 Sobic.002G043500 aldehyde oxidase, putative, expressed K09842: abscisic-aldehyde oxidase
20 Sobic.006G269600 zinc finger, RING-type, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G179900 Sobic001G179900 Sobic006G217200 Sobic006G217200 Sobic001G179900--Sobic006G217200 Sobic001G454301 Sobic001G454301 Sobic001G179900--Sobic001G454301 Sobic007G116400 Sobic007G116400 Sobic001G179900--Sobic007G116400 Sobic004G088400 Sobic004G088400 Sobic001G179900--Sobic004G088400 Sobic002G140800 Sobic002G140800 Sobic001G179900--Sobic002G140800 Sobic010G153466 Sobic010G153466 Sobic001G179900--Sobic010G153466 Sobic003G336800 Sobic003G336800 Sobic001G179900--Sobic003G336800 Sobic009G239351 Sobic009G239351 Sobic001G179900--Sobic009G239351 Sobic009G239301 Sobic009G239301 Sobic001G179900--Sobic009G239301 Sobic006G217200--Sobic001G454301 Sobic002G421700 Sobic002G421700 Sobic006G217200--Sobic002G421700 Sobic005G133500 Sobic005G133500 Sobic006G217200--Sobic005G133500 Sobic002G259800 Sobic002G259800 Sobic006G217200--Sobic002G259800 Sobic007G000800 Sobic007G000800 Sobic006G217200--Sobic007G000800 Sobic003G239900 Sobic003G239900 Sobic006G217200--Sobic003G239900 Sobic009G151200 Sobic009G151200 Sobic006G217200--Sobic009G151200 Sobic005G009200 Sobic005G009200 Sobic006G217200--Sobic005G009200 Sobic006G013500 Sobic006G013500 Sobic006G217200--Sobic006G013500 Sobic001G454301--Sobic007G116400 Sobic001G454301--Sobic002G421700 Sobic008G117200 Sobic008G117200 Sobic001G454301--Sobic008G117200 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic001G454301--Sobic001G094000 Sobic009G104300 Sobic009G104300 Sobic001G454301--Sobic009G104300 Sobic001G454301--Sobic009G239351 Sobic001G303675 Sobic001G303675 Sobic001G454301--Sobic001G303675 Sobic001G454301--Sobic002G140800 Sobic001G454301--Sobic006G217200 Sobic007G116400--Sobic001G094000 Sobic007G116400--Sobic001G454301 Sobic007G116400--Sobic009G104300 Sobic008G068800 Sobic008G068800 Sobic007G116400--Sobic008G068800 Sobic007G116400--Sobic008G117200 Sobic006G080300 Sobic006G080300 Sobic007G116400--Sobic006G080300 Sobic004G169501 Sobic004G169501 Sobic007G116400--Sobic004G169501 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic007G116400--Sobic001G477800 Sobic007G116400--Sobic009G239351 Sobic002G177400 Sobic002G177400 Sobic004G088400--Sobic002G177400 Sobic007G008800 Sobic007G008800 Sobic004G088400--Sobic007G008800 Sobic004G088400--Sobic003G336800 Sobic004G088400--Sobic008G117200 Sobic003G026300 Sobic003G026300 Sobic004G088400--Sobic003G026300 Sobic003G346000 Sobic003G346000 Sobic004G088400--Sobic003G346000 Sobic008G129700 Sobic008G129700 Sobic004G088400--Sobic008G129700 Sobic004G088400--Sobic007G116400 Sobic009G030300 Sobic009G030300 Sobic004G088400--Sobic009G030300 Sobic002G140800--Sobic001G454301 Sobic003G128600 Sobic003G128600 Sobic002G140800--Sobic003G128600 Sobic002G140800--Sobic004G169501 Sobic002G140800--Sobic007G116400 Sobic002G140800--Sobic004G088400 Sobic002G050500 Sobic002G050500 Sobic002G140800--Sobic002G050500 Sobic010G139301 Sobic010G139301 Sobic002G140800--Sobic010G139301 Sobic002G140800--Sobic008G117200 Sobic009G059600 Sobic009G059600 Sobic002G140800--Sobic009G059600 Sobic010G153466--Sobic001G454301 Sobic010G153466--Sobic009G239301 Sobic006G252000 Sobic006G252000 Sobic010G153466--Sobic006G252000 Sobic010G153466--Sobic006G013500 Sobic010G153466--Sobic007G116400 Sobic010G153466--Sobic006G217200 Sobic002G181450 Sobic002G181450 Sobic010G153466--Sobic002G181450 Sobic010G153466--Sobic002G421700 Sobic010G153466--Sobic009G239351 Sobic003G336800--Sobic004G088400 Sobic003G336800--Sobic008G129700 Sobic002G061400 Sobic002G061400 Sobic003G336800--Sobic002G061400 Sobic010G174800 Sobic010G174800 Sobic003G336800--Sobic010G174800 Sobic001G296500 Sobic001G296500 Sobic003G336800--Sobic001G296500 Sobic010G202600 Sobic010G202600 Sobic003G336800--Sobic010G202600 Sobic010G199800 Sobic010G199800 Sobic003G336800--Sobic010G199800 Sobic006G128800 Sobic006G128800 Sobic003G336800--Sobic006G128800 Sobic003G336800--Sobic007G008800 Sobic009G239351--Sobic007G116400 Sobic009G239351--Sobic001G454301 Sobic009G239351--Sobic009G239301 Sobic006G210200 Sobic006G210200 Sobic009G239351--Sobic006G210200 Sobic009G239351--Sobic009G104300 Sobic009G239351--Sobic001G094000 Sobic003G170100 Sobic003G170100 Sobic009G239351--Sobic003G170100 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic009G239351--Sobic001G162300 Sobic009G239351--Sobic001G303675 Sobic009G239301--Sobic009G239351 Sobic009G239301--Sobic001G454301 Sobic009G239301--Sobic010G153466 Sobic007G046900 Sobic007G046900 Sobic009G239301--Sobic007G046900 Sobic009G239301--Sobic006G252000 Sobic009G239301--Sobic006G210200 Sobic009G239301--Sobic007G116400 Sobic009G239301--Sobic006G217200 Sobic009G239301--Sobic006G013500
Octagon: transcription factors


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